84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2827 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2827  periplasmic protein-like protein  100 
 
 
229 aa  476  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.789091  normal  0.0661968 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3263  hypothetical protein  61.49 
 
 
235 aa  240  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.310609  normal  0.453663 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0308  hypothetical protein  59.43 
 
 
235 aa  236  3e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0293189  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0363  hypothetical protein  59.43 
 
 
235 aa  235  6e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.82719  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0472  hypothetical protein  49.56 
 
 
235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0431  hypothetical protein  53.59 
 
 
216 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0377  hypothetical protein  50.66 
 
 
235 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.560354  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3647  hypothetical protein  50 
 
 
235 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0379  hypothetical protein  50.66 
 
 
235 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.481978  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07088  hypothetical protein  55.24 
 
 
227 aa  229  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3596  hypothetical protein  58.96 
 
 
236 aa  229  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0161  hypothetical protein  53.77 
 
 
220 aa  228  4e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001010  hypothetical protein  55.24 
 
 
227 aa  228  8e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4144  hypothetical protein  49.77 
 
 
236 aa  226  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0112437  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3910  hypothetical protein  49.78 
 
 
235 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4103  hypothetical protein  49.78 
 
 
235 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.898046  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3987  hypothetical protein  49.78 
 
 
235 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4009  hypothetical protein  49.78 
 
 
235 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0379  hypothetical protein  50.47 
 
 
237 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4322  hypothetical protein  51.13 
 
 
235 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1448  hypothetical protein  54.64 
 
 
228 aa  221  8e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1080  periplasmic protein  54.44 
 
 
215 aa  218  7e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02470  periplasmic protein  45.18 
 
 
242 aa  208  5e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.72664  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1347  periplasmic protein  53.18 
 
 
219 aa  204  9e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.664237  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1809  periplasmic protein-like protein  53.89 
 
 
226 aa  193  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0209  hypothetical protein  48.62 
 
 
214 aa  192  4e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1218  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  51.38 
 
 
229 aa  189  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0161  periplasmic protein  50.91 
 
 
221 aa  190  2e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.494989  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3057  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  50.28 
 
 
229 aa  186  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0889  periplasmic protein  46.67 
 
 
219 aa  182  4.0000000000000006e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0471962  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0309  hypothetical protein  47.37 
 
 
231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2112  Sulfate adenylyltransferase, small subunit  47.03 
 
 
241 aa  182  5.0000000000000004e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.900528  normal  0.825144 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0130  hypothetical protein  45.58 
 
 
251 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3763  hypothetical protein  47.89 
 
 
230 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0183  hypothetical protein  46.99 
 
 
253 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.1074 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0182  hypothetical protein  46.99 
 
 
230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.234882  normal  0.614975 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0164  hypothetical protein  46.99 
 
 
213 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000051589 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0791  periplasmic protein  49.13 
 
 
213 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000013365  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45920  hypothetical protein  52.38 
 
 
237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0890  hypothetical protein  42.79 
 
 
244 aa  178  4.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0859  hypothetical protein  43.84 
 
 
244 aa  178  4.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5065  hypothetical protein  48.63 
 
 
251 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.333704  normal  0.503778 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3895  hypothetical protein  50.28 
 
 
237 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.762236  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1308  transglutaminase domain protein  42.59 
 
 
243 aa  168  7e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.809484  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1372  hypothetical protein  46.93 
 
 
200 aa  167  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3353  hypothetical protein  44.74 
 
 
224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.526541 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1879  hypothetical protein  44.15 
 
 
238 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0643403 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2096  hypothetical protein  45 
 
 
245 aa  142  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2663  hypothetical protein  43.53 
 
 
253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.918683  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1558  hypothetical protein  41.18 
 
 
203 aa  106  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111516  normal  0.164142 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1153  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  38.78 
 
 
330 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1975  hypothetical protein  39.04 
 
 
406 aa  93.2  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.495543  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1158  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  38.52 
 
 
430 aa  92.4  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0287549 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0566  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  37.84 
 
 
241 aa  91.3  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0003  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  36.03 
 
 
329 aa  89.4  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11115  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1420  hypothetical protein  33.77 
 
 
394 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.548403  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2233  hypothetical protein  31.91 
 
 
228 aa  75.9  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0895  OmpA/MotB  36.21 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000873981  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0168  hypothetical protein  29.38 
 
 
208 aa  68.6  0.00000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00332877  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1230  periplasmic protein-like protein  33.11 
 
 
225 aa  67.4  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0301279 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2758  periplasmic protein-like protein  31.4 
 
 
346 aa  65.9  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.202545  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2244  hypothetical protein  42.86 
 
 
328 aa  65.1  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.419307  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7156  hypothetical protein  35.05 
 
 
251 aa  62  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1220  hypothetical protein  31.62 
 
 
201 aa  52.8  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1259  hypothetical protein  31.62 
 
 
201 aa  52.8  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.344293  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1934  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  29.85 
 
 
202 aa  50.1  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0872  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  32.52 
 
 
207 aa  47.8  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.663458  normal  0.0975549 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4530  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  32.2 
 
 
199 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  0.129757 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4265  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  31.36 
 
 
199 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1029  hypothetical protein  30.77 
 
 
184 aa  46.2  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.487081  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4440  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  28.43 
 
 
200 aa  45.8  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0970  hypothetical protein  30.77 
 
 
184 aa  46.2  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2133  hypothetical protein  27.21 
 
 
206 aa  45.8  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.106116  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2049  hypothetical protein  26.53 
 
 
206 aa  45.4  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0218162  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1726  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  26.47 
 
 
202 aa  45.4  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0957  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  32.38 
 
 
212 aa  45.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00236078 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0778  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  28.21 
 
 
206 aa  44.3  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1351  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  28.57 
 
 
194 aa  43.9  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0197  hypothetical protein  29.41 
 
 
171 aa  43.5  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0625026  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5218  hypothetical protein  26.28 
 
 
208 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.222104 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3902  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  28.47 
 
 
206 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2379  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  29.7 
 
 
191 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.906047  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3279  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  26.92 
 
 
207 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.824885  normal  0.012285 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3481  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  28.57 
 
 
206 aa  42.4  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00539194  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>