139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2672 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2672  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  100 
 
 
320 aa  654    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0519084  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0342  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  33.33 
 
 
314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1764  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  28.75 
 
 
323 aa  114  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.513988  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3797  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  29.5 
 
 
316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00053557 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0033  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  30.26 
 
 
319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0314  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  28.57 
 
 
317 aa  105  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.889469  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1063  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  28.48 
 
 
317 aa  101  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.745912 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1890  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  26.93 
 
 
333 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.966009  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2331  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.46 
 
 
322 aa  100  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0699297  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2063  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.98 
 
 
327 aa  99.8  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.800081  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0468  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  27.07 
 
 
316 aa  99.4  7e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001678  TRAP transporter solute receptor TAXI family precursor  27.3 
 
 
322 aa  99.4  8e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.150837  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0456  immunogenic-related protein  29.04 
 
 
318 aa  98.6  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0371  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  27.74 
 
 
329 aa  98.6  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.671044  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1346  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  27.42 
 
 
316 aa  97.4  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.331988  hitchhiker  0.00000684502 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00793  hypothetical protein  27.3 
 
 
322 aa  97.1  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0356  hypothetical protein  25.55 
 
 
324 aa  96.3  6e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.097907  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3688  hypothetical protein  26.56 
 
 
324 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.269569 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1413  TRAP-T family transporter periplasmic binding component  26.73 
 
 
324 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3483  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.73 
 
 
324 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0797  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  29.62 
 
 
318 aa  94  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000423237  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1252  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.89 
 
 
323 aa  94  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0250918  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003379  immunogenic protein  27.6 
 
 
323 aa  93.2  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0177  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  27.1 
 
 
326 aa  92.8  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3381  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  28.68 
 
 
318 aa  92.8  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0461  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  28.31 
 
 
318 aa  92.8  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73120  hypothetical protein  28.75 
 
 
319 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3568  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  28.31 
 
 
318 aa  92.4  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3566  TRAP transporter solute receptor, TAXI family protein  30.28 
 
 
317 aa  92  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.28304  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0457  response regulator receiver protein  28.31 
 
 
318 aa  92.4  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1556  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  29.66 
 
 
328 aa  92  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0433  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.09 
 
 
318 aa  90.5  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3828  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  26.09 
 
 
318 aa  90.5  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2848  immunogenic protein  24.92 
 
 
328 aa  90.1  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3901  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.09 
 
 
318 aa  90.5  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4024  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.09 
 
 
318 aa  90.5  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2671  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  28.57 
 
 
325 aa  89.7  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3839  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  25.82 
 
 
327 aa  89.4  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0135422  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02419  hypothetical protein  27.6 
 
 
323 aa  89.4  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0608  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  27.17 
 
 
326 aa  88.2  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.516133  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2684  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.79 
 
 
331 aa  87.8  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3213  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.79 
 
 
325 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0937  putative TRAP-type uncharacterized transport system, periplasmic component  29.09 
 
 
320 aa  87  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6347  hypothetical protein  27.83 
 
 
319 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.884307  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4101  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  29.67 
 
 
317 aa  87.4  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32075  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4560  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  29.82 
 
 
317 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0725  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  28 
 
 
322 aa  86.3  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5002  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  27.45 
 
 
315 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117483  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0746  TRAP-T family transporter periplasmic substrate binding subunit  27.51 
 
 
344 aa  84.3  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.842378  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4226  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  27.76 
 
 
317 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0963703  normal  0.823727 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0431  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  29.39 
 
 
316 aa  83.6  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2004  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.83 
 
 
338 aa  83.6  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373091  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4331  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  27.12 
 
 
315 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0888724 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4067  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  27.01 
 
 
318 aa  82.8  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.548232  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2949  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  28.32 
 
 
318 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0733999 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3954  periplasmic binding protein, putative  30.77 
 
 
316 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.391333 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0741  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  27.88 
 
 
348 aa  82.4  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1194  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  29.89 
 
 
329 aa  81.6  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4400  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.67 
 
 
315 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.478919  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1443  TRAP transporter solute receptor  27.22 
 
 
322 aa  81.6  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.552427 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1156  31 kDa immunogenic protein  29.8 
 
 
316 aa  80.9  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.837242  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2429  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  29.85 
 
 
329 aa  80.5  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.25673  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1256  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  25.85 
 
 
344 aa  79.7  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1040  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  24.2 
 
 
324 aa  79.3  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2072  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  23.1 
 
 
317 aa  78.6  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.169091 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0539  immunogenic protein  24.55 
 
 
313 aa  77  0.0000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2365  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  27.24 
 
 
328 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3310  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  25.37 
 
 
386 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.787615  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0817  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  25 
 
 
318 aa  76.3  0.0000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000102609  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2692  immunogenic protein family protein  27 
 
 
329 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1635  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  28.7 
 
 
319 aa  75.1  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0664  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  28.41 
 
 
333 aa  75.9  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1853  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  27.79 
 
 
328 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.45766 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0289  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  27.21 
 
 
337 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4446  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  25.69 
 
 
323 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0640  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.38 
 
 
356 aa  73.6  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3948  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  25.9 
 
 
386 aa  72.8  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4417  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.79 
 
 
348 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0674202 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2159  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  24.07 
 
 
317 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.239874  normal  0.13141 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0649  DNA primase  22.61 
 
 
313 aa  70.5  0.00000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1467  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  26.67 
 
 
332 aa  70.5  0.00000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1090  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  21.98 
 
 
332 aa  70.1  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0945459  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0082  immunogenic protein  24.09 
 
 
312 aa  70.1  0.00000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0148349  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3440  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  25.71 
 
 
342 aa  69.7  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.93321  normal  0.103466 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1613  TRAP dicarboxylate family transporter DctP subunit  26.28 
 
 
317 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1175  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  23.12 
 
 
330 aa  68.9  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.155667  normal  0.336664 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0267  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.28 
 
 
317 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418804  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2110  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  25.29 
 
 
386 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417803  normal  0.0323515 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1635  TAXI family TRAP transporter solute receptor  24.41 
 
 
315 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0832335  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0846  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  31.14 
 
 
306 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.391191  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06717  hypothetical protein  25.44 
 
 
336 aa  66.2  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0874  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  24.92 
 
 
328 aa  65.5  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2520  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  25.59 
 
 
335 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000812  immunogenic protein  26.39 
 
 
336 aa  64.3  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0290  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  25.55 
 
 
317 aa  64.3  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0541635  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3723  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  24.48 
 
 
316 aa  63.9  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2878  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  25.74 
 
 
335 aa  62.4  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.082119  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0194  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  23.82 
 
 
338 aa  62  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022197  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1472  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  25.61 
 
 
651 aa  62  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3623  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  24.62 
 
 
329 aa  61.2  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.410742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>