54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1789 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1789  putative RNA methylase  100 
 
 		 304 aa  619  1e-176  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2015  putative RNA methylase  49.35 
 
 		 314 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.128985  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1330  N2-methylguanosine tRNA methyltransferase  34.3 
 
 		 355 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.315731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1623  putative RNA methylase  34.29 
 
 		 344 aa  99  8e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.236365  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0722  putative RNA methylase  39.53 
 
 		 334 aa  97.8  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1006  putative RNA methylase  36.21 
 
 		 346 aa  94.4  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0103  putative RNA methylase  35.8 
 
 		 310 aa  92  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.802972  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1864  putative RNA methylase  36.22 
 
 		 365 aa  90.9  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1059  putative RNA methylase  38.51 
 
 		 317 aa  90.9  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000310515  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1526  putative RNA methylase  30.94 
 
 		 350 aa  88.2  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1149  putative RNA methylase  31.82 
 
 		 350 aa  87  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0482589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1249  putative RNA methylase  36.7 
 
 		 343 aa  85.9  7e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0801  putative RNA methylase  30.91 
 
 		 351 aa  85.9  9e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1154  putative RNA methylase  30.13 
 
 		 364 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0420  hypothetical protein  33.17 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0587292 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0700  putative RNA methylase  28.57 
 
 		 374 aa  83.2  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.46275  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2321  putative RNA methylase  35.06 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.334147  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2630  putative RNA methylase  33.89 
 
 		 356 aa  81.6  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0667  putative RNA methylase  30.81 
 
 		 367 aa  79  0.00000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.107618  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1775  putative RNA methylase  29.59 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0132  putative RNA methylase  34.41 
 
 		 371 aa  77.4  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0686  putative RNA methylase  36.42 
 
 		 224 aa  75.5  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.502689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1210  putative RNA methylase  35.63 
 
 		 322 aa  72.8  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00394731 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0125  putative RNA methylase  33.15 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0592  putative RNA methylase  32.61 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1659  putative RNA methylase  31.53 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.69991  hitchhiker  0.00475931 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0020  putative RNA methylase  32.7 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1984  putative RNA methylase  34.34 
 
 		 227 aa  58.5  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4390  hypothetical protein  27.52 
 
 		 317 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.043324  unclonable  2.45562e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0941  hypothetical protein  27.52 
 
 		 317 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1080  hypothetical protein  27.52 
 
 		 317 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.118177  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0793  putative RNA methylase  25.29 
 
 		 317 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.314828  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45681  predicted protein  29.52 
 
 		 591 aa  54.3  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0615  putative RNA methylase  30.21 
 
 		 247 aa  54.7  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0899  hypothetical protein  27.52 
 
 		 284 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000386994  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0987  hypothetical protein  27.52 
 
 		 297 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.86692e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0985  hypothetical protein  28.44 
 
 		 284 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0179865  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0801  methyltransferase  27.52 
 
 		 317 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0852  hypothetical protein  27.52 
 
 		 317 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0797  methyltransferase  27.52 
 
 		 317 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.212906  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50882  predicted protein  27.22 
 
 		 437 aa  48.9  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.933008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37849  predicted protein  30.89 
 
 		 469 aa  48.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00619482  hitchhiker  0.00164206 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0006  methyltransferase small  27.41 
 
 		 209 aa  47.4  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6722  putative RNA methylase  34.48 
 
 		 292 aa  47  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2276  putative RNA methylase  30.36 
 
 		 349 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0555  putative RNA methylase  27.94 
 
 		 336 aa  46.6  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1582  putative RNA methylase  33.03 
 
 		 357 aa  45.4  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1026  putative RNA methylase  31.01 
 
 		 379 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2582  putative RNA methylase  35.58 
 
 		 362 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0038  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.79 
 
 		 257 aa  44.3  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.7 
 
 		 947 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2993  putative RNA methylase  28.26 
 
 		 350 aa  43.1  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.021793 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10450  RNA methylase family UPF0020 protein (AFU_orthologue; AFUA_4G12140)  27.4 
 
 		 499 aa  42.7  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0306  putative RNA methylase  29.46 
 
 		 259 aa  42.4  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0220171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>