210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6599 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6599  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 299 aa  616  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173551  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6063  coproporphyrinogen III oxidase  88.96 
 
 		 299 aa  560  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.32246 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0684  coproporphyrinogen III oxidase  82.65 
 
 		 307 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.092351 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0673  coproporphyrinogen III oxidase  81.97 
 
 		 307 aa  502  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496843 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0647  coproporphyrinogen III oxidase  81.63 
 
 		 307 aa  499  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4671  coproporphyrinogen III oxidase  80.2 
 
 		 310 aa  488  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.370983 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3246  coproporphyrinogen III oxidase  70.79 
 
 		 295 aa  428  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.630237  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2954  coproporphyrinogen III oxidase  71.91 
 
 		 315 aa  429  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.343803  normal  0.536677 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2621  coproporphyrinogen III oxidase  69.86 
 
 		 300 aa  414  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2296  coproporphyrinogen III oxidase  72.95 
 
 		 295 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.803269 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1616  coproporphyrinogen III oxidase  65.99 
 
 		 304 aa  399  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.978036  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2169  coproporphyrinogen III oxidase  64.55 
 
 		 304 aa  398  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1550  coproporphyrinogen III oxidase  64.21 
 
 		 303 aa  395  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.203239  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1549  coproporphyrinogen III oxidase  66.55 
 
 		 303 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.605078  normal  0.252724 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1498  coproporphyrinogen III oxidase  63.88 
 
 		 303 aa  390  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3050  coproporphyrinogen III oxidase  65.54 
 
 		 303 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199484 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2786  coproporphyrinogen III oxidase  65.88 
 
 		 303 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.893641  normal  0.534406 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0060  coproporphyrinogen III oxidase  65.76 
 
 		 301 aa  387  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.889116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2240  coproporphyrinogen III oxidase  66.32 
 
 		 304 aa  385  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0699  coproporphyrinogen III oxidase  63.36 
 
 		 290 aa  380  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3804  coproporphyrinogen III oxidase  63.48 
 
 		 298 aa  375  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154629 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0734  coproporphyrinogen III oxidase  64.07 
 
 		 318 aa  371  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.518161 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3221  coproporphyrinogen III oxidase  65.99 
 
 		 304 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0279  coproporphyrinogen III oxidase  59.79 
 
 		 300 aa  352  5e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2944  coproporphyrinogen III oxidase  58.08 
 
 		 307 aa  325  7e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4009  coproporphyrinogen III oxidase  50.49 
 
 		 303 aa  301  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.586573  hitchhiker  0.00557292 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3764  coproporphyrinogen III oxidase  50.33 
 
 		 310 aa  300  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.323401  hitchhiker  0.00503136 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1263  coproporphyrinogen III oxidase  51.75 
 
 		 304 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1701  coproporphyrinogen III oxidase  49.35 
 
 		 303 aa  295  8e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2337  coproporphyrinogen III oxidase  53.87 
 
 		 291 aa  291  8e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.164246 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2536  coproporphyrinogen III oxidase  53.45 
 
 		 287 aa  291  1e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.60563  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0682  coproporphyrinogen III oxidase  53.2 
 
 		 291 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0454  coproporphyrinogen III oxidase  51.57 
 
 		 306 aa  283  2.0000000000000002e-75  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0548  coproporphyrinogen III oxidase  52.84 
 
 		 291 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1347  coproporphyrinogen III oxidase  54.92 
 
 		 286 aa  278  7e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.280799  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1398  coproporphyrinogen III oxidase  54.88 
 
 		 286 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.682731  normal  0.262285 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0674  coproporphyrinogen III oxidase  49.5 
 
 		 297 aa  270  2e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1752  coproporphyrinogen III oxidase  50.17 
 
 		 286 aa  266  4e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0768431  normal  0.108805 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3848  coproporphyrinogen III oxidase  48.98 
 
 		 292 aa  257  1e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0591  coproporphyrinogen III oxidase  43.24 
 
 		 284 aa  251  8.000000000000001e-66  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1214  coproporphyrinogen III oxidase  45.91 
 
 		 256 aa  247  2e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0446  coproporphyrinogen III oxidase  41.5 
 
 		 282 aa  246  2e-64  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0752426  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2531  coproporphyrinogen III oxidase  45.08 
 
 		 300 aa  238  6.999999999999999e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0047  coproporphyrinogen III oxidase  44.59 
 
 		 308 aa  230  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2279  Coproporphyrinogen oxidase  43.42 
 
 		 309 aa  223  4e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  0.0202052 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1193  Coproporphyrinogen oxidase  43.85 
 
 		 327 aa  222  7e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2369  coproporphyrinogen III oxidase  42.96 
 
 		 303 aa  219  3e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4240  coproporphyrinogen III oxidase  43.71 
 
 		 323 aa  217  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0116  coproporphyrinogen III oxidase  44.06 
 
 		 304 aa  216  4e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.998466  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3729  coproporphyrinogen III oxidase  44.95 
 
 		 303 aa  216  4e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.186137  hitchhiker  0.00821912 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0089  coproporphyrinogen III oxidase  43.71 
 
 		 303 aa  215  7e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0674  coproporphyrinogen III oxidase  43.04 
 
 		 317 aa  214  9.999999999999999e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4996  coproporphyrinogen III oxidase  41.4 
 
 		 347 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000411147  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0025  coproporphyrinogen III oxidase  41.89 
 
 		 303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0025  coproporphyrinogen III oxidase  44.06 
 
 		 305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0073  coproporphyrinogen III oxidase  43.71 
 
 		 303 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.188544  hitchhiker  0.000371882 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2066  coproporphyrinogen III oxidase  42.71 
 
 		 310 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87254  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1703  coproporphyrinogen III oxidase  45.32 
 
 		 286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.586163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0089  coproporphyrinogen III oxidase  43.36 
 
 		 303 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.554189  hitchhiker  0.0000000000135583 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00280  coproporphyrinogen III oxidase  43.71 
 
 		 305 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.477574 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0024  coproporphyrinogen III oxidase  43.36 
 
 		 304 aa  209  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6503  coproporphyrinogen III oxidase  43.25 
 
 		 303 aa  209  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.602583 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1294  coproporphyrinogen III oxidase  45.91 
 
 		 302 aa  208  7e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.770302 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0170  coproporphyrinogen III oxidase, aerobic  43.36 
 
 		 304 aa  208  8e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0092  coproporphyrinogen III oxidase  42.71 
 
 		 303 aa  208  9e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.469648  hitchhiker  0.0000233392 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17021  coproporphyrinogen III oxidase  41.21 
 
 		 375 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.18622  normal  0.770424 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3290  Coproporphyrinogen oxidase  42.62 
 
 		 312 aa  207  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20281  coproporphyrinogen III oxidase  38.01 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0950  coproporphyrinogen III oxidase  40.27 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0022  coproporphyrinogen III oxidase  43.36 
 
 		 304 aa  206  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0449808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1891  coproporphyrinogen III oxidase  40.58 
 
 		 345 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0038  coproporphyrinogen III oxidase  42.66 
 
 		 304 aa  206  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2092  Coproporphyrinogen oxidase  42.14 
 
 		 313 aa  206  3e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0593493  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1926  coproporphyrinogen III oxidase  44.01 
 
 		 362 aa  206  4e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.420304  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1949  coproporphyrinogen III oxidase  46.95 
 
 		 302 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.809347  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1339  coproporphyrinogen III oxidase  42.37 
 
 		 306 aa  206  4e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0135  coproporphyrinogen III oxidase  41.1 
 
 		 299 aa  206  5e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3053  coproporphyrinogen III oxidase  39.81 
 
 		 344 aa  205  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.375519 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3261  coproporphyrinogen III oxidase  40 
 
 		 307 aa  205  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.77176  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0403  coproporphyrinogen III oxidase  43.53 
 
 		 362 aa  205  7e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0775561  normal  0.510221 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0030  coproporphyrinogen III oxidase  41.44 
 
 		 305 aa  205  7e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000103554  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3938  coproporphyrinogen III oxidase  43.64 
 
 		 298 aa  205  8e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2334  coproporphyrinogen III oxidase  42.76 
 
 		 306 aa  205  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193122  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2213  coproporphyrinogen III oxidase  42.76 
 
 		 306 aa  205  8e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03935  coproporphyrinogen III oxidase  43.3 
 
 		 299 aa  205  9e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0037  coproporphyrinogen III oxidase  42.86 
 
 		 323 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.430398  hitchhiker  0.000152839 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1154  coproporphyrinogen III oxidase  37.69 
 
 		 348 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3211  Coproporphyrinogen oxidase  41.83 
 
 		 311 aa  204  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0030  coproporphyrinogen III oxidase  41.22 
 
 		 310 aa  204  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210418  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17691  coproporphyrinogen III oxidase  39.6 
 
 		 342 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00980  coproporphyrinogen oxidase, putative  39.48 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00531403  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0042  coproporphyrinogen III oxidase  41.7 
 
 		 306 aa  203  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0059194  normal  0.559288 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1674  coproporphyrinogen III oxidase  39.27 
 
 		 342 aa  203  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0469797  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0030  coproporphyrinogen III oxidase  42.86 
 
 		 302 aa  203  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.378098  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0346  coproporphyrinogen III oxidase  43.06 
 
 		 302 aa  204  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2620  Coproporphyrinogen oxidase  40.19 
 
 		 348 aa  203  2e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0060  coproporphyrinogen III oxidase  42.31 
 
 		 304 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0033  coproporphyrinogen III oxidase  42.86 
 
 		 302 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1864  coproporphyrinogen III oxidase  46.59 
 
 		 302 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0038  coproporphyrinogen III oxidase  42.86 
 
 		 302 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.893663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>