More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3394 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3394  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 334 aa  686    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3990  transcriptional regulator, AraC family  80.84 
 
 		 344 aa  533  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4030  transcriptional regulator, AraC family  80.19 
 
 		 343 aa  527  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.364388 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3735  helix-turn-helix domain-containing protein  79.87 
 
 		 343 aa  525  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2488  AraC family transcriptional regulator  78.34 
 
 		 344 aa  520  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1100  AraC family transcriptional regulator  48.24 
 
 		 334 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0397278 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1567  AraC family transcriptional regulator  48.7 
 
 		 337 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226821  normal  0.377129 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2922  transcriptional regulator  48.7 
 
 		 337 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71070  AraC family transcriptional regulator  46.42 
 
 		 367 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6166  putative transcriptional regulator  46.42 
 
 		 367 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165565  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2590  transcriptional regulator AraC family  44.89 
 
 		 337 aa  297  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0490  transcriptional regulator  47.32 
 
 		 364 aa  296  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0465  transcriptional regulator, AraC family  46.08 
 
 		 367 aa  295  6e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3933  AraC family transcriptional regulator  48.04 
 
 		 337 aa  295  6e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5236  transcriptional regulator  46.08 
 
 		 367 aa  294  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59007  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4708  helix-turn-helix, AraC type:ThiJ/PfpI  46.08 
 
 		 367 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1865  AraC family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 332 aa  292  6e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2444  transcriptional regulator  47.04 
 
 		 331 aa  291  1e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0668048  hitchhiker  0.000772272 
 
 
-
 
NC_004310  BR1319  AraC family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 332 aa  290  2e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0323  AraC family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 368 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0298  AraC family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 368 aa  288  6e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000218642 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1270  transcriptional regulator  45.13 
 
 		 334 aa  289  6e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0318  AraC family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 368 aa  288  7e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.120478 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0987  transcriptional regulator  46.41 
 
 		 375 aa  288  8e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1794  AraC family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 338 aa  287  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112719  hitchhiker  0.00342809 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4021  AraC family transcriptional regulator  43.99 
 
 		 353 aa  286  2.9999999999999996e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4910  AraC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 368 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942326 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2406  transcriptional regulator, AraC family  43.22 
 
 		 339 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277312 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2152  transcriptional regulator, AraC family  43.22 
 
 		 340 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.49496 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1525  HTH-type transcriptional regulator  44.75 
 
 		 339 aa  278  7e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.199497 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2664  AraC family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 368 aa  272  5.000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0165303  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1980  AraC family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 341 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.433985  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0469  AraC family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 369 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0739  AraC family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 365 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1007  AraC family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 365 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.809611  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0711  AraC family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 341 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2105  AraC family transcriptional regulator  45.99 
 
 		 421 aa  265  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1869  AraC family transcriptional regulator  46.18 
 
 		 341 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0827  AraC family transcriptional regulator  45.99 
 
 		 365 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1111  AraC family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 339 aa  263  3e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000893396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1586  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 333 aa  263  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4061  AraC family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 401 aa  261  8.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.135508  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4498  AraC family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 340 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3304  AraC family transcriptional regulator  45.4 
 
 		 338 aa  260  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5062  transcriptional regulator, AraC family  44.14 
 
 		 331 aa  260  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652687  normal  0.0215007 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3545  AraC family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 341 aa  259  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3487  AraC family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 332 aa  258  7e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.1866 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5086  AraC family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 371 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001535  transcriptional regulator AraC family  40 
 
 		 318 aa  258  1e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3282  AraC family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 371 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5199  AraC family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 341 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0329  AraC family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 314 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5023  AraC family transcriptional regulator  43.95 
 
 		 341 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02029  transcriptional regulator transcription regulator protein  43.81 
 
 		 343 aa  256  3e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.130887 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0570  transcriptional regulator  44.27 
 
 		 371 aa  256  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3197  AraC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 355 aa  255  6e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5170  AraC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 355 aa  255  6e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119945  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0457  transcriptional regulator  43.65 
 
 		 332 aa  255  7e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.99008  normal  0.0292699 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5109  AraC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 332 aa  255  7e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.771046  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0305  AraC family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276318 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4565  AraC family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5090  AraC family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893585 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1868  AraC family transcriptional regulator  43.35 
 
 		 332 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0566  AraC family transcriptional regulator  43.35 
 
 		 332 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207783  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2025  AraC family transcriptional regulator  43.35 
 
 		 332 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0448  AraC family transcriptional regulator  43.35 
 
 		 332 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5229  transcriptional regulator  43.28 
 
 		 314 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.35662  normal  0.0289181 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5064  AraC family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 314 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1140  AraC family transcriptional regulator  40.39 
 
 		 322 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0325  AraC family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 315 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0901  AraC family transcriptional regulator  43.35 
 
 		 332 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1931  AraC family transcriptional regulator  43.35 
 
 		 332 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.746291  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3303  AraC family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 314 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4823  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 338 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4903  AraC family transcriptional regulator  42.77 
 
 		 315 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4809  transcriptional regulator  44.95 
 
 		 331 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193614  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0968  AraC family transcriptional regulator  43.73 
 
 		 332 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5220  AraC family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 314 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.974611 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1950  transcriptional regulator  40.26 
 
 		 341 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3277  AraC family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 339 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4999  AraC family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 314 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.258482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2253  AraC family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 321 aa  250  3e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4474  AraC family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 314 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0599  transcriptional regulator  42.41 
 
 		 326 aa  249  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2915  helix-turn-helix, AraC type:ThiJ/PfpI  41.97 
 
 		 325 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal  0.163293 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3997  transcriptional regulator  43.75 
 
 		 316 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564896  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2064  AraC family transcriptional regulator  44.69 
 
 		 335 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3448  AraC family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 325 aa  246  6e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3665  AraC family transcriptional regulator  44.69 
 
 		 401 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747363  normal  0.253179 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4893  AraC family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 340 aa  245  6.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6176  putative transcriptional regulator  40.89 
 
 		 336 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71170  AraC family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 336 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2234  AraC family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 335 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.498713 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1850  AraC family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 314 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.999636  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2367  AraC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 311 aa  242  7.999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.923255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1655  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.24 
 
 		 332 aa  241  9e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1001  AraC family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 324 aa  241  1e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0569552  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3287  AraC family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 331 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.242748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3578  AraC family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 314 aa  240  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.54425 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2238  AraC family transcriptional regulator  43.73 
 
 		 330 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.390455  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>