More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3286 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3286  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 253 aa  496  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2116  response regulator receiver  83.54 
 
 		 244 aa  379  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124282 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2393  two component transcriptional regulator, winged helix family  83.13 
 
 		 244 aa  379  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2069  two component transcriptional regulator, winged helix family  78.66 
 
 		 291 aa  372  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.501994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1255  two component transcriptional regulator, winged helix family  71.72 
 
 		 246 aa  340  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1998  two component transcriptional regulator  74.27 
 
 		 240 aa  340  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0541046  normal  0.0777049 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3683  two component transcriptional regulator  67.5 
 
 		 246 aa  314  8e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.801848  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5277  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.26 
 
 		 246 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4376  winged helix family two component transcriptional regulator  65.56 
 
 		 247 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4667  two component transcriptional regulator  64.73 
 
 		 247 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0094  two component transcriptional regulator  66.25 
 
 		 246 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0710  two component transcriptional regulator  64.49 
 
 		 248 aa  301  5.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0634  two component transcriptional regulator  47.98 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.823943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46550  response regulator  47.83 
 
 		 267 aa  203  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0203573  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2354  two component transcriptional regulator  51.71 
 
 		 235 aa  202  4e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.402981 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1895  osmolarity response regulator  49.15 
 
 		 244 aa  201  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0546897 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3373  two component transcriptional regulator  45.06 
 
 		 238 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.584151  normal  0.399207 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  46.78 
 
 		 239 aa  198  6e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.21 
 
 		 240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2582  osmolarity response regulator  48.72 
 
 		 243 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  42.44 
 
 		 245 aa  195  5.000000000000001e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  47.06 
 
 		 241 aa  195  6e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1574  osmolarity response regulator  49.33 
 
 		 236 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  45.76 
 
 		 246 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  45.34 
 
 		 246 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2418  two component transcriptional regulator  45.85 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  44.68 
 
 		 246 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  45.34 
 
 		 246 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1190  two component transcriptional regulator  45.02 
 
 		 248 aa  193  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  45.34 
 
 		 246 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3325  osmolarity response regulator  49.77 
 
 		 244 aa  192  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000316731  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2352  osmolarity response regulator  49.77 
 
 		 244 aa  192  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.260389  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1962  osmolarity response regulator  49.77 
 
 		 244 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187967  normal  0.0634815 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1485  osmolarity response regulator  49.77 
 
 		 241 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.021777  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1938  osmolarity response regulator  49.77 
 
 		 244 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0280828  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1853  osmolarity response regulator  49.77 
 
 		 244 aa  192  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00101518  hitchhiker  0.0000149756 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2507  osmolarity response regulator  49.77 
 
 		 241 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.734124  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5249  osmolarity response regulator  49.77 
 
 		 244 aa  192  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204246  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1926  osmolarity response regulator  49.77 
 
 		 244 aa  192  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0250147  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2094  osmolarity response regulator  49.77 
 
 		 241 aa  193  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2395  osmolarity response regulator  49.77 
 
 		 244 aa  192  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479905  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1980  osmolarity response regulator  49.77 
 
 		 244 aa  192  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0224779  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1333  osmolarity response regulator  49.77 
 
 		 244 aa  192  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00265076  decreased coverage  0.0000710625 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1253  osmolarity response regulator  49.77 
 
 		 244 aa  192  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.512472  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6141  osmolarity response regulator  49.77 
 
 		 244 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120853  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  45.69 
 
 		 240 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1003  osmolarity response regulator  49.77 
 
 		 244 aa  192  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0710839  normal  0.39184 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1947  osmolarity response regulator  49.54 
 
 		 240 aa  192  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1879  osmolarity response regulator  49.77 
 
 		 244 aa  192  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.276509  normal  0.342548 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2307  osmolarity response regulator  49.77 
 
 		 244 aa  192  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0713504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  43.53 
 
 		 246 aa  192  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  42.02 
 
 		 245 aa  191  7e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.28 
 
 		 251 aa  191  8e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287257  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4604  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.77 
 
 		 246 aa  191  9e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4123  two component transcriptional regulator  46.78 
 
 		 242 aa  191  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1368  osmolarity response regulator  49.54 
 
 		 240 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3459  two component transcriptional regulator  44.78 
 
 		 246 aa  190  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0758  two component transcriptional regulator  45.96 
 
 		 244 aa  190  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.885545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5579  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 		 248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00126537  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2546  osmolarity response regulator  45.53 
 
 		 245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2852  osmolarity response regulator  48.51 
 
 		 243 aa  189  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3153  osmolarity response regulator  49.36 
 
 		 243 aa  189  4e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2500  osmolarity response regulator  49.36 
 
 		 243 aa  189  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0225  osmolarity response regulator  44.92 
 
 		 240 aa  189  5e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2086  two component transcriptional regulator  44.26 
 
 		 246 aa  188  7e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2259  osmolarity response regulator  47.48 
 
 		 257 aa  188  8e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0634187  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1584  osmolarity response regulator  48.94 
 
 		 243 aa  187  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.131787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0994  two-component response regulator  43.4 
 
 		 246 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1648  osmolarity response regulator  49.07 
 
 		 240 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.446623 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5704  two component transcriptional regulator  44.26 
 
 		 246 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140603  normal  0.300283 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1898  osmolarity response regulator  49.07 
 
 		 240 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.065084  normal  0.515659 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1569  osmolarity response regulator  49.07 
 
 		 240 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306137  normal  0.101265 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2713  osmolarity response regulator  45.71 
 
 		 245 aa  186  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394419  normal  0.0259821 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4027  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.21 
 
 		 240 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  0.528233 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2423  two component transcriptional regulator  45.73 
 
 		 240 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  43.29 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4363  osmolarity response regulator  47.66 
 
 		 243 aa  186  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2275  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.83 
 
 		 246 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0529078  normal  0.301367 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3907  two component transcriptional regulator  43.4 
 
 		 245 aa  185  6e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1909  two component transcriptional regulator  44.26 
 
 		 246 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.596265  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3477  two component transcriptional regulator  41.27 
 
 		 261 aa  185  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1980  osmolarity response regulator  46.81 
 
 		 243 aa  185  7e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431202  normal  0.459947 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3303  two component transcriptional regulator  44.26 
 
 		 245 aa  185  8e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.26 
 
 		 246 aa  185  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0474711  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4597  osmolarity response regulator  44.73 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4017  osmolarity response regulator  46.15 
 
 		 241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00621  osmolarity response regulator  45.61 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001870  two-component system response regulator OmpR  45.61 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.360284  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4075  osmolarity response regulator  44.35 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1587  two component transcriptional regulator  44.9 
 
 		 261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.367759  normal  0.752499 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0324  osmolarity response regulator  45.57 
 
 		 239 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566854  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4633  osmolarity response regulator  46.15 
 
 		 241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3326  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 		 243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0244  osmolarity response regulator  44.77 
 
 		 239 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.35 
 
 		 241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2155  two component transcriptional regulator  45.58 
 
 		 261 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.128892 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3898  osmolarity response regulator  44.35 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  46.35 
 
 		 241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2286  osmolarity response regulator  46.22 
 
 		 240 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2732  osmolarity response regulator  45.53 
 
 		 243 aa  183  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.744063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>