More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0745 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0745  recA protein  100 
 
 		 349 aa  692    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.624125  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0858  recA protein  91.29 
 
 		 349 aa  617  1e-176  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.873565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  66.77 
 
 		 343 aa  449  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  63.86 
 
 		 347 aa  444  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  64.53 
 
 		 346 aa  441  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  64.42 
 
 		 352 aa  438  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  64.42 
 
 		 352 aa  438  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  64.69 
 
 		 341 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  64.38 
 
 		 355 aa  436  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  63.85 
 
 		 348 aa  436  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1021  RecA protein  60.88 
 
 		 379 aa  433  1e-120  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  63.98 
 
 		 364 aa  432  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  63.11 
 
 		 418 aa  432  1e-120  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2138  recombinase A  70.59 
 
 		 358 aa  432  1e-120  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.565183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  64.6 
 
 		 347 aa  433  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  63.5 
 
 		 357 aa  434  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  60.52 
 
 		 366 aa  429  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  62.46 
 
 		 350 aa  428  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0387  recA protein  63.03 
 
 		 347 aa  427  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  64.49 
 
 		 348 aa  427  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  64.79 
 
 		 346 aa  427  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  60 
 
 		 363 aa  424  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  62.13 
 
 		 341 aa  425  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  61.54 
 
 		 364 aa  424  1e-118  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  64.11 
 
 		 338 aa  426  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  63.27 
 
 		 345 aa  426  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0623  recA protein  57.93 
 
 		 352 aa  425  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.306263  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1050  recA protein  65 
 
 		 349 aa  426  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  64.11 
 
 		 338 aa  426  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  63.86 
 
 		 348 aa  425  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  60.68 
 
 		 347 aa  424  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  60.12 
 
 		 348 aa  426  1e-118  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  62.46 
 
 		 378 aa  422  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1378  recombinase A  62.8 
 
 		 354 aa  421  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0217782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1523  recombinase A  59.54 
 
 		 346 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  61.28 
 
 		 347 aa  421  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  58.91 
 
 		 362 aa  423  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0618  recA protein  61.61 
 
 		 347 aa  422  1e-117  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.186792  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  59.71 
 
 		 363 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  61.92 
 
 		 344 aa  421  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  61.28 
 
 		 347 aa  421  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17530  recombinase A  59.54 
 
 		 346 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  61.96 
 
 		 368 aa  422  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  63.38 
 
 		 376 aa  421  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  58.74 
 
 		 362 aa  418  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  64 
 
 		 347 aa  421  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4134  recA protein  60.68 
 
 		 345 aa  419  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00773385  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  63.35 
 
 		 336 aa  420  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4033  recA protein  62.8 
 
 		 354 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  59.59 
 
 		 348 aa  419  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  59.3 
 
 		 348 aa  418  1e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1981  recombinase A  61.26 
 
 		 349 aa  419  1e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686398 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  63.69 
 
 		 350 aa  418  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0198  recombinase A  64.44 
 
 		 339 aa  419  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0327556 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  62.26 
 
 		 356 aa  419  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  63.49 
 
 		 365 aa  419  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03079  recombinase A  58.55 
 
 		 348 aa  420  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.353429  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  59.17 
 
 		 363 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  61.58 
 
 		 345 aa  421  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  61.89 
 
 		 345 aa  421  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  62.94 
 
 		 360 aa  420  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  62.15 
 
 		 359 aa  419  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  61.89 
 
 		 345 aa  421  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  60.18 
 
 		 355 aa  418  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4194  recombinase A  63.04 
 
 		 358 aa  419  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  60.12 
 
 		 359 aa  421  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  62.77 
 
 		 345 aa  419  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  61.35 
 
 		 361 aa  421  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  58.58 
 
 		 362 aa  419  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  62.15 
 
 		 365 aa  419  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  62.88 
 
 		 347 aa  418  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  63.69 
 
 		 345 aa  418  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0597  recombinase A  61.66 
 
 		 356 aa  419  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  62.15 
 
 		 350 aa  420  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  60.98 
 
 		 350 aa  418  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1525  recA protein  60.99 
 
 		 353 aa  415  9.999999999999999e-116  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245316  unclonable  4.38442e-19 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  62.46 
 
 		 346 aa  416  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2448  recA protein  62.46 
 
 		 350 aa  416  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.953449 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0852  recombinase A  58.89 
 
 		 349 aa  415  9.999999999999999e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.173922  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  60.74 
 
 		 364 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  58.33 
 
 		 361 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3015  recombinase A  61.89 
 
 		 347 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.514179  hitchhiker  0.000000000000973321 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  58.33 
 
 		 424 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1175  recombinase A  61.33 
 
 		 352 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  63.69 
 
 		 379 aa  414  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  58.19 
 
 		 343 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  58.82 
 
 		 364 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1288  recombinase A  59.82 
 
 		 348 aa  415  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  63.75 
 
 		 347 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  60.18 
 
 		 362 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  63.75 
 
 		 347 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  60.24 
 
 		 358 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0653  recA protein  60.62 
 
 		 346 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10720  protein RecA  62.93 
 
 		 361 aa  415  9.999999999999999e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000907009  unclonable  0.00000000149755 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  61.35 
 
 		 361 aa  417  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  61.04 
 
 		 343 aa  417  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  63.75 
 
 		 347 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_002950  PG0881  recombinase A  60.56 
 
 		 340 aa  411  1e-114  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  58.19 
 
 		 357 aa  413  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1230  recombinase A  58.11 
 
 		 357 aa  412  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.460816  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>