More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1120 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1120  aminotransferase class-III  100 
 
 
446 aa  928    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.020832  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1870  aminotransferase class-III  90.52 
 
 
444 aa  858    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3443  aminotransferase class-III  52.74 
 
 
450 aa  491  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000605746  normal  0.17806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0272  aminotransferase class-III  44.84 
 
 
462 aa  409  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5722  hypothetical protein  45.73 
 
 
446 aa  397  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1823  hypothetical protein  43.12 
 
 
464 aa  394  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.440887  normal  0.352314 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3751  aminotransferase class-III  45.45 
 
 
448 aa  392  1e-108  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0358  hypothetical protein  42.42 
 
 
464 aa  388  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.175668 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0447  aminotransferase class-III  43.54 
 
 
461 aa  387  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5776  hypothetical protein  44.19 
 
 
484 aa  385  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.246423 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1055  hypothetical protein  43.46 
 
 
463 aa  382  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0034  hypothetical protein  45.93 
 
 
441 aa  384  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0336  hypothetical protein  42.69 
 
 
459 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0357  hypothetical protein  42.69 
 
 
459 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.340156 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0347  hypothetical protein  42.69 
 
 
459 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4627  hypothetical protein  43.75 
 
 
435 aa  381  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0158  hypothetical protein  43.53 
 
 
438 aa  371  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2960  aminotransferase class-III  42.76 
 
 
457 aa  368  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0599689  hitchhiker  0.00173955 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3118  hypothetical protein  42.19 
 
 
437 aa  356  5.999999999999999e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1417  4-aminobutyrate aminotransferase  43.06 
 
 
441 aa  355  8.999999999999999e-97  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1438  aminotransferase class-III  43.18 
 
 
444 aa  351  2e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.662958  normal  0.450478 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0532  aminotransferase class-III  40.13 
 
 
444 aa  350  3e-95  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410218  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4554  aminotransferase class-III  41.9 
 
 
428 aa  348  1e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0841  aminotransferase class-III  40 
 
 
440 aa  345  8.999999999999999e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24140  aminotransferase  41.53 
 
 
453 aa  342  7e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00920  aminotransferase  41.49 
 
 
463 aa  338  9.999999999999999e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1430  hypothetical protein  40.7 
 
 
448 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360398  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6399  hypothetical protein  40.7 
 
 
448 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755332  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2572  hypothetical protein  40.23 
 
 
437 aa  328  8e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  38.65 
 
 
457 aa  299  7e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  38.62 
 
 
479 aa  297  3e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  38.41 
 
 
446 aa  290  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  38.17 
 
 
446 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  38.17 
 
 
446 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  38.17 
 
 
446 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  38.12 
 
 
446 aa  288  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  35.91 
 
 
456 aa  287  2.9999999999999996e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  38.12 
 
 
446 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  37.85 
 
 
446 aa  286  4e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  36.79 
 
 
448 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  36.57 
 
 
448 aa  280  5e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  36.57 
 
 
448 aa  280  5e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  37.5 
 
 
449 aa  278  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  37.1 
 
 
449 aa  276  5e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  37.41 
 
 
449 aa  276  6e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  37.41 
 
 
449 aa  276  6e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  37.41 
 
 
449 aa  276  6e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  37.41 
 
 
449 aa  276  6e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  37.41 
 
 
449 aa  276  6e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2467  hypothetical protein  37.41 
 
 
449 aa  275  9e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1202  hypothetical protein  37.41 
 
 
449 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  38.67 
 
 
454 aa  272  1e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  38.85 
 
 
450 aa  267  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  38.48 
 
 
450 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  35.06 
 
 
436 aa  266  5.999999999999999e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0051  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  36.26 
 
 
470 aa  266  8e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.132142 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  36.3 
 
 
428 aa  265  1e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  36.47 
 
 
437 aa  263  6e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  38.46 
 
 
444 aa  261  2e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  38.46 
 
 
441 aa  259  7e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  37.85 
 
 
451 aa  258  2e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1481  aminotransferase  36.1 
 
 
449 aa  258  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1704  aminotransferase  36.34 
 
 
450 aa  257  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1727  aminotransferase  36.1 
 
 
449 aa  256  4e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  37.17 
 
 
454 aa  257  4e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1524  aminotransferase  36.12 
 
 
450 aa  257  4e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.642809  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  37.17 
 
 
454 aa  257  4e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1491  aminotransferase  36.1 
 
 
449 aa  256  5e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112289  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1519  aminotransferase  35.87 
 
 
449 aa  256  6e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152783  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1636  aminotransferase  35.87 
 
 
450 aa  256  6e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  40.9 
 
 
459 aa  256  6e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1778  aminotransferase  35.87 
 
 
450 aa  256  7e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.250209  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2275  hypothetical protein  37.08 
 
 
436 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  35.21 
 
 
454 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  34.83 
 
 
443 aa  254  3e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3671  aminotransferase  35.89 
 
 
450 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0477751  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  36.58 
 
 
468 aa  253  6e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  36.58 
 
 
454 aa  253  6e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  36.93 
 
 
454 aa  253  6e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1673  aminotransferase  35.89 
 
 
450 aa  253  6e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0301264  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  36.93 
 
 
478 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3048  hypothetical protein  36.84 
 
 
436 aa  252  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1996  aminotransferase class-III  35.31 
 
 
434 aa  252  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.026551  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1331  aminotransferase  38 
 
 
451 aa  251  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1682  hypothetical protein  37.29 
 
 
436 aa  251  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63587  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2112  hypothetical protein  40.4 
 
 
436 aa  251  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177398  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1320  aminotransferase  37.53 
 
 
450 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0408042  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  36.69 
 
 
454 aa  250  3e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2139  hypothetical protein  36.6 
 
 
436 aa  250  4e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2077  hypothetical protein  36.6 
 
 
436 aa  250  4e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2073  hypothetical protein  36.6 
 
 
436 aa  250  4e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2294  hypothetical protein  36.6 
 
 
436 aa  250  4e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2319  hypothetical protein  36.6 
 
 
436 aa  250  4e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2402  hypothetical protein  36.6 
 
 
436 aa  249  6e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2328  hypothetical protein  36.6 
 
 
436 aa  249  6e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000223994  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  38.06 
 
 
438 aa  249  6e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8150  hypothetical protein  34.59 
 
 
448 aa  249  7e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.387109  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6715  hypothetical protein  35.91 
 
 
454 aa  249  7e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.284821 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  35.18 
 
 
441 aa  248  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  36.65 
 
 
479 aa  248  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>