288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1785 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1785  hypothetical protein  100 
 
 		 419 aa  818    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.928092 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2326  HI0933 family protein  69.17 
 
 		 412 aa  538  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2458  hypothetical protein  66.43 
 
 		 424 aa  535  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2187  hypothetical protein  64.46 
 
 		 458 aa  532  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1738  putative transmembrane protein  69.76 
 
 		 429 aa  529  1e-149  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2266  HI0933-like protein  62.64 
 
 		 468 aa  531  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1505  HI0933 family protein  66.28 
 
 		 447 aa  521  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2353  hypothetical protein  66.05 
 
 		 447 aa  519  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.839309  normal  0.656811 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5009  putative flavoprotein oxidoreductase  66.02 
 
 		 421 aa  518  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438649  normal  0.35364 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2737  hypothetical protein  63.29 
 
 		 422 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2895  HI0933-like protein  60.49 
 
 		 452 aa  513  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2642  hypothetical protein  63.27 
 
 		 482 aa  510  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.148126  normal  0.0148984 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4296  hypothetical protein  63.22 
 
 		 424 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.865615 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3538  HI0933 family protein  63.34 
 
 		 421 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.570912  normal  0.174633 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0420  putative transmembrane protein, NAD(FAD)-binding  64.18 
 
 		 430 aa  501  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4919  hypothetical protein  63.14 
 
 		 425 aa  501  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000084695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3600  HI0933 family protein  62.95 
 
 		 422 aa  498  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.777632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4677  HI0933 family protein  62.95 
 
 		 422 aa  498  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3158  putative transmembrane protein  62.23 
 
 		 425 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3007  hypothetical protein  62.2 
 
 		 402 aa  491  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4765  hypothetical protein  61.95 
 
 		 412 aa  484  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0079112  decreased coverage  0.00101931 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4904  hypothetical protein  60.37 
 
 		 458 aa  486  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4663  hypothetical protein  61.26 
 
 		 412 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4640  hypothetical protein  61.95 
 
 		 412 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000626559  hitchhiker  0.00685408 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0655  hypothetical protein  61.86 
 
 		 424 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000115775  normal  0.464819 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4778  hypothetical protein  61.76 
 
 		 413 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000103411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10020  HI0933-like protein  64.13 
 
 		 410 aa  471  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.148718  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12770  hypothetical protein  62.66 
 
 		 391 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01510  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  59.33 
 
 		 420 aa  468  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185858  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0455  HI0933 family protein  63.38 
 
 		 432 aa  466  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1159  hypothetical protein  61.61 
 
 		 491 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11907  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0087  hypothetical protein  61.56 
 
 		 413 aa  463  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3724  hypothetical protein  61.71 
 
 		 413 aa  443  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1434  HI0933 family protein  57.46 
 
 		 415 aa  422  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.952569  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1040  hypothetical protein  53.14 
 
 		 402 aa  419  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1005  hypothetical protein  52.9 
 
 		 402 aa  419  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3818  hypothetical protein  56.48 
 
 		 404 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0364  hypothetical protein  50.97 
 
 		 411 aa  412  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0113097  normal  0.426406 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1089  hypothetical protein  57.79 
 
 		 458 aa  414  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1520  hypothetical protein  55.5 
 
 		 411 aa  406  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3798  HI0933 family protein  54.63 
 
 		 402 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2553  HI0933-like protein  54.5 
 
 		 409 aa  403  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3503  HI0933 family protein  56.1 
 
 		 416 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849047 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2125  hypothetical protein  50.85 
 
 		 406 aa  393  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2481  HI0933 family protein  53.4 
 
 		 411 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0212712  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4321  hypothetical protein  52.64 
 
 		 390 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3204  HI0933-like protein  56.07 
 
 		 410 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0839  HI0933 family protein  53.53 
 
 		 407 aa  382  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.612434  normal  0.0181973 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2154  hypothetical protein  54.01 
 
 		 408 aa  380  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3087  HI0933-like protein  54.31 
 
 		 409 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  0.202515 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0879  hypothetical protein  53.77 
 
 		 407 aa  375  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0364773 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2251  HI0933-like protein  54.01 
 
 		 414 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294962  normal  0.0473731 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4913  HI0933 family protein  54.5 
 
 		 419 aa  368  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159614  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0453  hypothetical protein  51.71 
 
 		 406 aa  367  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.881492 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3585  hypothetical protein  53.12 
 
 		 395 aa  364  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0593  HI0933 family protein  53.75 
 
 		 416 aa  364  2e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.568345  hitchhiker  0.000690115 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3248  hypothetical protein  52.3 
 
 		 402 aa  361  2e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4431  hypothetical protein  52.18 
 
 		 409 aa  356  3.9999999999999996e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.803445  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4371  hypothetical protein  52.44 
 
 		 404 aa  350  2e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3911  HI0933 family protein  49.64 
 
 		 428 aa  342  5e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0041  HI0933-like protein  50.24 
 
 		 399 aa  342  9e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.32138 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0805  HI0933 family protein  52.5 
 
 		 414 aa  340  4e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.368814  normal  0.0281532 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0836  putative flavoprotein  51.24 
 
 		 392 aa  333  3e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.538979  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2494  hypothetical protein  51.24 
 
 		 392 aa  333  3e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1928  hypothetical protein  50.99 
 
 		 429 aa  331  1e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.744933  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0407  HI0933-like protein  50.12 
 
 		 397 aa  329  6e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3139  hypothetical protein  51.49 
 
 		 402 aa  323  5e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.0000634596  decreased coverage  0.0000000576575 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0053  HI0933 family protein  50.49 
 
 		 406 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000927745 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2768  hypothetical protein  48.8 
 
 		 401 aa  309  5e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2010  hypothetical protein  51.02 
 
 		 405 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.170272 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0628  flavoprotein  37.75 
 
 		 398 aa  278  1e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0929211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0187  HI0933 family protein  32.54 
 
 		 433 aa  139  7e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0030  HI0933 family protein  29.79 
 
 		 412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  28.1 
 
 		 430 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  27.96 
 
 		 409 aa  124  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1926  HI0933-like protein  28.07 
 
 		 414 aa  121  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2387  hypothetical protein  29.83 
 
 		 410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2050  hypothetical protein  30.63 
 
 		 419 aa  117  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000118961  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1733  HI0933 family protein  28.04 
 
 		 408 aa  117  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2135  hypothetical protein  28.39 
 
 		 415 aa  117  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00468248  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0908  HI0933 family protein  29.9 
 
 		 426 aa  116  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1197  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  22.97 
 
 		 403 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00144707  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1601  hypothetical protein  26.37 
 
 		 406 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0291  hypothetical protein  28.06 
 
 		 408 aa  114  3e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0927  HI0933 family protein  30.16 
 
 		 408 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1025  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  22.49 
 
 		 403 aa  111  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0617168  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2378  HI0933 family protein  25.88 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.270996  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1315  hypothetical protein  24.47 
 
 		 420 aa  104  4e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476308  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0861  HI0933 family protein  24.11 
 
 		 412 aa  104  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883164  normal  0.741633 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1810  hypothetical protein  23.92 
 
 		 422 aa  102  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261505  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1845  hypothetical protein  23.92 
 
 		 422 aa  102  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1022  HI0933 family protein  22.73 
 
 		 403 aa  102  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1378  hypothetical protein  28.44 
 
 		 415 aa  101  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.275116 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  24.88 
 
 		 427 aa  100  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1561  hypothetical protein  26 
 
 		 455 aa  99.8  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  25.83 
 
 		 436 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1237  HI0933-like protein  23.29 
 
 		 412 aa  99.4  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3399  HI0933 family protein  26.18 
 
 		 419 aa  99.4  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000862547  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1150  YhiN family flavoprotein  22.51 
 
 		 406 aa  98.6  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.823305  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1339  hypothetical protein  22.51 
 
 		 406 aa  97.8  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0646456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>