55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0912 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0912  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  100 
 
 		 202 aa  408  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.68088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3211  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  56.38 
 
 		 206 aa  214  5.9999999999999996e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5874  cytochrome c class I  62.91 
 
 		 180 aa  180  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362058  normal  0.18158 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8678  cytochrome c class I  54.14 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00176651  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4887  putative cytochrome c region protein  53.45 
 
 		 179 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362181 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3665  cytochrome c, class I  56.88 
 
 		 194 aa  169  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1239  cytochrome c, class I  56.14 
 
 		 174 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6593  cytochrome c, class I  56.14 
 
 		 174 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.263002 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3340  cytochrome c, class I  56.25 
 
 		 194 aa  166  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0152  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  55.7 
 
 		 195 aa  165  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7231  cytochrome c class I  56.76 
 
 		 200 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0147  cytochrome c, class I  51.55 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2167  putative sulfite oxidase cytochrome c subunit, SoxD  56.76 
 
 		 180 aa  159  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6197  cytochrome c class I  54.97 
 
 		 174 aa  158  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1895  putative cytochrome c  53.85 
 
 		 181 aa  152  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3042  cytochrome c, class I  47.27 
 
 		 259 aa  151  8e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.909018  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4162  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  42.47 
 
 		 225 aa  149  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2801  cytochrome c  44.75 
 
 		 342 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.26281 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1517  putative cytochrome  47.47 
 
 		 260 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.936874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3677  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  44.85 
 
 		 252 aa  142  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4956  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  45.06 
 
 		 251 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1666  cytochrome c class I  48 
 
 		 344 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185876  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2285  cytochrome c, class I  46.86 
 
 		 346 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00711214  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3912  hypothetical protein  44.94 
 
 		 211 aa  139  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.411473 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4251  putative cytochrome  44.44 
 
 		 242 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460774  normal  0.218955 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1590  cytochrome c class I  47.43 
 
 		 344 aa  138  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3257  cytochrome c, class I  43.58 
 
 		 344 aa  138  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225415  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1616  cytochrome c class I  46.31 
 
 		 171 aa  135  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.986895 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3783  cytochrome c class I  40.76 
 
 		 355 aa  133  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4156  cytochrome c, class I  42.41 
 
 		 382 aa  132  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1533  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2437  diheme cytochrome c SoxD  41.81 
 
 		 355 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4367  cytochrome c, class I  41.61 
 
 		 243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2630  cytochrome c, class I  39.57 
 
 		 404 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0341  putative cytochrome c, class I precursor  42.86 
 
 		 186 aa  127  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0802  cytochrome c, class I  41.86 
 
 		 360 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.641735  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3133  cytochrome c, class I  37.5 
 
 		 348 aa  121  8e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2734  cytochrome c class I  46.62 
 
 		 200 aa  121  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.207547  hitchhiker  0.0000919605 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2087  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  45.07 
 
 		 180 aa  118  6e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0560  sulfite oxidase cytochrome subunit  38.67 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1094  cytochrome c, class I  48.57 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2868  cytochrome c class I  42.95 
 
 		 187 aa  112  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2987  cytochrome c, class I  37.31 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.29363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2059  diheme cytochrome c SoxD  39.46 
 
 		 382 aa  105  6e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173988  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3203  Mo-co oxidoreductase dimerization domain protein  39.26 
 
 		 182 aa  94.4  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.595677  hitchhiker  0.0000523602 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3444  hypothetical protein  39.26 
 
 		 182 aa  94.4  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0586  hypothetical protein  32.54 
 
 		 239 aa  90.5  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.649014  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0157  hypothetical protein  33.15 
 
 		 331 aa  85.9  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000097536  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1569  cytochrome c, class I  31.19 
 
 		 141 aa  50.1  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.832933  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3526  cytochrome c class I  35.16 
 
 		 277 aa  46.2  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1149  Pyrrolo-quinoline quinone  28.07 
 
 		 678 aa  45.8  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261687  normal  0.842615 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12130  cytochrome c, mono- and diheme variants family  31.52 
 
 		 256 aa  43.9  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.298886  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2891  cytochrome c, class I  28.87 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2798  cytochrome c, class I  37.21 
 
 		 410 aa  41.6  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.228923  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  34.65 
 
 		 330 aa  41.2  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0844  hypothetical protein  30.97 
 
 		 190 aa  41.2  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.205332  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>