71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0436 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0436  hypothetical protein  100 
 
 		 370 aa  731    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2074  hypothetical protein  88.4 
 
 		 385 aa  627  1e-179  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136102  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0193  hypothetical protein  70.3 
 
 		 375 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0506443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0247  hypothetical protein  69.21 
 
 		 375 aa  503  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1267  hypothetical protein  68.82 
 
 		 373 aa  478  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0741132 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0507  hypothetical protein  69.63 
 
 		 373 aa  478  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0517  hypothetical protein  60.33 
 
 		 369 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2169  hypothetical protein  60.06 
 
 		 369 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0445618 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2428  hypothetical protein  60.88 
 
 		 369 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759997  normal  0.185081 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3221  hypothetical protein  59.62 
 
 		 376 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2777  hypothetical protein  57.91 
 
 		 376 aa  396  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283219  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1193  hypothetical protein  60.72 
 
 		 361 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376035  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1124  hypothetical protein  60.72 
 
 		 361 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1065  hypothetical protein  60.06 
 
 		 361 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3890  hypothetical protein  56.46 
 
 		 376 aa  388  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0848246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2533  hypothetical protein  53.02 
 
 		 368 aa  378  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000023421 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5582  hypothetical protein  55.96 
 
 		 376 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0303193 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1688  hypothetical protein  52.75 
 
 		 368 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3263  glycosyl transferase, group 1  46.22 
 
 		 372 aa  302  5.000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.364975 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1318  hypothetical protein  69.79 
 
 		 439 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3214  hypothetical protein  30.08 
 
 		 358 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2531  hypothetical protein  27.91 
 
 		 351 aa  91.3  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000222367 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2692  hypothetical protein  28.28 
 
 		 362 aa  83.2  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1690  hypothetical protein  26.83 
 
 		 351 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1265  hypothetical protein  28.53 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192794  normal  0.0171545 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2999  hypothetical protein  27.49 
 
 		 457 aa  78.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.932041  normal  0.400832 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1689  hypothetical protein  27.49 
 
 		 366 aa  77  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0958  hypothetical protein  26.58 
 
 		 363 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2532  hypothetical protein  27.3 
 
 		 366 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000423919 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5584  hypothetical protein  26.85 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348361  normal  0.0177217 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1138  hypothetical protein  25.63 
 
 		 389 aa  69.7  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358435  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0438  hypothetical protein  30.77 
 
 		 382 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0932  hypothetical protein  28.57 
 
 		 379 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525658  normal  0.176041 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0245  hypothetical protein  28.08 
 
 		 366 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.247732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1670  hypothetical protein  29.52 
 
 		 363 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.662638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3211  hypothetical protein  29.26 
 
 		 359 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0191  hypothetical protein  28.08 
 
 		 371 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2168  hypothetical protein  29.32 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0794461 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1316  hypothetical protein  28.42 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2072  hypothetical protein  28.38 
 
 		 386 aa  62  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.236468  normal  0.0105803 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0505  hypothetical protein  27.63 
 
 		 373 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  27.44 
 
 		 432 aa  60.5  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2427  hypothetical protein  26.92 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.284485 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3201  CgeB family protein  28.83 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2776  hypothetical protein  24.87 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1058  hypothetical protein  28.99 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1165  CgeB family protein  28.83 
 
 		 394 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1186  hypothetical protein  28.44 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1117  hypothetical protein  28.12 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1889  hypothetical protein  29.31 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3891  hypothetical protein  23.65 
 
 		 361 aa  56.2  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3892  hypothetical protein  26.26 
 
 		 372 aa  56.2  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0923789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0516  hypothetical protein  27.3 
 
 		 363 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1059  hypothetical protein  29.08 
 
 		 375 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3261  hypothetical protein  24.4 
 
 		 374 aa  54.3  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5583  hypothetical protein  25.33 
 
 		 362 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0202038 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0874  hypothetical protein  26.32 
 
 		 393 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.442183  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2775  hypothetical protein  24.12 
 
 		 363 aa  50.8  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0925  hypothetical protein  26.05 
 
 		 394 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.910156  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1187  hypothetical protein  28.49 
 
 		 375 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1317  hypothetical protein  25.65 
 
 		 367 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2426  hypothetical protein  25.07 
 
 		 358 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.577866 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1118  hypothetical protein  27.38 
 
 		 375 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0192  hypothetical protein  26.44 
 
 		 368 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0922  hypothetical protein  26.68 
 
 		 394 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3215  hypothetical protein  26.95 
 
 		 367 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3262  hypothetical protein  26.46 
 
 		 366 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.403362 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0304  hypothetical protein  23.1 
 
 		 361 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3362  glycosyl transferase family 2  37.25 
 
 		 673 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2849  hypothetical protein  30.1 
 
 		 546 aa  43.9  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0246  hypothetical protein  26.5 
 
 		 368 aa  43.5  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0558374  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>