More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0123 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0123  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 141 aa  278  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.573144  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4756  3-dehydroquinate dehydratase  92.14 
 
 		 141 aa  239  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3860  3-dehydroquinate dehydratase  70.21 
 
 		 148 aa  197  6e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0470796 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1028  3-dehydroquinate dehydratase  71.43 
 
 		 151 aa  191  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1223  3-dehydroquinate dehydratase  71.43 
 
 		 151 aa  191  4e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1094  3-dehydroquinate dehydratase  70.71 
 
 		 191 aa  187  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  65.71 
 
 		 145 aa  172  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0904  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 		 176 aa  171  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0908  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 		 157 aa  171  3.9999999999999995e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  61.64 
 
 		 151 aa  171  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  60.14 
 
 		 146 aa  170  5e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  63.57 
 
 		 145 aa  169  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2302  3-dehydroquinate dehydratase  63.19 
 
 		 177 aa  169  9e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.708414  hitchhiker  0.00337586 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1610  3-dehydroquinate dehydratase  63.19 
 
 		 148 aa  169  9e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0468975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2272  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 		 176 aa  168  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156045  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2491  3-dehydroquinate dehydratase  61.38 
 
 		 147 aa  167  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254685  normal  0.906535 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2104  3-dehydroquinate dehydratase  62.5 
 
 		 148 aa  167  4e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  63.31 
 
 		 145 aa  167  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  62.86 
 
 		 155 aa  166  7e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1397  3-dehydroquinate dehydratase  61.64 
 
 		 154 aa  166  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000192408  normal  0.601404 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  61.64 
 
 		 146 aa  166  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  56.52 
 
 		 152 aa  164  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2433  3-dehydroquinate dehydratase  60.87 
 
 		 149 aa  163  8e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.587468  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  57.14 
 
 		 150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  58.82 
 
 		 148 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2077  3-dehydroquinate dehydratase  62.77 
 
 		 150 aa  160  5.0000000000000005e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.556948  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  59.56 
 
 		 148 aa  159  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5387  3-dehydroquinate dehydratase  56.03 
 
 		 153 aa  157  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.435849 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1714  3-dehydroquinate dehydratase  60.61 
 
 		 145 aa  158  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.011115  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4097  3-dehydroquinate dehydratase, type II  56.03 
 
 		 165 aa  156  8e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.517045  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2299  3-dehydroquinate dehydratase  57.93 
 
 		 159 aa  156  8e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.926726  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  55.07 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  59.85 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  57.35 
 
 		 148 aa  155  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  56.43 
 
 		 149 aa  154  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  59.85 
 
 		 150 aa  154  4e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3916  3-dehydroquinate dehydratase  57.24 
 
 		 150 aa  153  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.491166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  57.86 
 
 		 152 aa  153  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  58.99 
 
 		 149 aa  152  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  57.25 
 
 		 152 aa  152  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  59.09 
 
 		 193 aa  152  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4214  3-dehydroquinate dehydratase  59.15 
 
 		 163 aa  152  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2283  3-dehydroquinate dehydratase  60.99 
 
 		 145 aa  151  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  58.04 
 
 		 148 aa  151  4e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.47 
 
 		 142 aa  150  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  55.64 
 
 		 152 aa  150  7e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3018  3-dehydroquinate dehydratase  54.61 
 
 		 151 aa  150  7e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2433  3-dehydroquinate dehydratase  56.34 
 
 		 156 aa  150  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  55.07 
 
 		 153 aa  149  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  55.07 
 
 		 153 aa  149  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  56.93 
 
 		 158 aa  149  8.999999999999999e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4902  3-dehydroquinate dehydratase  57.89 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1733  3-dehydroquinate dehydratase  58.27 
 
 		 161 aa  149  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3022  3-dehydroquinate dehydratase  52.9 
 
 		 147 aa  149  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00285164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  58.21 
 
 		 151 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2566  3-dehydroquinate dehydratase  52.17 
 
 		 147 aa  148  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3376  3-dehydroquinate dehydratase  53.62 
 
 		 147 aa  149  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  58.21 
 
 		 151 aa  148  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  58.21 
 
 		 151 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  57.46 
 
 		 151 aa  148  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  58.21 
 
 		 151 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1267  3-dehydroquinate dehydratase  52.74 
 
 		 146 aa  148  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0717044  hitchhiker  0.00235053 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4665  3-dehydroquinate dehydratase  58.21 
 
 		 151 aa  148  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1896  3-dehydroquinate dehydratase  57.46 
 
 		 193 aa  147  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0482  3-dehydroquinate dehydratase  57.46 
 
 		 193 aa  147  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.644593  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0344  3-dehydroquinate dehydratase  57.46 
 
 		 151 aa  147  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960001  normal  0.658958 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2715  3-dehydroquinate dehydratase  53.9 
 
 		 151 aa  147  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3443  3-dehydroquinate dehydratase, type II  57.45 
 
 		 146 aa  147  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2207  3-dehydroquinate dehydratase  57.46 
 
 		 151 aa  147  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2041  3-dehydroquinate dehydratase  55.64 
 
 		 149 aa  147  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775923 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0849  3-dehydroquinate dehydratase  57.46 
 
 		 151 aa  147  6e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1753  3-dehydroquinate dehydratase  57.46 
 
 		 151 aa  147  6e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111772  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0892  3-dehydroquinate dehydratase  57.46 
 
 		 151 aa  147  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396481  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  54.89 
 
 		 152 aa  146  7e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0579  3-dehydroquinate dehydratase  56.72 
 
 		 193 aa  147  7e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5453  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 		 147 aa  147  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.747889  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  54.89 
 
 		 149 aa  146  8e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04071  3-dehydroquinate dehydratase  48.57 
 
 		 147 aa  146  8e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0128  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.09 
 
 		 137 aa  146  9e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.297868  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0813  3-dehydroquinate dehydratase  54.93 
 
 		 146 aa  145  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3121  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.64 
 
 		 149 aa  145  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2377  3-dehydroquinate dehydratase  54.41 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2867  3-dehydroquinate dehydratase  54.93 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  51.8 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  52.86 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04381  3-dehydroquinate dehydratase  47.86 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0045  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.47 
 
 		 144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1924  3-dehydroquinate dehydratase  52.17 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3174  3-dehydroquinate dehydratase  54.41 
 
 		 153 aa  144  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.715681 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  53.62 
 
 		 150 aa  144  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0845  3-dehydroquinate dehydratase, type II  56.52 
 
 		 145 aa  144  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2796  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.64 
 
 		 138 aa  145  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.396749  normal  0.170402 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3637  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.52 
 
 		 142 aa  144  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5319  3-dehydroquinate dehydratase  57.46 
 
 		 149 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  51.09 
 
 		 159 aa  144  5e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2207  3-dehydroquinate dehydratase  53.96 
 
 		 144 aa  144  6e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121431  normal  0.285231 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3467  3-dehydroquinate dehydratase  53.68 
 
 		 149 aa  143  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  48.92 
 
 		 145 aa  143  6e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2345  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.55 
 
 		 137 aa  143  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.660798  normal  0.653044 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  48.91 
 
 		 159 aa  143  7.0000000000000006e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>