More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3649 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  100 
 
 		 224 aa  454  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002331  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.62 
 
 		 223 aa  280  2e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.556001  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2848  Ribulose-phosphate 3-epimerase  63.38 
 
 		 220 aa  279  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.19951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3247  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.38 
 
 		 220 aa  279  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.47 
 
 		 221 aa  278  4e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.47 
 
 		 221 aa  278  4e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00024  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.62 
 
 		 223 aa  278  4e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2726  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.64 
 
 		 225 aa  273  2.0000000000000002e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0067  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  63.76 
 
 		 221 aa  272  3e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0167  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.38 
 
 		 222 aa  271  4.0000000000000004e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0264  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.33 
 
 		 225 aa  270  1e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.241717  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2202  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.63 
 
 		 236 aa  270  1e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.780277  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3374  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.84 
 
 		 221 aa  270  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2696  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.93 
 
 		 227 aa  269  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3623  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.93 
 
 		 228 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0441  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.93 
 
 		 228 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0465  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.93 
 
 		 228 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0508  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.93 
 
 		 228 aa  268  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471552  normal  0.840535 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2858  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.93 
 
 		 228 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4056  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.45 
 
 		 225 aa  268  7e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00103124  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3879  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.45 
 
 		 225 aa  267  8e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2907  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.93 
 
 		 243 aa  267  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.32 
 
 		 221 aa  266  2e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0463  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.74 
 
 		 227 aa  266  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3962  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.21 
 
 		 225 aa  265  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0524071  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0229  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.21 
 
 		 225 aa  265  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0846712  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3723  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.21 
 
 		 225 aa  265  2.9999999999999995e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00616256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3888  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  60.75 
 
 		 225 aa  265  5e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.384968 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0194  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.55 
 
 		 221 aa  265  5e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000208894  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0244  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.21 
 
 		 224 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4611  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.72 
 
 		 224 aa  264  8.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3466  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  57.01 
 
 		 229 aa  263  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0874335  normal  0.826504 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1537  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.14 
 
 		 222 aa  263  1e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4601  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.75 
 
 		 225 aa  263  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.361738  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0566  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.72 
 
 		 224 aa  263  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3515  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.45 
 
 		 228 aa  263  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3494  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.74 
 
 		 238 aa  263  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00334689  hitchhiker  0.000085645 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0381  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.28 
 
 		 223 aa  263  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0346  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.75 
 
 		 224 aa  263  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0292  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.43 
 
 		 225 aa  261  4.999999999999999e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0253  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  60.28 
 
 		 225 aa  261  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2834  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  58.18 
 
 		 230 aa  261  4.999999999999999e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0219  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.75 
 
 		 224 aa  261  4.999999999999999e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3229  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.11 
 
 		 235 aa  261  6e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3756  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.73 
 
 		 225 aa  261  6e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3999  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.81 
 
 		 224 aa  261  6e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.79681 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.81 
 
 		 218 aa  261  8e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3680  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.81 
 
 		 225 aa  260  8.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03238  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.28 
 
 		 225 aa  260  1e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.841593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0327  Ribulose-phosphate 3-epimerase  60.28 
 
 		 225 aa  260  1e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03190  hypothetical protein  60.28 
 
 		 225 aa  260  1e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.725315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0327  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.28 
 
 		 225 aa  260  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.204958  normal  0.201128 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3582  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.28 
 
 		 225 aa  260  1e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.111758  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.75 
 
 		 214 aa  260  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4690  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.28 
 
 		 225 aa  260  1e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.632143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3755  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.81 
 
 		 225 aa  260  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3855  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.28 
 
 		 225 aa  260  1e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004029  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3851  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.81 
 
 		 225 aa  260  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3763  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.28 
 
 		 225 aa  260  1e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0483274  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3662  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.28 
 
 		 225 aa  260  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383295  normal  0.0239622 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0479  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.35 
 
 		 224 aa  259  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1918  Ribulose-phosphate 3-epimerase  59.72 
 
 		 225 aa  259  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.301545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2756  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.96 
 
 		 241 aa  259  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4259  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.72 
 
 		 224 aa  259  3e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0110433 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.25 
 
 		 214 aa  258  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3021  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.17 
 
 		 233 aa  259  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.515085  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2125  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.11 
 
 		 225 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00642843 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3700  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.81 
 
 		 236 aa  259  3e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.75 
 
 		 214 aa  259  3e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.25 
 
 		 214 aa  258  4e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.25 
 
 		 214 aa  258  4e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.25 
 
 		 214 aa  258  4e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.25 
 
 		 214 aa  258  4e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.25 
 
 		 214 aa  258  4e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.25 
 
 		 214 aa  258  4e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.25 
 
 		 214 aa  258  4e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0267  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.81 
 
 		 222 aa  258  4e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.137082  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3682  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.35 
 
 		 225 aa  258  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.341104  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3789  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.35 
 
 		 225 aa  258  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.475261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3899  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.6 
 
 		 228 aa  258  5.0000000000000005e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.312657 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3692  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  59.81 
 
 		 225 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3121  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.52 
 
 		 241 aa  258  6e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.798582  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4077  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.35 
 
 		 224 aa  258  6e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3241  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.55 
 
 		 221 aa  258  6e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3997  Ribulose-phosphate 3-epimerase  58.88 
 
 		 224 aa  256  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3613  Ribulose-phosphate 3-epimerase  58.72 
 
 		 221 aa  256  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0584  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.05 
 
 		 236 aa  257  1e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.821706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4195  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.88 
 
 		 224 aa  256  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3799  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.35 
 
 		 225 aa  257  1e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0860843 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.25 
 
 		 214 aa  257  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3176  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.85 
 
 		 266 aa  257  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4107  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.88 
 
 		 224 aa  256  1e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.887514  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1996  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.87 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5270  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.42 
 
 		 235 aa  256  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.12238 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46660  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.48 
 
 		 224 aa  256  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4675  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.21 
 
 		 235 aa  256  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1586  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.7 
 
 		 219 aa  256  2e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2620  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.96 
 
 		 233 aa  256  2e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.498011  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1619  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.86 
 
 		 234 aa  256  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2606  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.88 
 
 		 236 aa  256  2e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.203389 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>