More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3815 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3815  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 125 aa  250  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  54.03 
 
 		 134 aa  142  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  53.51 
 
 		 150 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  58.56 
 
 		 131 aa  133  9e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  52.21 
 
 		 135 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2281  HxlR family transcriptional regulator  54.1 
 
 		 124 aa  132  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  53.64 
 
 		 135 aa  131  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  53.64 
 
 		 135 aa  131  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2385  transcriptional regulator, HxlR family  52.25 
 
 		 135 aa  124  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  51.35 
 
 		 135 aa  124  6e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1242  hypothetical protein  47.83 
 
 		 159 aa  123  9e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2650  transcriptional regulator, HxlR family  50.89 
 
 		 130 aa  121  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116917  normal  0.771114 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1367  HxlR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 126 aa  120  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269622 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6661  transcriptional regulator, HxlR family  50.89 
 
 		 131 aa  120  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.762172 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6638  transcriptional regulator, HxlR family  46.83 
 
 		 134 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4164  HxlR family transcriptional regulator  50.93 
 
 		 122 aa  119  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596618  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2138  hypothetical protein  49.11 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.30336  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05353  hypothetical protein  51.96 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.387591  normal  0.848219 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  54.72 
 
 		 129 aa  115  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1179  HxlR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 137 aa  114  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 180 aa  113  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0615  transcriptional regulator protein-like protein  50.42 
 
 		 168 aa  112  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2124  HxlR family transcriptional regulator  49.14 
 
 		 136 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235971  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2400  HxlR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.956461  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  47.41 
 
 		 160 aa  110  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4023  helix-turn-helix HxlR type  46.96 
 
 		 163 aa  110  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259288  normal  0.513403 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6178  transcriptional regulator, HxlR family  51.38 
 
 		 135 aa  110  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0462511 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 125 aa  110  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4817  HxlR family transcriptional regulator  52.88 
 
 		 133 aa  110  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4392  transcriptional regulator, HxlR family  46.96 
 
 		 163 aa  110  9e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.201066 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0163  HxlR family transcriptional regulator  50.96 
 
 		 144 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379253  hitchhiker  0.00857335 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8738  putative transcriptional regulator  50.47 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2843  putative transcriptional regulator  46.3 
 
 		 133 aa  105  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0861419  normal  0.0924063 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2792  hypothetical protein  42.86 
 
 		 136 aa  105  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  46.43 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1728  HxlR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1620  putative transcriptional regulator  46.3 
 
 		 133 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0184  HxlR family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 144 aa  104  5e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4151  HxlR family transcriptional regulator  49.04 
 
 		 134 aa  103  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  47.37 
 
 		 148 aa  103  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2523  transcriptional regulator  47.66 
 
 		 135 aa  103  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  45.28 
 
 		 128 aa  103  8e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0639  transcriptional regulator, HxlR family  42.37 
 
 		 124 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1971  HxlR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 134 aa  102  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1490  HxlR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.263711 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2765  transcriptional regulator, HxlR family  43.52 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340614  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4845  HxlR family transcriptional regulator  49.53 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.686423  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6779  transcriptional regulator, HxlR family  42.98 
 
 		 132 aa  101  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 121 aa  101  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3135  PadR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  44.76 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2876  transcriptional regulator, HxlR family  51.06 
 
 		 133 aa  100  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4262  transcriptional regulator, HxlR family  41.74 
 
 		 144 aa  100  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388354  normal  0.116604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  45.1 
 
 		 132 aa  100  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  45.28 
 
 		 124 aa  100  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4646  transcriptional regulator, HxlR family  46.88 
 
 		 136 aa  99.8  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.28367 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3189  transcriptional regulator, putative  43.81 
 
 		 146 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0929776  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0897  PadR family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 154 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  43.52 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  40.71 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0523  HxlR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 135 aa  99  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2016  transcriptional regulator, putative  44.34 
 
 		 171 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5290  transcriptional regulator, HxlR family  44.23 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2730  PadR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 154 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.42105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3172  PadR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 174 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767015  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5823  transcriptional regulator, HxlR family  47.11 
 
 		 155 aa  98.6  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0742243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1879  PadR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 174 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3391  transcriptional regulator, HxlR family  40.95 
 
 		 125 aa  98.6  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4243  transcriptional regulator, HxlR family  44.17 
 
 		 122 aa  98.2  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1800  putative transcriptional regulator  43.69 
 
 		 128 aa  98.2  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1296  HxlR family transcriptional regulator  52.48 
 
 		 159 aa  98.2  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0218186  normal  0.682914 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2871  HxlR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 141 aa  97.8  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2619  putative transcriptional regulator  43.12 
 
 		 164 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.329844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1731  putative transcriptional regulator  45.71 
 
 		 144 aa  97.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2608  transcriptional regulator, HxlR family  42.48 
 
 		 175 aa  97.4  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2311  transcriptional regulator, HxlR family  42.2 
 
 		 124 aa  97.1  7e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272645  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0324  transcriptional regulator protein-like protein  49.56 
 
 		 272 aa  97.1  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2295  transcriptional regulator, HxlR family  41.18 
 
 		 134 aa  96.7  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 121 aa  97.1  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4610  transcriptional regulator, HxlR family  45.79 
 
 		 144 aa  96.7  8e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3423  transcriptional regulator, HxlR family  43.56 
 
 		 127 aa  96.7  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.201208  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2439  HxlR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 130 aa  96.3  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.520251  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0618  HxlR family transcriptional regulator  50.51 
 
 		 157 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00866972 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1455  transcriptional regulator, HxlR family  41.23 
 
 		 146 aa  95.9  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0278  putative transcriptional regulator  47.12 
 
 		 128 aa  95.5  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.640242  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2994  helix-turn-helix, HxlR type  44.12 
 
 		 130 aa  95.9  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4732  transcriptional regulator, HxlR family  45.54 
 
 		 128 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03748  transcriptional regulatory protein  48.54 
 
 		 120 aa  95.5  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  49.43 
 
 		 140 aa  95.1  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3681  transcriptional regulator, HxlR family  42.42 
 
 		 101 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0324  transcriptional regulator, HxlR family  45.1 
 
 		 130 aa  94.7  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.948926  normal  0.0884753 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1015  HxlR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 144 aa  95.1  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0428333  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34580  predicted transcriptional regulator  40.17 
 
 		 142 aa  94.7  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00510828  normal  0.627972 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  43.14 
 
 		 132 aa  94.7  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4706  transcriptional regulator, HxlR family  37.84 
 
 		 143 aa  94.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222658  normal  0.87312 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 146 aa  94.4  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0621  HxlR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 140 aa  94.4  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>