173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2622 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2622  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  100 
 
 		 603 aa  1210    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0046  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  44.66 
 
 		 605 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0046  CBS domain-containing protein  44.98 
 
 		 605 aa  497  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.689982  normal  0.0185592 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0537  CBS domain-containing protein  38.98 
 
 		 609 aa  443  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0634  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  40.63 
 
 		 604 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0507059  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2504  CBS domain-containing protein  38.76 
 
 		 612 aa  405  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000127678 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0450  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  40 
 
 		 608 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.307047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0480  cyclic nucleotide-binding protein  37.38 
 
 		 608 aa  389  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0827  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  36.06 
 
 		 601 aa  389  1e-107  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000971693  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5960  CBS domain-containing protein  40 
 
 		 617 aa  388  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1119  signal-transduction protein  37.15 
 
 		 615 aa  376  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0466  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  38.18 
 
 		 608 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.181434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0873  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  35.44 
 
 		 605 aa  360  4e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.563434  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2831  putative nucleotidyltransferases  32.08 
 
 		 610 aa  355  8.999999999999999e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22370  hypothetical protein  36.26 
 
 		 599 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000015085 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2693  hypothetical protein  32.63 
 
 		 607 aa  352  1e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1543  putative signal-transduction protein with CBS domains  34.51 
 
 		 600 aa  344  2.9999999999999997e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00292919  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00167  cyclic nucleotide binding protein  32.25 
 
 		 608 aa  342  1e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1453  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.93 
 
 		 604 aa  342  2e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1892  hypothetical protein  35.6 
 
 		 599 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3783  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.59 
 
 		 603 aa  326  9e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.612784  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002201  predicted signal-transduction protein  32.1 
 
 		 561 aa  322  9.999999999999999e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5110  signal-transduction protein  39.58 
 
 		 485 aa  321  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2430  signal-transduction protein  38.9 
 
 		 565 aa  315  1.9999999999999998e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.15974  normal  0.429408 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0438  signal-transduction protein  31.55 
 
 		 647 aa  305  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0392  nucleotidyltransferase  30.75 
 
 		 652 aa  280  7e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00832974 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0554  signal-transduction protein  31.89 
 
 		 681 aa  232  2e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000263735 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4954  CBS domain-containing protein  27.6 
 
 		 624 aa  228  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  31.17 
 
 		 623 aa  224  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3713  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.48 
 
 		 613 aa  222  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000235103  unclonable  0.0000000288509 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0051  cyclic nucleotide-binding protein  27.41 
 
 		 629 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003141  Signal transduction protein  26.93 
 
 		 629 aa  221  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1043  cyclic nucleotide-binding protein  27.63 
 
 		 624 aa  221  3.9999999999999997e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2007  CBS domain-containing protein  30.22 
 
 		 623 aa  220  6e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232416  decreased coverage  0.00139706 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  27.12 
 
 		 618 aa  219  7.999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1034  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  27.84 
 
 		 660 aa  218  4e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01888  hypothetical protein  26.96 
 
 		 629 aa  216  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0910  hypothetical protein  27.32 
 
 		 637 aa  215  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.529281  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1266  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  27.77 
 
 		 649 aa  214  4.9999999999999996e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1296  hypothetical protein  28.34 
 
 		 601 aa  212  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.922257  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1584  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.97 
 
 		 606 aa  210  6e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  25.28 
 
 		 626 aa  207  3e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  28.41 
 
 		 614 aa  205  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  28.02 
 
 		 615 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2321  nucleotidyltransferase  24.51 
 
 		 627 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.477711  hitchhiker  0.00895935 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4543  CBS domain-containing protein  27.61 
 
 		 639 aa  200  7.999999999999999e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.661781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0554  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  27.59 
 
 		 637 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1009  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.19 
 
 		 649 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.959275  normal  0.0476299 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1524  CBS domain-containing protein  28.48 
 
 		 618 aa  197  6e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1304  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  26.17 
 
 		 650 aa  196  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333083  normal  0.600467 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1811  cyclic nucleotide-binding protein  23.93 
 
 		 625 aa  196  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  27.16 
 
 		 615 aa  196  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000925  Signal transduction protein  25.48 
 
 		 622 aa  195  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.334534  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  27.32 
 
 		 615 aa  194  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0837  cyclic nucleotide-binding protein  25.97 
 
 		 629 aa  194  4e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  25.98 
 
 		 625 aa  194  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3131  cyclic nucleotide-binding domain (cNMP-BD) protein  26.98 
 
 		 633 aa  193  7e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  26.97 
 
 		 615 aa  192  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0967  nucleotidyltransferase  25.2 
 
 		 641 aa  192  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.151654 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  28.81 
 
 		 606 aa  192  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  28.64 
 
 		 606 aa  191  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  26.66 
 
 		 615 aa  189  9e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.61 
 
 		 478 aa  188  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  26.25 
 
 		 615 aa  187  4e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25.67 
 
 		 615 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  25.67 
 
 		 615 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  25.67 
 
 		 615 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1576  cyclic nucleotide-binding protein  25.53 
 
 		 620 aa  184  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132625 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0506  CBS domain-containing protein  27.53 
 
 		 606 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413474  normal  0.25412 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  25.67 
 
 		 615 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1515  cyclic nucleotide-binding protein  25.7 
 
 		 620 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0149843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1582  cyclic nucleotide-binding protein  25.7 
 
 		 620 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0380043 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2113  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  28.3 
 
 		 644 aa  183  8.000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0302  signal-transduction protein  25.91 
 
 		 648 aa  183  1e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1022  cyclic nucleotide-binding protein  30.56 
 
 		 613 aa  182  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  25.24 
 
 		 626 aa  180  5.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  29.75 
 
 		 480 aa  179  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2856  CBS domain-containing protein  25.2 
 
 		 620 aa  179  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0770  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.15 
 
 		 603 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461269  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0822  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28.31 
 
 		 603 aa  179  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0818  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28.15 
 
 		 603 aa  178  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.410169  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2504  cyclic nucleotide-binding protein  24.88 
 
 		 628 aa  177  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003608  Signal transduction protein  24.96 
 
 		 626 aa  175  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3753  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28.64 
 
 		 601 aa  173  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53341  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3695  cyclic nucleotide-binding protein  28.64 
 
 		 603 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3836  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28.41 
 
 		 601 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  27.21 
 
 		 605 aa  171  5e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3667  cyclic nucleotide-binding protein  25.63 
 
 		 606 aa  169  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.773951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4553  cyclic nucleotide-binding protein  26.78 
 
 		 603 aa  166  9e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2480  CBS domain-containing protein  24.17 
 
 		 639 aa  165  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218166  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3158  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.54 
 
 		 596 aa  164  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.664732  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3143  CBS domain-containing protein  26.1 
 
 		 601 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1025  cyclic nucleotide-binding protein  24.56 
 
 		 645 aa  161  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2583  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  26.21 
 
 		 648 aa  160  7e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0978  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  23.62 
 
 		 635 aa  159  9e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.082367  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3274  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  27.9 
 
 		 596 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.877425  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0699  CBS domain-containing protein  26.25 
 
 		 625 aa  157  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0116377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0090  CBS signal-transduction protein  25.94 
 
 		 629 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.382061 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4030  CBS domain-containing protein  27.13 
 
 		 641 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1394  putative signal-transduction protein with CBS domains  26.11 
 
 		 485 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.332611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>