More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4456 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4456  aminotransferase class V  100 
 
 		 390 aa  754    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.259181  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4344  aminotransferase class V  88.97 
 
 		 390 aa  671    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3976  aminotransferase class V  88.97 
 
 		 390 aa  634  1e-180  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0693  aminotransferase class V  72.94 
 
 		 389 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456582  normal  0.0363239 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5849  aminotransferase class V  68.8 
 
 		 391 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.402198  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5110  aminotransferase class V  69.82 
 
 		 391 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400085 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3263  aminotransferase class V  52.89 
 
 		 400 aa  333  4e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.867544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0097  aminotransferase class V  47.83 
 
 		 393 aa  320  3e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.765035 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2842  aminotransferase, class V  51.44 
 
 		 390 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.335939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4470  aminotransferase class V  51.81 
 
 		 424 aa  307  3e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.425504 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2434  cysteine desulfurase  48.68 
 
 		 387 aa  300  3e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2027  aminotransferase, class V  51.36 
 
 		 368 aa  297  3e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.159236  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2741  aminotransferase class V  51.56 
 
 		 390 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.653056  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3965  cysteine desulfurase  50.9 
 
 		 387 aa  296  6e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.707417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  47.59 
 
 		 383 aa  293  3e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_004310  BR0930  cysteine desulfurase, putative  46.51 
 
 		 392 aa  293  5e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0484195  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0924  putative cysteine desulfurase  46.51 
 
 		 392 aa  291  1e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1609  aminotransferase class V  46.72 
 
 		 392 aa  289  6e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129216 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2257  aminotransferase class V  45.66 
 
 		 386 aa  288  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2108  aminotransferase class V  44.33 
 
 		 405 aa  286  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44473  normal  0.0661399 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1665  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  48.28 
 
 		 393 aa  281  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.502772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1312  aminotransferase, class V  44.72 
 
 		 387 aa  279  5e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.085766  normal  0.715303 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1649  aminotransferase, class V  45.71 
 
 		 385 aa  277  2e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251188  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  44.82 
 
 		 379 aa  276  3e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  40.66 
 
 		 401 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  41.39 
 
 		 400 aa  273  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2995  aminotransferase, class V  48.71 
 
 		 388 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0581835 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1901  aminotransferase class V  44.03 
 
 		 388 aa  272  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391908 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1469  aminotransferase class V  45.99 
 
 		 402 aa  269  5.9999999999999995e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.747649  normal  0.0112306 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0809  aminotransferase, class V  42.52 
 
 		 382 aa  269  7e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0512399  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  42.55 
 
 		 382 aa  267  2e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0809  aminotransferase, class V  42.93 
 
 		 382 aa  266  4e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2455  aminotransferase, class V  50.78 
 
 		 390 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2884  cysteine desulfurase  46.77 
 
 		 373 aa  265  1e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  43.49 
 
 		 394 aa  264  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  40.57 
 
 		 414 aa  263  3e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  39.69 
 
 		 402 aa  263  3e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  40.31 
 
 		 401 aa  263  6e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  41.41 
 
 		 396 aa  262  8.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2329  aminotransferase, class V  47.37 
 
 		 399 aa  261  1e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  40.52 
 
 		 392 aa  260  3e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  38.44 
 
 		 392 aa  260  3e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  41.64 
 
 		 398 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1782  aminotransferase, class V  44.5 
 
 		 388 aa  259  6e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  45.19 
 
 		 1135 aa  258  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  44.35 
 
 		 386 aa  254  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2729  aminotransferase, class V  44.22 
 
 		 408 aa  254  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560546  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  39.28 
 
 		 398 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  41.82 
 
 		 407 aa  254  3e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  41.15 
 
 		 384 aa  251  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  39.64 
 
 		 397 aa  251  2e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  39.07 
 
 		 394 aa  250  3e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  40.32 
 
 		 401 aa  249  5e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2587  aminotransferase class V  47.2 
 
 		 377 aa  247  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.577396  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  38.8 
 
 		 396 aa  247  3e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  42.04 
 
 		 403 aa  246  3e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  45.29 
 
 		 393 aa  247  3e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  37.17 
 
 		 384 aa  246  4e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  39.74 
 
 		 388 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  41.73 
 
 		 389 aa  246  6e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  38.3 
 
 		 398 aa  246  6e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  38.22 
 
 		 394 aa  244  9.999999999999999e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  41.47 
 
 		 389 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0188  aminotransferase class V  46.39 
 
 		 382 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.431625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  40.76 
 
 		 398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  39.53 
 
 		 391 aa  243  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0675  aminotransferase, class V  43.38 
 
 		 385 aa  244  3e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00811405  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0199  aminotransferase, class V  42.12 
 
 		 382 aa  243  6e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0595  putative pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase  43.48 
 
 		 390 aa  242  7e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  41.86 
 
 		 380 aa  242  7e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  42.7 
 
 		 380 aa  241  1e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0872  cysteine desulfurase  43.7 
 
 		 380 aa  241  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0149083 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2409  aminotransferase class V  43.83 
 
 		 400 aa  241  1e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1104  aminotransferase class V  45.83 
 
 		 381 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  36.91 
 
 		 393 aa  241  2e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0617  aminotransferase class V  45.95 
 
 		 388 aa  240  2.9999999999999997e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.314376  normal  0.0656763 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4451  aminotransferase, class V  43.31 
 
 		 397 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  42.67 
 
 		 394 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  36.98 
 
 		 384 aa  240  4e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  37.7 
 
 		 394 aa  239  4e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  40.42 
 
 		 381 aa  239  5e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8110  Cysteine desulfurase  41.67 
 
 		 387 aa  239  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  40.84 
 
 		 399 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1949  aminotransferase, class V  44.76 
 
 		 385 aa  239  5.999999999999999e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000781244  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10430  cysteine desulfurase family protein  42.46 
 
 		 412 aa  239  5.999999999999999e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  39.64 
 
 		 389 aa  239  8e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0981  aminotransferase, class V  42.75 
 
 		 407 aa  239  8e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2808  aminotransferase, class V  42.44 
 
 		 379 aa  239  9e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  40.16 
 
 		 404 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  37.34 
 
 		 398 aa  238  1e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0628  rrf2/aminotransferase, class V family protein  35.62 
 
 		 492 aa  238  1e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.54422  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1085  aminotransferase, class V  43.01 
 
 		 407 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  37.86 
 
 		 388 aa  238  1e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0705  aminotransferase, class V  37.87 
 
 		 378 aa  237  2e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  42.39 
 
 		 422 aa  238  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  43.97 
 
 		 1143 aa  238  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  43.04 
 
 		 410 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  36.2 
 
 		 398 aa  236  5.0000000000000005e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  39.32 
 
 		 381 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  40.36 
 
 		 393 aa  236  5.0000000000000005e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>