More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3246 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3246  flagellar basal body rod protein FlgF  100 
 
 
246 aa  494  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28847  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3272  flagellar basal body rod protein FlgF  94.31 
 
 
246 aa  471  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3048  flagellar basal body rod protein FlgF  93.5 
 
 
246 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0822  flagellar basal body rod protein FlgF  79.27 
 
 
246 aa  395  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.743274  hitchhiker  0.00942919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4713  flagellar basal body rod protein FlgF  68.98 
 
 
248 aa  347  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15806  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4198  flagellar basal body rod protein FlgF  68.57 
 
 
248 aa  344  8.999999999999999e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1684  flagellar basal body rod protein FlgF  46.61 
 
 
253 aa  231  6e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.081345 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3786  flagellar basal body rod protein FlgF  47.01 
 
 
253 aa  228  7e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.236976  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1384  flagellar basal body rod protein FlgF  47.24 
 
 
255 aa  225  5.0000000000000005e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1122  flagellar basal body rod protein FlgF  47.43 
 
 
255 aa  223  2e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4422  flagellar basal body rod protein FlgF  47.41 
 
 
253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1507  flagellar basal body rod protein FlgF  48.41 
 
 
254 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.75995 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2562  flagellar basal body rod protein  42.91 
 
 
256 aa  194  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.421926 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5509  flagellar basal body rod protein FlgF  44.66 
 
 
254 aa  189  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0521919  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2842  hypothetical protein  41.95 
 
 
245 aa  177  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0123  putative flagellar basal-body rod protein flgF  42.86 
 
 
244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7254  putative flagellar basal-body rod protein flgF  39 
 
 
246 aa  162  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15646  normal  0.352319 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2138  flagellar basal body rod protein  41.05 
 
 
244 aa  151  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2294  flagellar basal body rod protein  40.61 
 
 
244 aa  148  7e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1432  flagellar basal body rod protein  35.57 
 
 
245 aa  137  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2114  flagellar basal body rod protein FlgF  36.6 
 
 
238 aa  135  6.0000000000000005e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2988  flagellar basal body rod protein FlgF  36.33 
 
 
239 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3477  flagellar basal body rod protein  34.43 
 
 
247 aa  132  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.44174  normal  0.204682 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1327  flagellar basal body rod protein FlgF  35.92 
 
 
239 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.602873  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3052  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.6 
 
 
242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2729  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.38 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000014891 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0333  flagellar basal-body rod protein FlgG  37.55 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.33 
 
 
260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3789  flagellar basal body rod protein FlgG  36.43 
 
 
262 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0145  flagellar basal body rod protein FlgG  36.43 
 
 
262 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2232  flagellar basal body rod protein  39.22 
 
 
242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.3997  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2922  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.11 
 
 
244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1148  protein of unknown function DUF1078 domain protein  34.35 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000141838  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3101  flagellar basal body rod protein  32.6 
 
 
269 aa  126  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3282  flagellar basal body rod protein  33.33 
 
 
258 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2604  flagellar basal body rod protein FlgF  34.29 
 
 
239 aa  125  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.729384  hitchhiker  0.000530741 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0154  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.88 
 
 
263 aa  125  6e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.469359  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3330  flagellar basal body rod protein FlgG  35.74 
 
 
262 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0467  flagellar basal body rod protein FlgG  35.74 
 
 
262 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0430  hypothetical protein  34.94 
 
 
242 aa  125  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2094  flagellar basal body rod protein FlgG  35.74 
 
 
262 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2953  flagellar basal body rod protein FlgG  36.05 
 
 
262 aa  125  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0271  flagellar basal body rod protein FlgG  35.74 
 
 
262 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835224  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3349  flagellar basal body rod protein FlgG  35.74 
 
 
262 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2999  flagellar basal body rod protein FlgG  35.74 
 
 
262 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0283  flagellar basal body rod protein FlgG  35.74 
 
 
262 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172295  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3015  flagellar basal body rod protein FlgG  35.36 
 
 
262 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0245  flagellar basal body rod protein FlgG  36.12 
 
 
262 aa  124  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16580  flagellar basal body rod protein  31.68 
 
 
248 aa  124  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4107  flagellar basal body rod protein  35.74 
 
 
244 aa  124  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4786  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.16 
 
 
260 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3709  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.16 
 
 
260 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.409593 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3251  flagellar basal body rod protein FlgF  35.63 
 
 
238 aa  122  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0110  flagellar basal body rod protein  31.23 
 
 
251 aa  122  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000015069  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6366  flagellar basal body rod protein FlgG  36.12 
 
 
262 aa  122  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2930  flagellar basal body rod protein FlgG  35.36 
 
 
262 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3065  flagellar basal body rod protein FlgG  35.36 
 
 
262 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.798447  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3039  flagellar basal body rod protein FlgG  35.36 
 
 
262 aa  121  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1530  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.45 
 
 
260 aa  121  9e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.248852  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3020  flagellar basal body rod protein FlgG  35.36 
 
 
262 aa  121  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0744424  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2406  flagellar basal body rod protein FlgG  35.36 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.933981  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1940  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.29 
 
 
262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0320  flagellar basal body rod protein FlgG  35.47 
 
 
262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3475  flagellar basal body rod protein FlgG  35.69 
 
 
262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1146  putative flagellar basal-body rod protein FlgF  33.73 
 
 
244 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2923  flagellar basal-body rod FlgG  35.27 
 
 
263 aa  119  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1222  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.8 
 
 
263 aa  118  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1250  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.62 
 
 
261 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.322424  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1205  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.62 
 
 
261 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01007  flagellar basal body rod protein FlgG  34.73 
 
 
261 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.254685  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0710  flagellar basal-body rod protein FlgF  32.03 
 
 
255 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1339  fagellar hook-basal body protein  31.94 
 
 
282 aa  118  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06159  flagellar basal body rod protein FlgG  34.73 
 
 
261 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0237058  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3763  flagellar basal body rod protein  36.8 
 
 
238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1266  flagellar basal body rod protein FlgG  36.22 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.17083  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2337  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.44 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0628  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.42 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5510  flagellar basal body rod protein FlgG  35.29 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356896  normal  0.858095 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1141  flagellar basal body rod protein FlgG  33.58 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0111  hypothetical protein  34.17 
 
 
266 aa  116  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000402789  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4423  flagellar basal body rod protein FlgG  32.94 
 
 
262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0431  flagellar basal body rod protein FlgG  34.22 
 
 
262 aa  115  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0314  flagellar basal body rod protein FlgF  33.06 
 
 
244 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0466  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.31 
 
 
261 aa  115  6e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1632  flagellar basal body rod protein FlgG  35.02 
 
 
260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.865397  normal  0.885365 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0268  flagellar basal body rod protein FlgG  34.63 
 
 
261 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2517  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.77 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0922  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.21 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4712  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.77 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.374892  normal  0.0910143 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2338  flagellar basal body rod protein  33.48 
 
 
255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0110008  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3787  flagellar basal body rod protein FlgG  32.55 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0961005  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1873  flagellar basal body rod protein FlgG  35.8 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3366  flagellar basal body rod protein FlgG  34.63 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0898  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.43 
 
 
261 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3051  flagellar basal body rod protein FlgG  33.08 
 
 
262 aa  113  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2373  hypothetical protein  33.59 
 
 
261 aa  113  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1506  flagellar basal body rod protein FlgG  33.73 
 
 
262 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3832  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.46 
 
 
260 aa  113  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.405725  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1107  flagellar basal body rod protein FlgG  33.2 
 
 
262 aa  113  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4676  flagellar basal body rod protein FlgG  34.63 
 
 
261 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103998 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>