48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1093 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1093  DNA/RNA non-specific endonuclease  100 
 
 		 720 aa  1456    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2087  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.46 
 
 		 724 aa  216  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4436  DNA/RNA non-specific endonuclease  34.29 
 
 		 311 aa  150  9e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2291  DNA/RNA non-specific endonuclease  39.42 
 
 		 721 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2516  hypothetical protein  42.86 
 
 		 401 aa  143  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15116  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5196  V8-like protein Glu-specific endopeptidase-like protein  39.75 
 
 		 694 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.710887  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5484  hypothetical protein  38.37 
 
 		 741 aa  140  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2975  hypothetical protein  35.36 
 
 		 631 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0264248  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2530  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.43 
 
 		 743 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0899  V8-like Glu-specific endopeptidase  39.42 
 
 		 677 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2957  DNA/RNA non-specific endonuclease  37.25 
 
 		 272 aa  131  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1035  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.81 
 
 		 305 aa  131  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.969234  normal  0.342127 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2239  DNA/RNA non-specific endonuclease  32 
 
 		 314 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.838168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2474  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.88 
 
 		 316 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169636  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3176  DNA/RNA non-specific endonuclease  33.44 
 
 		 309 aa  127  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3581  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.8 
 
 		 701 aa  121  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.410045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0949  DNA/RNA non-specific endonuclease  33.66 
 
 		 337 aa  116  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0787893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3250  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.31 
 
 		 686 aa  115  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0799  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.99 
 
 		 669 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0770  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.25 
 
 		 273 aa  111  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.827563  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4063  DNA/RNA non-specific endonuclease  34.71 
 
 		 644 aa  109  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47090  putative protease  34.65 
 
 		 642 aa  109  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3556  hypothetical protein  34.4 
 
 		 369 aa  89  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0917866  normal  0.0496884 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2816  serine protease  34 
 
 		 348 aa  87  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3473  hypothetical protein  33.65 
 
 		 356 aa  83.2  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.145252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3304  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.51 
 
 		 301 aa  80.1  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2812  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.51 
 
 		 301 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.750858  normal  0.309209 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0924  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.55 
 
 		 422 aa  73.9  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2418  hypothetical protein  31.08 
 
 		 363 aa  70.5  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.435913 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2531  hypothetical protein  29.63 
 
 		 363 aa  65.9  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0726  hypothetical protein  34.91 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.62736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3032  hypothetical protein  32.7 
 
 		 328 aa  60.5  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.788507  normal  0.0112295 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02448  protease  25.5 
 
 		 482 aa  58.9  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4310  hypothetical protein  28.57 
 
 		 356 aa  58.5  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.23754  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0571  hypothetical protein  26.62 
 
 		 564 aa  56.6  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3749  hypothetical protein  24.83 
 
 		 572 aa  56.2  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1431  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.58 
 
 		 265 aa  51.6  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0885  DNA/RNA non-specific endonuclease  33.8 
 
 		 283 aa  50.4  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.167923  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3851  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.88 
 
 		 558 aa  49.7  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0414  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.07 
 
 		 277 aa  49.7  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1333  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.88 
 
 		 488 aa  49.7  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4517  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.88 
 
 		 558 aa  49.7  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5787  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.88 
 
 		 526 aa  48.9  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0422  hypothetical protein  26.98 
 
 		 476 aa  48.9  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0260128  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4410  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.09 
 
 		 584 aa  46.6  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.406194 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3947  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.48 
 
 		 541 aa  46.2  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.889809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0413  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.93 
 
 		 293 aa  45.1  0.004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0023  PKD repeat-containing protein  25.45 
 
 		 385 aa  44.7  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>