More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2138 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2138  recombinase A  100 
 
 		 358 aa  715    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.565183  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0858  recA protein  69.28 
 
 		 349 aa  476  1e-133  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.873565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0745  recA protein  70.59 
 
 		 349 aa  473  1e-132  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.624125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4075  recA protein  65.69 
 
 		 358 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4108  recA protein  65.4 
 
 		 358 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.633837  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  66.46 
 
 		 348 aa  440  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3964  RecA protein  65.1 
 
 		 358 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  64.69 
 
 		 424 aa  435  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  64.65 
 
 		 338 aa  437  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1303  recombinase A  63.61 
 
 		 355 aa  437  1e-121  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  64.56 
 
 		 365 aa  435  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  64.63 
 
 		 338 aa  436  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  64.06 
 
 		 347 aa  431  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  64.69 
 
 		 361 aa  433  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  65.94 
 
 		 358 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  65.2 
 
 		 364 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  63.06 
 
 		 343 aa  433  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  63.32 
 
 		 363 aa  431  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  64.98 
 
 		 360 aa  432  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  64.69 
 
 		 361 aa  432  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  65.33 
 
 		 347 aa  433  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  62.69 
 
 		 355 aa  432  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  65.2 
 
 		 362 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  63.35 
 
 		 364 aa  433  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4134  recA protein  63.53 
 
 		 345 aa  429  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00773385  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  61.19 
 
 		 363 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  64.72 
 
 		 336 aa  429  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  64.62 
 
 		 345 aa  430  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  60.9 
 
 		 363 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  64.58 
 
 		 361 aa  429  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  63.44 
 
 		 358 aa  427  1e-119  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  62.61 
 
 		 360 aa  431  1e-119  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03079  recombinase A  64.67 
 
 		 348 aa  430  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.353429  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  65 
 
 		 344 aa  429  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  63.75 
 
 		 359 aa  429  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  63.04 
 
 		 355 aa  430  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  64.62 
 
 		 345 aa  430  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1981  recombinase A  62.42 
 
 		 349 aa  427  1e-118  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686398 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  62.07 
 
 		 362 aa  427  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  60.6 
 
 		 362 aa  427  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  63.02 
 
 		 341 aa  427  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  63.19 
 
 		 366 aa  425  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  62.38 
 
 		 364 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1288  recombinase A  62.58 
 
 		 348 aa  425  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  61.8 
 
 		 418 aa  425  1e-118  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  60.12 
 
 		 341 aa  427  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0653  recA protein  62.96 
 
 		 346 aa  426  1e-118  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4080  recombinase A  61.49 
 
 		 361 aa  426  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2558  recombinase A  64.35 
 
 		 362 aa  426  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352201  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  63.16 
 
 		 348 aa  422  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  63.16 
 
 		 348 aa  422  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  63.24 
 
 		 348 aa  423  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  60.12 
 
 		 347 aa  423  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  63.55 
 
 		 356 aa  423  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  62.93 
 
 		 348 aa  423  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  59.7 
 
 		 357 aa  421  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  61.13 
 
 		 362 aa  422  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5034  recA protein  59.05 
 
 		 364 aa  422  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  61.96 
 
 		 348 aa  424  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  62.81 
 
 		 350 aa  422  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  59.71 
 
 		 343 aa  421  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  61.96 
 
 		 379 aa  419  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0145  recombinase A  67.8 
 
 		 338 aa  421  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2980  recombinase A  61.45 
 
 		 353 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.200628  decreased coverage  0.0000974758 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0219  recombinase A  66.77 
 
 		 333 aa  419  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3174  recombinase A  62.88 
 
 		 352 aa  419  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0591186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1732  recombinase A  63.14 
 
 		 352 aa  419  1e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0649106  normal  0.0921204 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3015  recombinase A  61.45 
 
 		 353 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  decreased coverage  0.0000000499102 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0634  recombinase A  63.04 
 
 		 347 aa  419  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3138  recombinase A  61.45 
 
 		 353 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000383703 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0727  recombinase A  63.41 
 
 		 347 aa  420  1e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.794192  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0198  recombinase A  66.25 
 
 		 339 aa  418  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0327556 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  63.12 
 
 		 345 aa  419  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2014  recombinase A  63.14 
 
 		 352 aa  418  1e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.306298 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3031  recombinase A  61.45 
 
 		 353 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00473022  hitchhiker  0.000967818 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2948  recombinase A  61.45 
 
 		 353 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  62.35 
 
 		 352 aa  420  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  62.35 
 
 		 352 aa  421  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1525  recA protein  62.38 
 
 		 353 aa  419  1e-116  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245316  unclonable  4.38442e-19 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0070  recombinase A  61.96 
 
 		 354 aa  420  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  59.41 
 
 		 390 aa  419  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07230  protein RecA  60.59 
 
 		 351 aa  419  1e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.533016  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0990  recA protein  63.55 
 
 		 353 aa  414  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000616835  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  62.19 
 
 		 347 aa  417  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03513  recombinase A  59.65 
 
 		 354 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0527  recombinase A  61.74 
 
 		 353 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000554316  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2448  recA protein  61.23 
 
 		 350 aa  414  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.953449 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0996  recA protein  60.42 
 
 		 363 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3946  recombinase A  63.86 
 
 		 353 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.44116  normal  0.835205 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  61.88 
 
 		 350 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2629  recA protein  65.09 
 
 		 366 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2983  recombinase A  63.86 
 
 		 353 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0313902  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2835  recombinase A  63.86 
 
 		 353 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0246819  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0671  recombinase A  62.8 
 
 		 358 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0623  recA protein  61.28 
 
 		 352 aa  416  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.306263  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2601  recA protein  64.78 
 
 		 366 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.2342 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1013  recombinase A  63.86 
 
 		 353 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.580458  unclonable  0.0000000301114 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  62.17 
 
 		 346 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  60.68 
 
 		 343 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  62.5 
 
 		 347 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>