More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1658 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1658  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  339  9e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00985169  normal  0.385856 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4157  DNA repair protein RadC  69.68 
 
 		 168 aa  219  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2347  DNA repair protein RadC  57.99 
 
 		 169 aa  198  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00287634  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1252  DNA repair protein RadC  59.35 
 
 		 169 aa  197  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0948  DNA repair protein RadC  63.06 
 
 		 244 aa  195  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.455823  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3339  DNA repair protein RadC  61.78 
 
 		 224 aa  194  5.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0155907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3538  DNA repair protein RadC  56.8 
 
 		 169 aa  193  9e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36040  DNA repair protein RadC-like protein  60.51 
 
 		 168 aa  193  9e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1273  DNA repair protein RadC  60.65 
 
 		 168 aa  193  9e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31260  RadC-like protein  56.55 
 
 		 168 aa  192  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000145795  unclonable  2.34568e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1867  DNA repair protein RadC  58.6 
 
 		 168 aa  192  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2319  DNA repair protein RadC  55.62 
 
 		 169 aa  191  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.094604  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2620  hypothetical protein  58.33 
 
 		 169 aa  191  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.521517 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2636  DNA repair protein RadC  57.32 
 
 		 168 aa  188  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0606643 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4202  DNA repair protein RadC  56.71 
 
 		 164 aa  181  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.21413 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0695  DNA repair protein RadC  67.79 
 
 		 222 aa  178  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.63774 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4033  DNA repair protein RadC  55.21 
 
 		 225 aa  179  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2588  DNA repair protein RadC  58.67 
 
 		 224 aa  177  4.999999999999999e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.16454 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1654  DNA repair protein RadC  60.4 
 
 		 237 aa  175  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0794365  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3252  DNA repair protein RadC  58.39 
 
 		 234 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4376  DNA repair protein RadC  56.67 
 
 		 224 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0839768 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3450  DNA repair protein RadC  60.4 
 
 		 238 aa  170  7.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268052  normal  0.632907 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2777  DNA repair protein RadC  59.73 
 
 		 238 aa  169  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1254  DNA repair protein RadC  61.59 
 
 		 225 aa  169  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2138  DNA repair protein RadC  58 
 
 		 224 aa  167  5e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.574311  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2695  DNA repair protein RadC  62.58 
 
 		 222 aa  167  8e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0315  DNA repair protein RadC  56.34 
 
 		 224 aa  165  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.220116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1134  DNA repair protein RadC  49.7 
 
 		 169 aa  165  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1383  putative DNA repair protein RadC  58.57 
 
 		 158 aa  164  5e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02940  DNA repair protein RadC  56 
 
 		 224 aa  162  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2231  DNA repair protein RadC  65.67 
 
 		 193 aa  160  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.173334  normal  0.265512 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0236  DNA repair protein RadC  56.83 
 
 		 224 aa  159  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3773  DNA repair protein RadC  57.86 
 
 		 237 aa  159  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6095  DNA repair protein RadC  52 
 
 		 224 aa  157  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.872274  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70230  DNA repair protein RadC  52 
 
 		 224 aa  156  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2444  DNA repair protein RadC  52.7 
 
 		 224 aa  155  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.418589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001836  DNA repair protein RadC  50.33 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3564  DNA repair protein RadC  51.33 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.469153  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2555  DNA repair protein RadC  64.18 
 
 		 193 aa  155  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2396  DNA repair protein  53.85 
 
 		 164 aa  155  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2184  DNA repair protein RadC  53.85 
 
 		 164 aa  154  5.0000000000000005e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0946  DNA repair protein RadC  53.85 
 
 		 164 aa  154  6e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0100  DNA repair protein RadC  54 
 
 		 223 aa  152  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3142  DNA repair protein RadC  57.62 
 
 		 226 aa  153  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00442306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0685  DNA repair protein RadC  53.85 
 
 		 164 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.605515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1904  DNA repair protein RadC  55 
 
 		 226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000968261 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1181  DNA repair protein RadC  48.08 
 
 		 165 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.426303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2322  DNA repair protein RadC  51.35 
 
 		 224 aa  151  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0102136 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1455  RadC family DNA repair protein  53.85 
 
 		 157 aa  150  7e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2951  DNA repair protein, RadC family protein  49.66 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.606536  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2712  DNA repair protein RadC  51.35 
 
 		 224 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2732  DNA repair protein RadC  50.67 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2357  DNA repair protein RadC  53.42 
 
 		 160 aa  148  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.162482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2301  DNA repair protein RadC  52.32 
 
 		 224 aa  148  4e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5539  DNA repair protein RadC  49.26 
 
 		 224 aa  147  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5833  DNA repair protein RadC  49.33 
 
 		 257 aa  147  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4181  DNA repair protein RadC  46.47 
 
 		 164 aa  147  9e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0593458  normal  0.95657 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1254  DNA repair protein RadC  49.65 
 
 		 164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.621293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1396  DNA repair protein RadC  49.65 
 
 		 164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2597  DNA repair protein RadC  50.67 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000367988  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0327  DNA repair protein RadC  51.47 
 
 		 225 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000320995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1257  DNA repair protein RadC  51.05 
 
 		 157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.502332 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2861  DNA repair protein RadC  47.34 
 
 		 166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3443  DNA repair protein RadC  56.8 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0794  DNA repair protein RadC  51.01 
 
 		 256 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.132133 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0692  DNA repair protein RadC  48.97 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2972  DNA repair protein RadC  50 
 
 		 224 aa  145  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2664  DNA repair protein RadC  53.57 
 
 		 224 aa  145  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  hitchhiker  0.0000127675 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3005  DNA repair protein RadC  48.65 
 
 		 164 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329509 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001821  DNA repair protein RadC  49.33 
 
 		 224 aa  145  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000198963  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2355  DNA repair protein RadC  49.65 
 
 		 164 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000960813  unclonable  0.000000132381 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08165  DNA repair protein RadC  50.34 
 
 		 305 aa  144  5e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0585  DNA repair protein RadC  48.2 
 
 		 242 aa  144  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0308  RadC family DNA repair protein  50.34 
 
 		 159 aa  144  6e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00747747  hitchhiker  0.00434898 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2419  DNA repair protein RadC  52.21 
 
 		 258 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610645  hitchhiker  0.00254058 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2155  DNA repair protein RadC  49.33 
 
 		 223 aa  144  7.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.365065  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3426  DNA repair protein RadC  47.65 
 
 		 164 aa  144  8.000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334518 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00653  DNA repair protein RadC  48.67 
 
 		 224 aa  144  8.000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2526  DNA repair protein RadC  49.33 
 
 		 257 aa  143  9e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1890  DNA repair protein RadC  49.33 
 
 		 257 aa  143  9e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2501  DNA repair protein RadC  49.33 
 
 		 257 aa  143  9e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.970207  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0818  DNA repair protein RadC  48.3 
 
 		 253 aa  143  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84629 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5335  DNA repair protein RadC  47.71 
 
 		 226 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550179 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3148  DNA repair protein RadC  48.72 
 
 		 259 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.886628  normal  0.925448 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1182  DNA repair protein RadC  49.65 
 
 		 164 aa  142  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2548  DNA repair protein RadC  51.85 
 
 		 258 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1032  DNA repair protein RadC  49.66 
 
 		 160 aa  142  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0377  DNA repair protein RadC  50.37 
 
 		 225 aa  142  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000108999  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0388  DNA repair protein RadC  50.37 
 
 		 225 aa  142  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000131294  hitchhiker  0.0000732355 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3481  DNA repair protein RadC  45.33 
 
 		 233 aa  142  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000421033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0402  DNA repair protein RadC  50.37 
 
 		 225 aa  142  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000130829  hitchhiker  0.000000000166485 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0376  DNA repair protein RadC  50.37 
 
 		 225 aa  142  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000147811  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3359  DNA repair protein RadC  51.01 
 
 		 158 aa  141  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4248  DNA repair protein RadC  49.63 
 
 		 225 aa  141  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0462  DNA repair protein RadC  49.63 
 
 		 225 aa  141  5e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000108191  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0086  DNA repair protein RadC  46 
 
 		 224 aa  141  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3597  DNA repair protein RadC  49.63 
 
 		 225 aa  141  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0215962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0359  DNA repair protein RadC  49.63 
 
 		 225 aa  141  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.088498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3770  DNA repair protein RadC  49.63 
 
 		 225 aa  141  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.625851  normal  0.642753 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1699  DNA repair protein RadC  53.02 
 
 		 164 aa  140  6e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.233274  normal  0.0652003 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>