More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1429 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1429  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  100 
 
 
368 aa  746    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.519726 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1993  formate hydrogenlyase subunit 5 (HycE)  50.66 
 
 
391 aa  354  2e-96  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0728  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  29.37 
 
 
499 aa  145  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0174132  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0795  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  28.33 
 
 
525 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0933  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  29.58 
 
 
502 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0775  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  31.91 
 
 
412 aa  127  3e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.179386  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1264  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  28.65 
 
 
503 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0324503 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0170  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  29.38 
 
 
501 aa  125  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.679833  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1790  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  28.69 
 
 
518 aa  124  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.57722  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4284  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  27.2 
 
 
551 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2478  NADH dehydrogenase (quinone)  28.13 
 
 
492 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.487557 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1687  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  28.13 
 
 
530 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3851  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  30.25 
 
 
503 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.425582  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0595  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  30.35 
 
 
409 aa  110  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0920  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  28.45 
 
 
516 aa  109  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0606  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  29.43 
 
 
476 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.757635  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1081  NADH dehydrogenase subunit D  28.96 
 
 
404 aa  107  4e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.152309  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4667  hydrogenase 4 subunit G  27.27 
 
 
514 aa  106  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.986005  normal  0.679723 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1071  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  28.12 
 
 
537 aa  105  9e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4465  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  27.92 
 
 
391 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.314486  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1811  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  28.03 
 
 
515 aa  104  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2153  hydrogenase-4, G subunit  28.03 
 
 
515 aa  104  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3524  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  29.33 
 
 
409 aa  104  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4707  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  27.73 
 
 
486 aa  102  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1317  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  25.72 
 
 
526 aa  102  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1571  hydrogenase, group 4, HycE subunit, putative  25.72 
 
 
526 aa  102  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0265592  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1303  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  26.9 
 
 
478 aa  102  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0699  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  25.28 
 
 
524 aa  100  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2590  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  26.05 
 
 
409 aa  100  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2464  NADH dehydrogenase (quinone)  25.49 
 
 
531 aa  100  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.511351  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3859  NADH dehydrogenase (quinone)  25 
 
 
420 aa  100  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0325  putative formate hydrogenlyase subunit  28.09 
 
 
515 aa  99.8  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0183  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  26.44 
 
 
567 aa  99.4  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3367  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  27.53 
 
 
359 aa  98.6  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1400  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  27.56 
 
 
482 aa  97.8  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10088  formate hydrogenase hycE  28.45 
 
 
492 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.301164  normal  0.197013 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6069  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  28.46 
 
 
524 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00289137 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4501  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  26.11 
 
 
361 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0565202 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1289  NADH dehydrogenase I, D subunit  26.99 
 
 
381 aa  97.8  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2227  NADH dehydrogenase (quinone)  26.16 
 
 
419 aa  97.1  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2505  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  26.55 
 
 
358 aa  96.7  6e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1818  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  26.16 
 
 
519 aa  96.7  7e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.207478  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1138  hydrogenase subunit  27.7 
 
 
527 aa  95.9  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0311036  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3785  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  27.3 
 
 
515 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.315955 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1197  NADH dehydrogenase (quinone)  25 
 
 
362 aa  95.9  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.450071  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1123  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  26.74 
 
 
526 aa  95.1  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165135  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1449  hydrogenase, HycE subunit  24.31 
 
 
526 aa  94.7  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0376579  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0360  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  26.25 
 
 
359 aa  94.4  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3440  NADH dehydrogenase  27.86 
 
 
392 aa  94  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.592652  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1737  NADH dehydrogenase subunit D  26.29 
 
 
367 aa  93.6  4e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.960022  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1130  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  27.41 
 
 
402 aa  94  4e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1885  NADH dehydrogenase (quinone)  23.27 
 
 
360 aa  93.6  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0867  hydrogenase, group 4, EchE subunit, putative  25.57 
 
 
359 aa  93.2  6e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.195553  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  28.35 
 
 
404 aa  93.2  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3430  hypothetical protein  27.01 
 
 
513 aa  92.4  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3217  hypothetical protein  27.01 
 
 
513 aa  92.4  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728125  normal  0.0835857 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0785  ech hydrogenase subunit E  24.43 
 
 
359 aa  92  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3675  NADH dehydrogenase I, D subunit  24.29 
 
 
417 aa  92  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3188  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  27.79 
 
 
503 aa  91.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.377236  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0959  membrane bound hydrogenase subunit mbhL  26.04 
 
 
406 aa  91.7  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.105572  normal  0.5876 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0175  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit  28.49 
 
 
522 aa  91.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2985  NADH dehydrogenase subunit D  27.1 
 
 
406 aa  91.7  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0128464  normal  0.286368 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2155  NADH dehydrogenase I, D subunit  28.03 
 
 
441 aa  91.3  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0553  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  25.44 
 
 
358 aa  90.1  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1073  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  27.35 
 
 
503 aa  90.1  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.1537600000000002e-34 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1328  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  29.82 
 
 
581 aa  90.1  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13144  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3288  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  24.58 
 
 
519 aa  90.1  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.14856  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1522  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  26.1 
 
 
358 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_770  hydrogenase, EchE subunit  24.56 
 
 
359 aa  88.6  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2247  NADH dehydrogenase subunit D  24.04 
 
 
412 aa  89  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0299939  normal  0.120974 
 
 
-
 
NC_004310  BR0805  NADH dehydrogenase subunit D  27 
 
 
396 aa  88.2  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0798929  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0800  NADH dehydrogenase subunit D  27 
 
 
396 aa  88.2  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.331726  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1631  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  26.99 
 
 
358 aa  88.2  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0803  NADH dehydrogenase (quinone)  25.15 
 
 
359 aa  87.4  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1086  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  25.44 
 
 
359 aa  87.8  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00746179  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1321  NADH dehydrogenase I, D subunit  24.23 
 
 
417 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735553  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1311  NADH dehydrogenase subunit D  28.57 
 
 
404 aa  87  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00990981  normal  0.0474356 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1425  ech hydrogenase subunit E  24.72 
 
 
361 aa  87  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4570  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  27.68 
 
 
571 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0148  ech hydrogenase subunit E  25.96 
 
 
358 aa  87  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0980  NADH dehydrogenase subunit D  25.43 
 
 
371 aa  86.7  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0744  NADH dehydrogenase subunit D  26.37 
 
 
403 aa  86.7  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0127  hydrogenase-4 component G  26.92 
 
 
582 aa  86.7  6e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.548953  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4741  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  28.64 
 
 
581 aa  86.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.322139  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1669  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  24.78 
 
 
360 aa  86.7  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2597  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  25.07 
 
 
506 aa  86.3  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1102  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  26.53 
 
 
358 aa  86.3  9e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0426  NADH dehydrogenase subunit D  27 
 
 
393 aa  85.9  0.000000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2420  NADH dehydrogenase subunit D  26.62 
 
 
396 aa  85.9  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2713  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  26.44 
 
 
575 aa  85.5  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1293  NADH dehydrogenase (quinone)  26.29 
 
 
431 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.703373  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0912  NADH dehydrogenase I, D subunit  26.05 
 
 
403 aa  85.5  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3816  NADH dehydrogenase subunit D  22.99 
 
 
366 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1375  NADH dehydrogenase (quinone)  27.3 
 
 
379 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.278436  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00990  Ni,Fe-hydrogenase III large subunit  31.02 
 
 
576 aa  85.1  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.823272  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2833  NADH dehydrogenase subunit D  27.74 
 
 
416 aa  84.7  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.371933  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02011  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  27.17 
 
 
395 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0852756  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2769  hydrogenase-4, G subunit  26.78 
 
 
571 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4997  NADH dehydrogenase subunit D  23.89 
 
 
366 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1308  NADH dehydrogenase subunit D  26.34 
 
 
418 aa  84.3  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.652404  normal  0.522315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>