More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2274 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  100 
 
 		 291 aa  590  1e-167  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  75.53 
 
 		 283 aa  446  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  73.08 
 
 		 289 aa  434  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  70.92 
 
 		 286 aa  412  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  68.68 
 
 		 274 aa  400  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  69.76 
 
 		 283 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  72.83 
 
 		 304 aa  402  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  69.76 
 
 		 283 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  66.2 
 
 		 278 aa  397  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  66.55 
 
 		 276 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  62.32 
 
 		 276 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  65.69 
 
 		 275 aa  363  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5690  Alpha/beta hydrolase fold  70.85 
 
 		 283 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  60.43 
 
 		 273 aa  347  1e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  55.12 
 
 		 278 aa  320  1.9999999999999998e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  54.51 
 
 		 279 aa  316  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  52.69 
 
 		 288 aa  315  4e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  48.38 
 
 		 282 aa  270  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  48.75 
 
 		 283 aa  258  9e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  44.24 
 
 		 273 aa  240  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  45 
 
 		 282 aa  239  4e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  46.4 
 
 		 271 aa  234  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1464  alpha/beta hydrolase fold protein  35.77 
 
 		 279 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3884  alpha/beta hydrolase fold  35.11 
 
 		 286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.330831  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  36.92 
 
 		 291 aa  162  6e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  38.78 
 
 		 284 aa  159  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  37.45 
 
 		 302 aa  156  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  36.5 
 
 		 277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  37.37 
 
 		 289 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  38.27 
 
 		 289 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  35.09 
 
 		 277 aa  150  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  35.23 
 
 		 289 aa  147  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  31.02 
 
 		 279 aa  144  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  37.31 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0210  alpha/beta hydrolase fold  35.51 
 
 		 279 aa  143  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  35.11 
 
 		 288 aa  142  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  31.29 
 
 		 295 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4895  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 		 282 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0335992  normal  0.294667 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  34.59 
 
 		 289 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  36.64 
 
 		 288 aa  138  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  34.4 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  35.92 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  35.11 
 
 		 288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 		 299 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 		 299 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 		 299 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 		 287 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  30.69 
 
 		 294 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  35.45 
 
 		 298 aa  135  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  34.46 
 
 		 285 aa  133  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  34.86 
 
 		 286 aa  133  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 		 277 aa  132  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  35.04 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  35.04 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  35.27 
 
 		 285 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  31.39 
 
 		 283 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  31.39 
 
 		 298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4525  alpha/beta hydrolase fold  32.09 
 
 		 290 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  33.68 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  31.41 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0424  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  33.8 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3276  alpha/beta hydrolase fold  33.68 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0380  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  33.68 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615144  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00303  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  33.68 
 
 		 293 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0413  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  33.68 
 
 		 293 aa  127  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00307  hypothetical protein  33.68 
 
 		 293 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0373  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  33.68 
 
 		 293 aa  127  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2894  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 		 287 aa  125  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2898  alpha/beta hydrolase fold  32.96 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14294 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0068  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 297 aa  123  4e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  32.45 
 
 		 285 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  33.58 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  30.64 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  32.61 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 		 275 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0888  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 		 282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  30.62 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  34.26 
 
 		 312 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3690  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 		 276 aa  107  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 		 345 aa  106  5e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  31.6 
 
 		 315 aa  105  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 		 271 aa  105  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  29.54 
 
 		 312 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  29.62 
 
 		 286 aa  103  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 		 314 aa  102  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  29.18 
 
 		 286 aa  102  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  30.96 
 
 		 296 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  30.21 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 309 aa  100  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 		 283 aa  97.8  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 		 278 aa  97.1  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4238  alpha/beta hydrolase fold  33.07 
 
 		 274 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.919736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  30.9 
 
 		 298 aa  96.7  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 		 308 aa  96.3  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1023  alpha/beta family hydrolase  29.21 
 
 		 287 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  31.11 
 
 		 284 aa  94.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.37 
 
 		 285 aa  93.6  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 		 301 aa  94  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>