190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0547 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0547  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
383 aa  769    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1810  C-5 cytosine-specific DNA methylase  57.91 
 
 
382 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2261  DNA-cytosine methyltransferase  52.11 
 
 
387 aa  397  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1337  DNA-cytosine methyltransferase  51.68 
 
 
393 aa  393  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.911958 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4109  DNA-cytosine methyltransferase  50.39 
 
 
395 aa  366  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.560504  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1389  DNA-cytosine methyltransferase  49.61 
 
 
387 aa  355  5e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.376971  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4756  DNA-cytosine methyltransferase  52.36 
 
 
375 aa  350  2e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0971048 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1470  DNA-cytosine methyltransferase  46.32 
 
 
411 aa  324  2e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0452  DNA-cytosine methyltransferase  37.8 
 
 
392 aa  205  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0206606  hitchhiker  0.00155723 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1588  DNA-cytosine methyltransferase  34.53 
 
 
385 aa  171  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4240  DNA-cytosine methyltransferase  34.99 
 
 
387 aa  157  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481849  normal  0.893444 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0414  DNA-cytosine methyltransferase  27.07 
 
 
436 aa  102  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.596456  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  24.87 
 
 
419 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  25.13 
 
 
417 aa  100  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001833  DNA-cytosine methyltransferase  38.42 
 
 
427 aa  100  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1728  DNA-cytosine methyltransferase  38.79 
 
 
483 aa  95.1  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.770689  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  26.56 
 
 
323 aa  93.2  7e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  23.2 
 
 
328 aa  92.4  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  22.7 
 
 
338 aa  91.3  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  32.53 
 
 
416 aa  90.9  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  23.72 
 
 
305 aa  91.3  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  24.6 
 
 
416 aa  90.9  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  23.72 
 
 
350 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  21.12 
 
 
324 aa  90.9  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  21.58 
 
 
329 aa  89.7  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3387  DNA-cytosine methyltransferase  26.85 
 
 
417 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28418  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  23.44 
 
 
727 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  23.45 
 
 
350 aa  86.7  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0058  phage-related DNA methylase, N-terminal region  34.68 
 
 
239 aa  86.3  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  36.47 
 
 
490 aa  86.3  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0298  DNA-cytosine methyltransferase  25.52 
 
 
415 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  24.8 
 
 
417 aa  85.1  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  21.72 
 
 
329 aa  84.3  0.000000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  30.38 
 
 
319 aa  84  0.000000000000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4652  DNA-cytosine methyltransferase  24.23 
 
 
413 aa  83.2  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2460  DNA-cytosine methyltransferase  25.44 
 
 
424 aa  82.8  0.000000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266884  hitchhiker  0.00000000000186187 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  23.1 
 
 
331 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0083  DNA-cytosine methyltransferase  32.56 
 
 
425 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.817279  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0883  DNA-cytosine methyltransferase  24.7 
 
 
389 aa  81.6  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4747  DNA cytosine methylase  23 
 
 
474 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209155  normal  0.300797 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  29.24 
 
 
320 aa  80.5  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  21.96 
 
 
311 aa  80.1  0.00000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  32.77 
 
 
657 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  28.25 
 
 
438 aa  78.6  0.0000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  30.81 
 
 
320 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0822  DNA-cytosine methyltransferase  20.86 
 
 
318 aa  77.8  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  32.32 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  31.18 
 
 
334 aa  76.3  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  26.2 
 
 
313 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20440  DNA-methyltransferase Dcm  37.4 
 
 
315 aa  75.9  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359782  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  30.51 
 
 
323 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  31.54 
 
 
368 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0573  DNA cytosine methylase  22.63 
 
 
491 aa  74.3  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  32.64 
 
 
345 aa  73.9  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  27.91 
 
 
313 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0047  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  24.57 
 
 
352 aa  73.2  0.000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00306927  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.36 
 
 
451 aa  72.4  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3057  DNA-cytosine methyltransferase  29.38 
 
 
406 aa  71.2  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1249  DNA cytosine methylase  26.38 
 
 
476 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.608462  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  29.47 
 
 
426 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0365  DNA-cytosine methyltransferase family protein  29.47 
 
 
350 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1127  DNA cytosine methylase  25.96 
 
 
476 aa  69.7  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00778828  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  25.14 
 
 
327 aa  69.7  0.00000000008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2155  DNA cytosine methylase  25.96 
 
 
476 aa  69.7  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0409475 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2151  DNA cytosine methylase  25.96 
 
 
476 aa  69.7  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  28.76 
 
 
336 aa  69.7  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2551  DNA cytosine methylase  27.23 
 
 
471 aa  68.9  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.491902 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2208  DNA cytosine methylase  25.96 
 
 
476 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.736012 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  28.05 
 
 
310 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  25.44 
 
 
406 aa  68.6  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3583  DNA-cytosine methyltransferase  29.31 
 
 
487 aa  68.2  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  26.79 
 
 
443 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  20.71 
 
 
415 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.49 
 
 
362 aa  67.4  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  32.76 
 
 
437 aa  67  0.0000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0961  DNA-cytosine methyltransferase  28.42 
 
 
350 aa  65.9  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00151605  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2140  DNA-cytosine methyltransferase  28.43 
 
 
428 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767539 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  27.68 
 
 
356 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0472  DNA-cytosine methyltransferase  37.25 
 
 
390 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3354  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.22 
 
 
418 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2193  DNA cytosine methylase  27.23 
 
 
472 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000335113  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1688  DNA-cytosine methyltransferase  25.53 
 
 
472 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.105701  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0841  modification methylase HpaII (cytosine-specific methyltransferase HpaII)  22.2 
 
 
373 aa  63.5  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.59966e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl304  deoxycytosine methylase  29.06 
 
 
455 aa  63.5  0.000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.2985e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  22.61 
 
 
357 aa  63.5  0.000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2063  DNA cytosine methylase  25.53 
 
 
472 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00482699  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2738  DNA cytosine methylase  25.53 
 
 
472 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.358012 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1682  DNA cytosine methylase  25.53 
 
 
472 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0382129 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1224  DNA cytosine methylase  25.53 
 
 
472 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.27257  normal  0.639542 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0923  DNA cytosine methylase  25.53 
 
 
472 aa  63.9  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.579059  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0082  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26.07 
 
 
424 aa  63.5  0.000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000201074 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0352  DNA-cytosine methyltransferase  35.25 
 
 
390 aa  63.2  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  22.83 
 
 
434 aa  63.2  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  24.8 
 
 
361 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  24.68 
 
 
454 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  26.59 
 
 
379 aa  62.4  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1359  site-specific DNA methylase  28.42 
 
 
423 aa  62.4  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000354899  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1414  DNA-cytosine methyltransferase  26.55 
 
 
419 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106105  normal  0.0448096 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0832  DNA-cytosine methyltransferase  26.75 
 
 
383 aa  60.5  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  25.13 
 
 
460 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>