More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5623 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5623  protein of unknown function DUF21  100 
 
 		 403 aa  777    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5725  hypothetical protein  82.48 
 
 		 434 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239106  hitchhiker  0.00714589 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2122  hypothetical protein  53.89 
 
 		 436 aa  387  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.705935  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2321  hypothetical protein  51.94 
 
 		 446 aa  383  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.638143  normal  0.0384275 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2711  hypothetical protein  53.11 
 
 		 431 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.155736 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3102  hypothetical protein  52.01 
 
 		 466 aa  374  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0806544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7487  hypothetical protein  53.14 
 
 		 436 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.160114 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2753  hypothetical protein  52.33 
 
 		 431 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3152  protein of unknown function DUF21  51.7 
 
 		 431 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1919  hemolysin  49.74 
 
 		 430 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3348  hypothetical protein  51.05 
 
 		 429 aa  362  9e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0165594  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2753  hypothetical protein  51.48 
 
 		 433 aa  362  9e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.98691 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4139  hypothetical protein  50.52 
 
 		 452 aa  360  4e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0969684 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3174  hypothetical protein  50.13 
 
 		 458 aa  357  1.9999999999999998e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0828  protein of unknown function DUF21  46.37 
 
 		 424 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3672  hypothetical protein  48.95 
 
 		 425 aa  353  4e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00780947 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0942  protein of unknown function DUF21  46.87 
 
 		 424 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  49.74 
 
 		 436 aa  339  5e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0723  hypothetical protein  50 
 
 		 425 aa  338  9.999999999999999e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4282  hypothetical protein  50 
 
 		 434 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.789831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2673  hypothetical protein  51.44 
 
 		 424 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.460279  normal  0.557621 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1013  hemolysin  51.17 
 
 		 424 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471918  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4050  hypothetical protein  40.67 
 
 		 440 aa  293  3e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0807851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  43.05 
 
 		 442 aa  290  4e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4403  hypothetical protein  43.89 
 
 		 436 aa  289  6e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0196704  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  40.48 
 
 		 447 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2815  CBS domain-containing protein  37.92 
 
 		 439 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2774  protein of unknown function DUF21  42.89 
 
 		 440 aa  281  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  42.82 
 
 		 437 aa  280  2e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3770  hypothetical protein  42.49 
 
 		 441 aa  280  2e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3447  hypothetical protein  42.89 
 
 		 440 aa  281  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0264  hypothetical protein  44.62 
 
 		 432 aa  279  5e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3678  protein of unknown function DUF21  39.95 
 
 		 443 aa  279  7e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2432  protein of unknown function DUF21  39.95 
 
 		 443 aa  279  7e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2385  hypothetical protein  43.01 
 
 		 433 aa  278  9e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1413  hypothetical protein  40.75 
 
 		 430 aa  276  7e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0999393  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3640  hypothetical protein  42.38 
 
 		 441 aa  272  8.000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4026  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  42.01 
 
 		 437 aa  272  8.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1287  protein of unknown function DUF21  39.9 
 
 		 428 aa  272  9e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4765  hypothetical protein  40.31 
 
 		 437 aa  269  5e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.942078 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3036  CBS  40.16 
 
 		 442 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2853  CBS domain-containing protein  41.51 
 
 		 439 aa  263  3e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1085  hypothetical protein  41.78 
 
 		 464 aa  261  1e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.792914 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3199  hypothetical protein  42.07 
 
 		 448 aa  259  7e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4935  hypothetical protein  39.64 
 
 		 443 aa  258  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2313  hypothetical protein  41.33 
 
 		 438 aa  256  5e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2439  protein of unknown function DUF21  38.61 
 
 		 443 aa  256  5e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0562  hypothetical protein  37.85 
 
 		 439 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371677  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0902  protein of unknown function DUF21  37.27 
 
 		 436 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2846  protein of unknown function DUF21  38.18 
 
 		 443 aa  253  5.000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0608  hemolysin  37.85 
 
 		 439 aa  253  6e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4228  hypothetical protein  42.23 
 
 		 445 aa  253  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  0.199337 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3026  hypothetical protein  40.62 
 
 		 442 aa  251  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25014  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2480  hemolysin  39.43 
 
 		 436 aa  250  3e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0098  hypothetical protein  38.61 
 
 		 460 aa  250  4e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2145  hypothetical protein  40.16 
 
 		 430 aa  248  1e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1441  protein of unknown function DUF21  38.68 
 
 		 439 aa  248  1e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.114074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1932  CBS  37.31 
 
 		 456 aa  248  1e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0017665  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  42.16 
 
 		 441 aa  248  1e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1577  protein of unknown function DUF21  39.48 
 
 		 447 aa  248  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.569313  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2235  protein of unknown function DUF21  33.33 
 
 		 439 aa  246  4e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2157  hypothetical protein  41.42 
 
 		 437 aa  246  4.9999999999999997e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.285648  normal  0.808245 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0266  protein of unknown function DUF21  38.96 
 
 		 444 aa  245  8e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0819  protein of unknown function DUF21  33.7 
 
 		 441 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0238  protein of unknown function DUF21  35.88 
 
 		 417 aa  244  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35020  hemolysin-like protein  39.15 
 
 		 432 aa  243  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518958  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0419  hypothetical protein  35.26 
 
 		 407 aa  241  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0769  hypothetical protein  39.11 
 
 		 447 aa  242  1e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574193 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0831  protein of unknown function DUF21  41.18 
 
 		 452 aa  241  1e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0300168 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3197  hypothetical protein  41.76 
 
 		 479 aa  241  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241932  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0710  protein of unknown function DUF21  33.87 
 
 		 432 aa  241  2e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.149607  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1250  CBS domain-containing protein  37.47 
 
 		 432 aa  240  4e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0021  protein of unknown function DUF21  39.2 
 
 		 435 aa  239  9e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1314  hypothetical protein  39.59 
 
 		 439 aa  238  1e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0274508  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  39.9 
 
 		 465 aa  236  6e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2077  CBS domain-containing protein  37.7 
 
 		 441 aa  235  9e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00183  hemolysin  38.97 
 
 		 435 aa  235  9e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.702411  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3488  protein of unknown function DUF21  35.52 
 
 		 432 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0231  CBS  34.77 
 
 		 454 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0205285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2008  protein of unknown function DUF21  33.33 
 
 		 447 aa  234  3e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000403932  normal  0.229254 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0470  hypothetical protein  37.08 
 
 		 432 aa  234  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000200568  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1519  hypothetical protein  39.48 
 
 		 428 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0953  membrane protein  35.66 
 
 		 426 aa  232  8.000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0343  hypothetical protein  36.44 
 
 		 437 aa  227  3e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384323  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0092  hypothetical protein  41.15 
 
 		 435 aa  226  6e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1852  protein of unknown function DUF21  35.95 
 
 		 433 aa  225  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4410  protein of unknown function DUF21  36.88 
 
 		 444 aa  225  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.938013  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  34.72 
 
 		 447 aa  222  7e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3855  protein of unknown function DUF21  37.6 
 
 		 437 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.469597  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004057  hemolysin  35.26 
 
 		 434 aa  218  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1467  protein of unknown function DUF21  36.77 
 
 		 429 aa  217  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211541  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0247  protein of unknown function DUF21  35.31 
 
 		 446 aa  209  6e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0295  hypothetical protein  36.18 
 
 		 443 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.73268  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0669  hypothetical protein  36.62 
 
 		 439 aa  206  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0810091 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2004  hypothetical protein  35.28 
 
 		 431 aa  205  9e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5899  hypothetical protein  38.4 
 
 		 430 aa  203  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.476132 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4087  protein of unknown function DUF21  31.48 
 
 		 453 aa  203  3e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0389  hypothetical protein  37.4 
 
 		 438 aa  203  4e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4787  putative transporter  29.35 
 
 		 447 aa  202  7e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4864  putative transporter  29.35 
 
 		 447 aa  202  7e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>