More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7404 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2415  trigger factor  69.41 
 
 		 478 aa  665    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.502295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2678  trigger factor  69.41 
 
 		 478 aa  665    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111476  normal  0.981646 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7404  trigger factor  100 
 
 		 473 aa  941    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1049  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2370  trigger factor  69.77 
 
 		 478 aa  667    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5133  trigger factor  71.4 
 
 		 473 aa  682    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.69039 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6582  trigger factor  90.97 
 
 		 485 aa  814    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0465754 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2912  trigger factor  58.41 
 
 		 462 aa  524  1e-147  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2185  trigger factor  60.05 
 
 		 460 aa  515  1.0000000000000001e-145  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.368629  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2562  trigger factor  53.44 
 
 		 452 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3590  trigger factor  52.34 
 
 		 452 aa  488  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0497135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3310  trigger factor  53.22 
 
 		 452 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2391  trigger factor  52.1 
 
 		 453 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3235  trigger factor  52.13 
 
 		 512 aa  479  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112931  normal  0.882786 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4575  trigger factor  52.33 
 
 		 452 aa  476  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.136212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2895  trigger factor  52.8 
 
 		 453 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.590231  normal  0.0645132 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1181  trigger factor  53.24 
 
 		 491 aa  473  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.176713  normal  0.0554389 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1900  trigger factor  51.66 
 
 		 453 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.958008 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1790  trigger factor  50.55 
 
 		 476 aa  458  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.147522  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2230  trigger factor  50.77 
 
 		 453 aa  458  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102095  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1703  trigger factor  48.97 
 
 		 494 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1337  trigger factor  50.55 
 
 		 518 aa  445  1e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.270787  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0553  trigger factor  45.49 
 
 		 474 aa  437  1e-121  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.017975  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0895  trigger factor  48.78 
 
 		 485 aa  433  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2280  trigger factor  49 
 
 		 485 aa  433  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2478  trigger factor  48.88 
 
 		 493 aa  433  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.656979  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0898  trigger factor  48.78 
 
 		 485 aa  431  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1505  trigger factor  48.75 
 
 		 495 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1549  trigger factor  47.36 
 
 		 463 aa  410  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2849  trigger factor  46.88 
 
 		 454 aa  401  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0303006 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1033  trigger factor  45.37 
 
 		 443 aa  358  8e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.201113 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0916  trigger factor  41.96 
 
 		 440 aa  356  5e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0887  trigger factor  45.52 
 
 		 459 aa  352  8.999999999999999e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.109425  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3059  trigger factor  40.18 
 
 		 513 aa  345  1e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438703  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1349  trigger factor  42.6 
 
 		 444 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295342  normal  0.310757 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2190  trigger factor  41.99 
 
 		 442 aa  332  1e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0142  trigger factor  41.03 
 
 		 444 aa  329  8e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1775  trigger factor  41.03 
 
 		 444 aa  329  8e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.816164 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1613  trigger factor  43.4 
 
 		 441 aa  326  5e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3323  trigger factor  42.31 
 
 		 445 aa  315  9e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.113258 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0843  trigger factor  37.3 
 
 		 544 aa  309  5e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.793444  normal  0.0950155 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0594  trigger factor  37.17 
 
 		 551 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.761218 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  34.16 
 
 		 435 aa  248  1e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  33.79 
 
 		 436 aa  238  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  32.34 
 
 		 442 aa  231  3e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  35.55 
 
 		 441 aa  227  3e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1553  trigger factor  34.6 
 
 		 436 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2289  trigger factor  33.12 
 
 		 450 aa  223  4e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.030502  normal  0.410432 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2958  trigger factor  33.71 
 
 		 436 aa  222  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00137272 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3698  trigger factor  33.93 
 
 		 436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  33.12 
 
 		 436 aa  221  3e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1047  trigger factor  34.46 
 
 		 434 aa  220  5e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000149025  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  34.57 
 
 		 436 aa  219  6e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  32.29 
 
 		 445 aa  219  8.999999999999998e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2510  trigger factor  32.74 
 
 		 437 aa  216  9e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1460  trigger factor  32.74 
 
 		 436 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.944672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2545  trigger factor  32.95 
 
 		 435 aa  213  5.999999999999999e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0171608 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1208  trigger factor  33.63 
 
 		 436 aa  212  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.774051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  33.71 
 
 		 434 aa  212  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1127  trigger factor  33.63 
 
 		 436 aa  212  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.252568  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  32.88 
 
 		 434 aa  211  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  32.18 
 
 		 444 aa  211  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1746  trigger factor  33.26 
 
 		 436 aa  211  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.132696 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2049  trigger factor  33.86 
 
 		 436 aa  211  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431317  normal  0.217945 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3137  trigger factor  31.42 
 
 		 436 aa  210  4e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000644844  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3069  trigger factor  32.13 
 
 		 434 aa  209  9e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0128477  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  32.24 
 
 		 435 aa  208  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  33.64 
 
 		 448 aa  209  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  32.74 
 
 		 433 aa  207  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1741  trigger factor  33.71 
 
 		 437 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658695 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  33.48 
 
 		 434 aa  207  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  36.96 
 
 		 433 aa  207  5e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1901  trigger factor  33.48 
 
 		 437 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.191378  hitchhiker  0.00938494 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  32.96 
 
 		 434 aa  206  7e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  32.58 
 
 		 434 aa  206  9e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3727  trigger factor  33.04 
 
 		 436 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1940  trigger factor  29.4 
 
 		 447 aa  205  1e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2029  trigger factor  31.92 
 
 		 436 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184706  normal  0.0504057 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0550  trigger factor  32.95 
 
 		 432 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0487  trigger factor  32.95 
 
 		 432 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182354  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3235  trigger factor  32.73 
 
 		 434 aa  204  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00052643  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0489  trigger factor  32.95 
 
 		 432 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000095414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0472  trigger factor  31.82 
 
 		 432 aa  204  3e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3093  trigger factor  32.73 
 
 		 434 aa  204  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353037  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0496  trigger factor  32.95 
 
 		 432 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000142859  hitchhiker  0.000578508 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3055  trigger factor  32.73 
 
 		 434 aa  204  3e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000166473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0506  trigger factor  32.95 
 
 		 432 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000626608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  32.26 
 
 		 429 aa  204  4e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0817  trigger factor  32.51 
 
 		 432 aa  203  5e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.153407  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2566  trigger factor  31.25 
 
 		 435 aa  203  5e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5225  trigger factor  32.13 
 
 		 448 aa  203  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1842  trigger factor  32.13 
 
 		 448 aa  203  7e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0231887 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2644  trigger factor  31.39 
 
 		 436 aa  202  9e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156375 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3173  trigger factor  31.59 
 
 		 432 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000698649  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2299  trigger factor  33.04 
 
 		 443 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457193 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1947  trigger factor  31.91 
 
 		 448 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273934  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3786  trigger factor  29.32 
 
 		 435 aa  202  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1719  trigger factor  32.57 
 
 		 434 aa  202  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3196  trigger factor  31.59 
 
 		 432 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000193083  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0479  trigger factor  31.59 
 
 		 432 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000713029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1912  trigger factor  32.13 
 
 		 448 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.78721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>