More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2029 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_2029  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 253 aa  511  1e-144  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.755342  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1030  TatD-related deoxyribonuclease  52.85 
 
 		 247 aa  289  3e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.413487  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1778  TatD-related deoxyribonuclease  31.05 
 
 		 281 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  32.3 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1299  TatD family hydrolase  32.26 
 
 		 251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  32.28 
 
 		 257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3651  TatD-related deoxyribonuclease  34.41 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  29.1 
 
 		 464 aa  123  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  29.08 
 
 		 256 aa  122  5e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  29.48 
 
 		 256 aa  121  9e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  30.47 
 
 		 606 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  29.74 
 
 		 462 aa  120  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  31.76 
 
 		 258 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0943  sec-independent transport protein TatD  28.16 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  31.01 
 
 		 264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  28.75 
 
 		 255 aa  115  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1885  hydrolase, TatD family  32.94 
 
 		 254 aa  115  6.9999999999999995e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.16447  normal  0.435973 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  30.5 
 
 		 255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  28.57 
 
 		 256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  32.68 
 
 		 253 aa  112  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  28.79 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  28.79 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  30.89 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  28.79 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  28.79 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  28.85 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  28.79 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  28.06 
 
 		 457 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  28.4 
 
 		 255 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  28.79 
 
 		 256 aa  109  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  28.79 
 
 		 255 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  28.4 
 
 		 255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  28.4 
 
 		 255 aa  109  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  27.63 
 
 		 255 aa  109  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  28.4 
 
 		 255 aa  108  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0316  TatD family hydrolase  29.25 
 
 		 257 aa  108  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  0.040307 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  28.35 
 
 		 255 aa  108  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  27.17 
 
 		 251 aa  108  6e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1799  hydrolase, TatD family  30.95 
 
 		 257 aa  108  9.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.339563  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0481  TatD-related deoxyribonuclease  29.6 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  30.5 
 
 		 259 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  29.88 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  28.63 
 
 		 458 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  28.08 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  29.74 
 
 		 461 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0883  TatD family hydrolase  27.02 
 
 		 253 aa  106  3e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  28.63 
 
 		 458 aa  107  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2900  Mg-dependent DNase TatD  28.51 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000278617  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1431  TatD-related deoxyribonuclease  29.85 
 
 		 272 aa  106  3e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  28.09 
 
 		 256 aa  106  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  29.69 
 
 		 263 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  29.88 
 
 		 271 aa  105  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0910  TatD family hydrolase  28.91 
 
 		 251 aa  105  5e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0118  TatD family hydrolase  27.91 
 
 		 276 aa  105  5e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.373882  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1100  TatD family hydrolase  27.89 
 
 		 251 aa  105  6e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.162868  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0817  TatD family hydrolase  27.89 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.240566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1584  TatD family hydrolase  30.5 
 
 		 264 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873471  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1511  hydrolase, TatD family  26.98 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902805  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  30.08 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  28.79 
 
 		 462 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1774  deoxyribonuclease, putative  27.52 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  29.23 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  27.86 
 
 		 255 aa  103  4e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  28.06 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3632  hydrolase, TatD family  32.3 
 
 		 262 aa  102  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.508824  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  27.86 
 
 		 255 aa  102  6e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  28.91 
 
 		 263 aa  102  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2311  TatD-related deoxyribonuclease  29.63 
 
 		 253 aa  102  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0934  TatD family hydrolase  27.34 
 
 		 264 aa  102  7e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0016009  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  29.8 
 
 		 273 aa  102  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  32.81 
 
 		 259 aa  102  8e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1656  hydrolase, TatD family  27.73 
 
 		 269 aa  102  8e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0489  hydrolase, TatD family  28.68 
 
 		 281 aa  101  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.868901 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  30.65 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0006  TatD family hydrolase  27.09 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.637647  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2068  hydrolase, TatD family  29.72 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  28.35 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  28.68 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  28.35 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  29.96 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  27.73 
 
 		 265 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  30.47 
 
 		 257 aa  99.4  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  29.62 
 
 		 256 aa  99.4  5e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2029  TatD-related deoxyribonuclease  29.06 
 
 		 267 aa  99.4  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1515  TatD family hydrolase  30.47 
 
 		 266 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1779  hydrolase, TatD family  26.95 
 
 		 265 aa  98.6  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1752  hydrolase, TatD family  26.95 
 
 		 265 aa  98.6  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0090  hydrolase, TatD family  29.2 
 
 		 255 aa  98.6  9e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00880503  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  27.67 
 
 		 256 aa  98.2  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  30.98 
 
 		 267 aa  97.4  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1177  hydrolase TatD family  28.74 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00325246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  28.85 
 
 		 263 aa  96.7  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  29.3 
 
 		 263 aa  96.7  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  26.09 
 
 		 265 aa  96.7  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3230  TatD-related deoxyribonuclease  29.3 
 
 		 254 aa  96.7  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000015533  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2080  TatD family hydrolase  30.08 
 
 		 264 aa  95.9  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231197  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  29.13 
 
 		 264 aa  95.5  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3900  TatD family hydrolase  28.18 
 
 		 262 aa  95.5  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164799  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3233  TatD-related deoxyribonuclease  29.3 
 
 		 254 aa  95.1  9e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276118  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3003  TatD related DNase  25.78 
 
 		 265 aa  95.1  9e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0100671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>