More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1581 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1581  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 259 aa  500  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.226985 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  75.2 
 
 		 260 aa  369  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  73.23 
 
 		 260 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1735  alpha/beta hydrolase fold  74.8 
 
 		 260 aa  358  4e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  53.31 
 
 		 266 aa  250  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  51.95 
 
 		 268 aa  241  7.999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1154  hydrolase, alpha/beta fold family  50.83 
 
 		 259 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0996  Alpha/beta hydrolase fold  47.92 
 
 		 259 aa  227  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  40.54 
 
 		 278 aa  225  4e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1820  alpha/beta hydrolase fold  46.25 
 
 		 267 aa  214  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.65199  normal  0.0137069 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01012  predicted hydrolase  45.92 
 
 		 266 aa  208  5e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2633  alpha/beta hydrolase  45.92 
 
 		 266 aa  208  5e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.96339  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01019  hypothetical protein  45.92 
 
 		 266 aa  208  5e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2586  alpha/beta hydrolase fold  46.35 
 
 		 266 aa  207  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0660312 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2116  putative rutD protein  46.35 
 
 		 270 aa  207  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1124  putative rutD protein  46.35 
 
 		 266 aa  207  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1127  putative rutD protein  45.92 
 
 		 266 aa  207  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1246  putative rutD protein  45.92 
 
 		 266 aa  206  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1522  alpha/beta hydrolase fold  43.75 
 
 		 270 aa  196  3e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.401637 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  39.34 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  35.04 
 
 		 261 aa  125  6e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  34.98 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  27.94 
 
 		 267 aa  104  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  31.07 
 
 		 284 aa  102  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  29.23 
 
 		 262 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  32.3 
 
 		 266 aa  102  8e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  30.59 
 
 		 260 aa  99.8  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4425  esterase V  31.58 
 
 		 278 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  31.03 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  32.39 
 
 		 262 aa  97.4  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  31.6 
 
 		 275 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  32 
 
 		 275 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  32.43 
 
 		 267 aa  95.9  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  32.17 
 
 		 261 aa  95.1  9e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1629  3-oxoadipate enol-lactonase  30.12 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  34.5 
 
 		 391 aa  93.6  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 		 271 aa  93.6  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  30.65 
 
 		 260 aa  93.2  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  29.57 
 
 		 271 aa  93.2  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  32.95 
 
 		 256 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  32.95 
 
 		 256 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  29.57 
 
 		 260 aa  92  8e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  32.95 
 
 		 256 aa  92  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  29.6 
 
 		 270 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  34.12 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  31.91 
 
 		 263 aa  90.1  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 		 279 aa  89.7  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  30.8 
 
 		 263 aa  89.4  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  33.84 
 
 		 393 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  25.3 
 
 		 276 aa  89.4  6e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  29.6 
 
 		 270 aa  89.4  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  30.31 
 
 		 299 aa  89.4  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 		 270 aa  89  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  31.78 
 
 		 256 aa  88.6  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  28.52 
 
 		 270 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 		 270 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 270 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  32.7 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  32.21 
 
 		 251 aa  87.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 		 288 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  28.91 
 
 		 265 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  31.35 
 
 		 294 aa  86.7  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  28.16 
 
 		 282 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  34.96 
 
 		 267 aa  86.3  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  25.64 
 
 		 286 aa  86.3  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  30.59 
 
 		 265 aa  85.9  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  29.02 
 
 		 267 aa  85.9  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  28.24 
 
 		 262 aa  85.9  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  27.76 
 
 		 277 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  32 
 
 		 259 aa  85.5  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  30.36 
 
 		 292 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 		 277 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0317  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  29.84 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  30.86 
 
 		 284 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3232  3-oxoadipate enol-lactonase  29.92 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  32.61 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  26.47 
 
 		 286 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  28.69 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  27.86 
 
 		 289 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1435  alpha/beta hydrolase fold protein  30.58 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.426403  normal  0.727578 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6154  alpha/beta hydrolase fold  33.73 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  32.24 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3061  alpha/beta hydrolase fold  31.14 
 
 		 280 aa  82.4  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  28.52 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  30.86 
 
 		 274 aa  82.4  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2455  3-oxoadipate enol-lactonase  30.43 
 
 		 270 aa  82.4  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.2187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  31.42 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  27.31 
 
 		 263 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  25.4 
 
 		 277 aa  82  0.000000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2062  3-oxoadipate enol-lactonase  29.96 
 
 		 270 aa  82  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  31.05 
 
 		 279 aa  82  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  32.13 
 
 		 271 aa  82  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 		 289 aa  82  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  27.35 
 
 		 282 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  31.25 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  29.08 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0502  alpha/beta hydrolase fold  21.37 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>