More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2604 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2604  signal transduction histidine kinase glucose-6-phosphate-like protein  100 
 
 		 495 aa  967    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3849  histidine kinase  47.17 
 
 		 497 aa  335  1e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1786  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  40.65 
 
 		 479 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.663112  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0814  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  30.37 
 
 		 466 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000114737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5940  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  33.97 
 
 		 448 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0778  methanol utilization control sensor protein moxY, putative  28.78 
 
 		 439 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.125881  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2272  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.36 
 
 		 471 aa  117  6e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2641  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 468 aa  113  8.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0302  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 		 560 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.09388 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5349  two-component sensor histidine kinase  34.35 
 
 		 452 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0266421 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0817  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  34.12 
 
 		 466 aa  109  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000394288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.26 
 
 		 439 aa  108  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 		 424 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0243  histidine kinase  33.23 
 
 		 490 aa  106  8e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127323 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6074  putative two-component sensor histidine kinase  34.03 
 
 		 521 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2472  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 		 336 aa  101  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.651291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3092  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 425 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.300177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4966  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 		 506 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.111121  normal  0.0306012 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4452  ATPase domain-containing protein  34.6 
 
 		 509 aa  99  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.570646 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4916  histidine kinase  34.88 
 
 		 509 aa  97.4  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.69179 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6780  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 		 476 aa  97.1  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0356204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 468 aa  96.7  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7262  histidine kinase  31.27 
 
 		 453 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.374696  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2854  histidine kinase  34.11 
 
 		 468 aa  95.9  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0477  two-component sensor histidine kinase  32.82 
 
 		 488 aa  95.1  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7524  histidine kinase  33.66 
 
 		 477 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293229  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2903  transmembrane sensor kinase vsrA transcription regulator protein  33.33 
 
 		 459 aa  95.5  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3151  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.06 
 
 		 453 aa  94.7  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1701  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 521 aa  94.7  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279897 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3956  histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  32.37 
 
 		 323 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1668  histidine kinase  35.78 
 
 		 298 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  29.92 
 
 		 482 aa  94.7  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3830  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 		 496 aa  95.1  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270261 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0321  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 476 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 770 aa  94.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5445  histidine kinase  31.56 
 
 		 478 aa  94  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.403934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2235  histidine kinase  31.44 
 
 		 457 aa  94  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1932  Signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 492 aa  93.6  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1432  sensory box histidine kinase/response regulator  32.41 
 
 		 492 aa  93.2  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188442  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0484  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 473 aa  93.6  8e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1842  response regulator/sensory box histidine kinase  32.41 
 
 		 492 aa  93.2  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0472  sensory box histidine kinase/response regulator  32.41 
 
 		 492 aa  93.2  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.798891  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0176  sensory box histidine kinase/response regulator  32.41 
 
 		 492 aa  93.2  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0910  sensory box histidine kinase/response regulator  32.41 
 
 		 463 aa  92.8  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  32.28 
 
 		 373 aa  92.8  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0380  sensory box histidine kinase/response regulator  32.41 
 
 		 463 aa  93.2  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 771 aa  92.8  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 447 aa  92.4  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0623  sensor protein UhpB  30.56 
 
 		 527 aa  92  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 352 aa  92  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  36.71 
 
 		 1809 aa  92  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2833  histidine kinase  32.81 
 
 		 447 aa  92.4  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.665069  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0476  histidine kinase  34.66 
 
 		 464 aa  91.3  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2127  sensor histidine kinase  34.16 
 
 		 313 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289713  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3495  signal transduction histidine kinase-like protein  35.34 
 
 		 410 aa  91.3  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0736574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 421 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222367  normal  0.821107 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4034  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 775 aa  90.5  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 748 aa  90.5  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  34.29 
 
 		 489 aa  90.1  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3394  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 		 493 aa  90.1  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.12188 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 412 aa  89.4  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 		 298 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.753486  normal  0.27992 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0123  sensor histidine kinase  35.9 
 
 		 466 aa  89  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0880  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 446 aa  88.6  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263045  normal  0.427062 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 		 472 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.935643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3080  bacteriophytochrome  33.33 
 
 		 783 aa  88.6  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 		 1168 aa  88.6  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1808  histidine kinase  32.35 
 
 		 461 aa  88.6  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6236  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 553 aa  88.2  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.914679 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  35.06 
 
 		 772 aa  88.6  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  33.48 
 
 		 683 aa  86.7  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0835  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 513 aa  86.3  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.506396  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 		 424 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.345137  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  31.17 
 
 		 403 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1009  sensory box histidine kinase/response regulator  31.76 
 
 		 463 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 		 386 aa  85.9  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0092  histidine kinase  32.64 
 
 		 461 aa  84.7  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 775 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0921  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 		 446 aa  85.1  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  29.61 
 
 		 456 aa  84.3  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 703 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3863  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 446 aa  84  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.165954  normal  0.826823 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 513 aa  84.3  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.87 
 
 		 526 aa  83.6  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6559  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 541 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1027  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  33.93 
 
 		 456 aa  83.2  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1894  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 546 aa  82.8  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.640259  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  32.69 
 
 		 367 aa  83.2  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5078  histidine kinase  31.33 
 
 		 368 aa  82.8  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2483  histidine kinase  33.62 
 
 		 514 aa  82.8  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.705062  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1783  histidine kinase  34.04 
 
 		 501 aa  83.2  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1644  histidine kinase  32.34 
 
 		 296 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.518526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3059  histidine kinase  31.15 
 
 		 459 aa  82  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548972  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0133  sensory histidine kinase UhpB  31.65 
 
 		 513 aa  82  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 573 aa  82  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000284252 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 		 552 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2723  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  29.62 
 
 		 486 aa  82.4  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208049 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  27.43 
 
 		 388 aa  82  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5809  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.250191 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 484 aa  81.3  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0729257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>