51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2012 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2012  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  471  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2527  hypothetical protein  36.4 
 
 		 275 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103788 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4574  hypothetical protein  41.63 
 
 		 253 aa  106  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.591953 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5034  hypothetical protein  41.63 
 
 		 253 aa  106  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204633 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5092  hypothetical protein  41.36 
 
 		 260 aa  105  8e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.821944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0810  hypothetical protein  38.21 
 
 		 253 aa  97.1  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.469295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5155  hypothetical protein  39.75 
 
 		 249 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.277235  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3145  hypothetical protein  38.21 
 
 		 253 aa  94  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4498  hypothetical protein  42.24 
 
 		 249 aa  94  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2400  hypothetical protein  31.88 
 
 		 244 aa  90.1  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4947  hypothetical protein  35.55 
 
 		 243 aa  90.1  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.968147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1333  hypothetical protein  39.92 
 
 		 265 aa  89.4  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2800  hypothetical protein  32.39 
 
 		 254 aa  88.6  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5203  hypothetical protein  37.27 
 
 		 257 aa  87.8  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4463  hypothetical protein  38.79 
 
 		 259 aa  85.5  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.207507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5157  hypothetical protein  33.19 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3807  hypothetical protein  33.89 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10779  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5399  hypothetical protein  28.24 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2296  hypothetical protein  32.19 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5605  hypothetical protein  33.33 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198134 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2343  hypothetical protein  29.65 
 
 		 245 aa  78.2  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0119361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3382  hypothetical protein  30.5 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0142115  normal  0.996746 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1536  hypothetical protein  36.89 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3767  hypothetical protein  31.7 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1829  hypothetical protein  41.1 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.727935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0081  hypothetical protein  31.25 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0071  hypothetical protein  32.37 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2985  hypothetical protein  34.91 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1073  hypothetical protein  44.23 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.245832 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3023  hypothetical protein  30.94 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.281163 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2257  hypothetical protein  35.24 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4289  hypothetical protein  36.36 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.817777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3565  hypothetical protein  33.64 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0177  hypothetical protein  34.16 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.23071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1560  hypothetical protein  32.45 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3996  hypothetical protein  34.81 
 
 		 195 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3265  hypothetical protein  31.08 
 
 		 327 aa  50.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2004  hypothetical protein  34.27 
 
 		 261 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2668  hypothetical protein  35.32 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.681944  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1742  hypothetical protein  38.1 
 
 		 278 aa  48.1  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2597  hypothetical protein  30.07 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1901  hypothetical protein  32.55 
 
 		 262 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1731  hypothetical protein  32.73 
 
 		 267 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151489  hitchhiker  0.00524741 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4216  hypothetical protein  31.28 
 
 		 314 aa  45.8  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1121  hypothetical protein  35.65 
 
 		 268 aa  45.4  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4263  hypothetical protein  32.73 
 
 		 294 aa  45.8  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444391  normal  0.375648 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2102  hypothetical protein  31.18 
 
 		 276 aa  45.4  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0475  hypothetical protein  38.73 
 
 		 236 aa  43.9  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3892  hypothetical protein  30.4 
 
 		 314 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0691561 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1225  hypothetical protein  36.96 
 
 		 249 aa  42.7  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1965  hypothetical protein  33.77 
 
 		 255 aa  42  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>