More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1846 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1846  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 350 aa  707    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1601  3-isopropylmalate dehydrogenase  86.74 
 
 		 352 aa  623  1e-177  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0498293 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1033  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.6 
 
 		 351 aa  407  1.0000000000000001e-112  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.895977  hitchhiker  0.00144137 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0739  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.89 
 
 		 362 aa  388  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.379297  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1516  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.81 
 
 		 357 aa  385  1e-106  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0986434  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2577  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.03 
 
 		 362 aa  378  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.338977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1341  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.56 
 
 		 357 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.643187 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1901  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.87 
 
 		 352 aa  375  1e-103  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0850  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.86 
 
 		 352 aa  374  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.898844  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3233  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.86 
 
 		 357 aa  369  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0488471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2586  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.86 
 
 		 359 aa  369  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0972  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.72 
 
 		 362 aa  370  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1020  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.84 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0648  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.55 
 
 		 358 aa  367  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0597503  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2173  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.14 
 
 		 352 aa  365  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1716  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.96 
 
 		 357 aa  365  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1260  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.97 
 
 		 357 aa  366  1e-100  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366056  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1365  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.92 
 
 		 356 aa  366  1e-100  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.528909  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4657  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.17 
 
 		 364 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000431802 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1810  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.42 
 
 		 356 aa  364  2e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.704264  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0347  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.66 
 
 		 361 aa  363  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0340  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.66 
 
 		 361 aa  363  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0788  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.11 
 
 		 357 aa  363  3e-99  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0487359  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2084  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.34 
 
 		 357 aa  363  3e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.157532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1563  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.82 
 
 		 357 aa  363  3e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27267  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1720  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.86 
 
 		 353 aa  362  6e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.424747 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0603  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.57 
 
 		 353 aa  361  9e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1047  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.57 
 
 		 357 aa  361  1e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0738  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.58 
 
 		 358 aa  360  1e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1918  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.97 
 
 		 353 aa  360  2e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0740  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.14 
 
 		 353 aa  359  3e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08261  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.92 
 
 		 359 aa  359  3e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.842173  normal  0.408942 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2917  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.87 
 
 		 364 aa  360  3e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0036  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.03 
 
 		 355 aa  359  4e-98  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.246582  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0017  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.56 
 
 		 355 aa  358  6e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1101  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.97 
 
 		 355 aa  358  6e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.815797  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1221  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.44 
 
 		 357 aa  358  6e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.725495  normal  0.0144759 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0509  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.59 
 
 		 357 aa  358  8e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17341  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.41 
 
 		 357 aa  358  8e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1420  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.89 
 
 		 362 aa  358  8e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5238  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.47 
 
 		 356 aa  357  9.999999999999999e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37874 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0194  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.92 
 
 		 359 aa  357  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18652  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1264  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.21 
 
 		 355 aa  356  2.9999999999999997e-97  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0797  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.82 
 
 		 357 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000426941  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4403  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.72 
 
 		 360 aa  356  2.9999999999999997e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0864  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.35 
 
 		 350 aa  356  3.9999999999999996e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000147801  hitchhiker  0.00313755 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2987  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.48 
 
 		 362 aa  355  6.999999999999999e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.372327 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3041  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.23 
 
 		 356 aa  355  6.999999999999999e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2093  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.11 
 
 		 359 aa  354  1e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0127981  normal  0.7067 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1988  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.67 
 
 		 363 aa  353  2e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378872  normal  0.141872 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2162  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.46 
 
 		 363 aa  353  2e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.173538 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3610  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.37 
 
 		 361 aa  353  2.9999999999999997e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.358353 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1732  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.25 
 
 		 358 aa  352  4e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00156138  hitchhiker  0.00249428 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2075  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.25 
 
 		 358 aa  352  4e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2472  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.63 
 
 		 355 aa  352  5e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.278486  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2209  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.38 
 
 		 362 aa  352  5.9999999999999994e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000258319  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0381  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.59 
 
 		 354 aa  352  7e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0364  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.59 
 
 		 354 aa  352  7e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2063  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.82 
 
 		 360 aa  352  8e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2311  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.35 
 
 		 355 aa  352  8e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1703  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.86 
 
 		 351 aa  351  1e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.112603  hitchhiker  0.00699985 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2143  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.06 
 
 		 356 aa  351  1e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3130  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.51 
 
 		 355 aa  351  1e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.462237  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2131  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.63 
 
 		 355 aa  350  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.609597  normal  0.0221523 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1819  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.17 
 
 		 356 aa  350  2e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7246  normal  0.707373 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2592  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.73 
 
 		 371 aa  349  5e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.229971  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1793  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.95 
 
 		 356 aa  348  6e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.121615  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2066  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.71 
 
 		 363 aa  348  9e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1643  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.35 
 
 		 355 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2313  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.35 
 
 		 355 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.941716  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1726  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.35 
 
 		 355 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0775  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.35 
 
 		 355 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0341042  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1892  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.54 
 
 		 360 aa  348  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2451  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.35 
 
 		 355 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.172832  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2451  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.39 
 
 		 379 aa  348  1e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197257  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0523  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.35 
 
 		 355 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.653046  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1781  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.68 
 
 		 359 aa  348  1e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.500834  hitchhiker  0.00494446 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1852  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.35 
 
 		 355 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614244  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1247  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.02 
 
 		 359 aa  346  3e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1230  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.7 
 
 		 361 aa  346  3e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121054 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3068  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.66 
 
 		 354 aa  346  3e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.787339  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4627  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.07 
 
 		 355 aa  346  4e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.391224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1505  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.48 
 
 		 365 aa  345  5e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0654454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09751  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.32 
 
 		 360 aa  345  5e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.945321  hitchhiker  0.00220334 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3587  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.66 
 
 		 364 aa  345  5e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3760  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.66 
 
 		 364 aa  345  5e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.930795  normal  0.184493 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4235  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.66 
 
 		 364 aa  345  7e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1865  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.49 
 
 		 357 aa  345  7e-94  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.436203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1794  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.69 
 
 		 358 aa  345  7e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.741097 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0369  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.66 
 
 		 364 aa  345  7e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3847  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.79 
 
 		 355 aa  345  8e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.937841 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2662  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.21 
 
 		 369 aa  345  8e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.789856  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4369  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.07 
 
 		 355 aa  344  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1988  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.98 
 
 		 360 aa  344  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3771  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.98 
 
 		 360 aa  344  1e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3222  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.41 
 
 		 358 aa  344  1e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1519  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.98 
 
 		 360 aa  344  1e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.676476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3343  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.79 
 
 		 355 aa  344  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1677  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.51 
 
 		 367 aa  343  2e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1100  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.84 
 
 		 363 aa  343  2e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.757445  normal  0.166084 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>