More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1451 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
202 aa  402  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00096233  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1559  LysE family protein  46.28 
 
 
640 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0672  amino acid efflux pump, RhtB family protein  49.72 
 
 
207 aa  179  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4342  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  49.72 
 
 
207 aa  179  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.701026 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3165  lysine exporter protein LysE/YggA  48.04 
 
 
205 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5281  lysine exporter protein LysE/YggA  48.04 
 
 
205 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.704689  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5024  lysine exporter protein LysE/YggA  47.49 
 
 
205 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.884494  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4470  lysine exporter protein LysE/YggA  46.93 
 
 
205 aa  168  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1806  lysine exporter protein LysE/YggA  47.62 
 
 
199 aa  167  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3122  lysine exporter protein LysE/YggA  46.37 
 
 
204 aa  166  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0053  LysE family protein  47.75 
 
 
280 aa  166  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0052  LysE family protein  47.46 
 
 
205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0074  LysE family translocator protein  47.46 
 
 
205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0636233  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0063  LysE family translocator protein  47.46 
 
 
205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1490  LysE family translocator protein  47.46 
 
 
205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0061  LysE family translocator protein  47.46 
 
 
205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1207  LysE family translocator protein  47.46 
 
 
205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4474  lysine exporter protein LysE/YggA  45.5 
 
 
206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5753  lysine exporter protein LysE/YggA  46.37 
 
 
205 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.123143 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5106  lysine exporter protein LysE/YggA  46.37 
 
 
205 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2947  hypothetical protein  44.33 
 
 
205 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3667  lysine exporter protein LysE/YggA  47.31 
 
 
211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127666  normal  0.0314589 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2677  lysine exporter protein LysE/YggA  45.41 
 
 
203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34800  amino acid transporter LysE  44.33 
 
 
205 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000662816  hitchhiker  0.00481563 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0298  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.22 
 
 
201 aa  160  8.000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3848  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.95 
 
 
200 aa  160  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3234  lysine exporter protein LysE/YggA  44 
 
 
202 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4028  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.45 
 
 
200 aa  160  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  46.99 
 
 
197 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4575  lysine exporter protein LysE/YggA  45.45 
 
 
200 aa  159  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0540942  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3913  lysine exporter protein LysE/YggA  48.28 
 
 
204 aa  157  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2357  lysine exporter protein LysE/YggA  44.26 
 
 
209 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2541  lysine exporter protein LysE/YggA  44.26 
 
 
209 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836946 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2529  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.32 
 
 
197 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2824  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.9 
 
 
197 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00830664  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1531  lysine exporter protein LysE/YggA  39.9 
 
 
197 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  44.26 
 
 
209 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.361786 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0374  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.73 
 
 
201 aa  155  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1560  lysine exporter protein LysE/YggA  39.39 
 
 
197 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.505926  normal  0.722057 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2755  lysine exporter protein LysE/YggA  40.31 
 
 
197 aa  155  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.541681  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1527  lysine exporter protein LysE/YggA  39.39 
 
 
197 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0050843  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2949  lysine exporter protein LysE/YggA  41.54 
 
 
208 aa  154  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2742  lysine exporter protein LysE/YggA  38.89 
 
 
197 aa  154  8e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.13725  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2567  lysine exporter protein LysE/YggA  38.89 
 
 
197 aa  154  8e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2634  lysine exporter protein LysE/YggA  38.89 
 
 
197 aa  154  8e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0643719  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1429  lysine exporter protein LysE/YggA  37.06 
 
 
197 aa  154  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3452  transporter, LysE family  49.44 
 
 
202 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1967  lysine exporter protein LysE/YggA  41.84 
 
 
202 aa  153  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0110071  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2451  lysine exporter protein LysE/YggA  41.94 
 
 
209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1716  amino acid transporter LysE  38.07 
 
 
197 aa  152  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2265  lysine exporter protein LysE/YggA  44.02 
 
 
208 aa  152  4e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.499699  normal  0.537594 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1493  lysine exporter protein (LysE/YggA)  38.14 
 
 
197 aa  151  5e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0246544  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1354  lysine exporter protein LysE/YggA  38.1 
 
 
201 aa  151  5e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1102  lysine exporter protein LysE/YggA  40.3 
 
 
199 aa  151  5.9999999999999996e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3696  LysE family translocator protein  42.16 
 
 
200 aa  151  8e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0501  lysine exporter protein LysE/YggA  44.26 
 
 
197 aa  151  8e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2232  lysine exporter protein LysE/YggA  37.37 
 
 
197 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1362  lysine exporter protein LysE/YggA  43.23 
 
 
196 aa  150  8.999999999999999e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.400331  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3627  lysine exporter protein LysE/YggA  41.41 
 
 
196 aa  150  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0538229  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3939  LysE family translocator protein  42.16 
 
 
200 aa  150  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0257  lysine exporter protein LysE/YggA  42.16 
 
 
200 aa  150  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2478  hypothetical protein  46.07 
 
 
198 aa  150  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.609748 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2788  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.83 
 
 
197 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0595509  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  41.09 
 
 
225 aa  148  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244507  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1684  lysine exporter protein LysE/YggA  37.82 
 
 
198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  unclonable  0.0000017661 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1365  lysine exporter protein LysE/YggA  41.58 
 
 
207 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3096  lysine exporter protein LysE/YggA  41.34 
 
 
212 aa  143  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2508  amino acid transporter LysE  36.56 
 
 
204 aa  142  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.315866  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3162  lysine exporter protein LysE/YggA  42.33 
 
 
201 aa  142  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1041  transmembrane transporter protein, LysE type translocator  42.33 
 
 
195 aa  140  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1055  hypothetical protein  40.31 
 
 
200 aa  140  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2775  lysine exporter protein LysE/YggA  42.39 
 
 
200 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.423256  normal  0.714667 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4107  lysine exporter protein LysE/YggA  38.19 
 
 
207 aa  137  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.319328  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1977  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.13 
 
 
208 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.019501  hitchhiker  0.00000011193 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2526  lysine exporter protein LysE/YggA  38.38 
 
 
201 aa  137  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.332497  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2382  lysine exporter protein LysE/YggA  44.13 
 
 
220 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.268756  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2485  lysine exporter protein LysE/YggA  44.13 
 
 
220 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.107691  decreased coverage  0.0000842589 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2370  lysine exporter protein LysE/YggA  44.13 
 
 
220 aa  135  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0414256  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000909  putative threonine efflux protein  42.7 
 
 
194 aa  134  8e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.850609  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2133  lysine exporter protein (LysE/YggA)  43.78 
 
 
208 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6083  amino acid transporter LysE  38.25 
 
 
201 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2015  hypothetical protein  42.7 
 
 
202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06913  putative threonine efflux protein  42.08 
 
 
199 aa  132  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2797  RhtB family transporter  46.45 
 
 
197 aa  132  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.376861  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1490  lysine exporter protein LysE/YggA  43.78 
 
 
198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2285  hypothetical protein  42.16 
 
 
208 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1754  lysine exporter protein LysE/YggA  42.93 
 
 
208 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.171437  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0235  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.41 
 
 
216 aa  128  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0472066 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2346  hypothetical protein  38.14 
 
 
212 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1396  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.76085 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1315  hypothetical protein  41.05 
 
 
204 aa  124  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4757  lysine exporter protein LysE/YggA  39.9 
 
 
203 aa  122  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852741  normal  0.0209318 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2510  lysine exporter protein LysE/YggA  38.14 
 
 
209 aa  121  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3759  hypothetical protein  39.88 
 
 
174 aa  117  9e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.444425  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1235  lysine exporter protein LysE/YggA  33.51 
 
 
208 aa  116  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0243337  normal  0.0393722 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1429  lysine exporter protein LysE/YggA  37.89 
 
 
197 aa  115  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3106  hypothetical protein  38.97 
 
 
196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1172  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.06 
 
 
196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1834  lysine exporter protein LysE/YggA  42.93 
 
 
208 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.438824  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0720  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.6 
 
 
196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>