More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1120 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1120  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 112 aa  226  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.360075 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0625  ArsR family transcriptional regulator  65 
 
 		 117 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.906206 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1116  ArsR family transcriptional regulator  63.39 
 
 		 117 aa  134  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2551  regulatory protein ArsR  54.63 
 
 		 111 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365475  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0828  transcriptional regulator, ArsR family  59.34 
 
 		 113 aa  111  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196547  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0900  putative regulatory protein  51 
 
 		 121 aa  103  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2602  ArsR family transcriptional regulator  51 
 
 		 121 aa  103  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2464  ArsR family transcriptional regulator  51 
 
 		 121 aa  103  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889424  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3353  ArsR family transcriptional regulator  51.04 
 
 		 98 aa  98.6  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0561  ArsR family transcriptional regulator  48 
 
 		 121 aa  94.7  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1865  transcriptional regulator, ArsR family  44.33 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  38.54 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5842  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0251  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  39.18 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0248  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1838  ArsR family transcriptional regulator  32 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5112  transcriptional regulator, ArsR family  40.4 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1019  transcriptional regulator, ArsR family  42.27 
 
 		 250 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.736024 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2412  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.589069  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  36.26 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1214  regulatory protein, ArsR  36.84 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 111 aa  63.5  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3373  regulatory protein ArsR  34.62 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00874122  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5370  ArsR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1535  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0449302 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  37.89 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  33.64 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  36.36 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1718  regulatory protein ArsR  32.63 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000189472  hitchhiker  0.000160719 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3812  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.232399  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3869  regulatory protein ArsR  35.42 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361439  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3956  regulatory protein ArsR  36.46 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1475  transcriptional regulator, ArsR family  36.96 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4810  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254931  normal  0.851115 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  31.91 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2848  transcriptional regulator, ArsR family  36.45 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000188384  normal  0.0300767 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5402  ArsR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5459  ArsR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5334  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4480  transcriptional regulator, ArsR family  34.69 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0190  ArsR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.595349 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  35.51 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1974  regulatory protein ArsR  35.79 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1041  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0955  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0939  ArsR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2031  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.71 
 
 		 268 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.298531 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  37.38 
 
 		 133 aa  57  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0693  regulatory protein, ArsR  37.89 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273557 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1735  transcriptional regulator, ArsR family  31.96 
 
 		 115 aa  57  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2692  ArsR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0598068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2736  ArsR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.341929  normal  0.257848 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2722  ArsR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.430326 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0241  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000436096 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  34.04 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3981  helix-turn-helix, type 11  39.24 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  32.63 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3818  ArsR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4686  regulatory protein, ArsR  34.41 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0399394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5412  transcriptional regulator, ArsR family  24.74 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  29.67 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.63 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0777  transcriptional regulator, ArsR family  44.12 
 
 		 267 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  32.63 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3302  ArsR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6785  ArsR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336525 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  34.41 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  29.52 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5506  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0473729 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  27.37 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>