280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3588 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3588  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
389 aa  785    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909345  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40260  YfgL-like phosphoquinolipoprotein kinase  31.12 
 
 
384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0902958  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3497  Pyrrolo-quinoline quinone  30.41 
 
 
379 aa  159  8e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  33.23 
 
 
387 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1130  Pyrrolo-quinoline quinone  31.44 
 
 
389 aa  154  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4598  Pyrrolo-quinoline quinone  31.29 
 
 
380 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  30.06 
 
 
384 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  29.76 
 
 
384 aa  151  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1251  quinoprotein  30.12 
 
 
381 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.926962  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1437  PQQ enzyme repeat domain protein  30.12 
 
 
384 aa  149  7e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4322  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  28.79 
 
 
389 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000139016 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0899  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  27.76 
 
 
380 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000144468 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0856  hypothetical protein  28.79 
 
 
380 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0886  Pyrrolo-quinoline quinone  28.79 
 
 
380 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80102  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14910  hypothetical protein  31.45 
 
 
380 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1314  hypothetical protein  31.16 
 
 
380 aa  143  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  31.08 
 
 
372 aa  137  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.31 
 
 
392 aa  136  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3085  Pyrrolo-quinoline quinone  28.29 
 
 
455 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00761305  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0415  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.66 
 
 
393 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.873233  hitchhiker  0.00131878 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.66 
 
 
393 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02978  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.93 
 
 
402 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.373211  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.66 
 
 
393 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0624  Pyrrolo-quinoline quinone  30.64 
 
 
417 aa  134  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.3 
 
 
393 aa  132  7.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1661  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  28.53 
 
 
402 aa  130  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1786  Pyrrolo-quinoline quinone  29.67 
 
 
381 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1154  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  28.71 
 
 
392 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.536052 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004346  YfgL protein  27.07 
 
 
386 aa  130  5.0000000000000004e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1062  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  28.71 
 
 
392 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  28.81 
 
 
398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000513554  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2664  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.33 
 
 
392 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.280231 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.64 
 
 
393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  29.33 
 
 
392 aa  127  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2734  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.03 
 
 
393 aa  126  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1417  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  28.36 
 
 
386 aa  127  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0124773 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1608  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  29.38 
 
 
395 aa  126  6e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0821312 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1936  PQQ enzyme repeat domain protein  29.38 
 
 
395 aa  126  6e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2538  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  29.5 
 
 
381 aa  126  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0468312  hitchhiker  0.00031384 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  29.05 
 
 
392 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1218  lipoprotein transmembrane  27.2 
 
 
388 aa  125  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.032892  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.05 
 
 
392 aa  125  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  29.05 
 
 
392 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.05 
 
 
392 aa  125  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.05 
 
 
392 aa  125  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  29.3 
 
 
458 aa  125  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.549176  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2083  Pyrrolo-quinoline quinone  27.23 
 
 
392 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397286  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.07 
 
 
386 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0667  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  27.84 
 
 
385 aa  124  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1597  transcription accessory protein, TEX  29.2 
 
 
386 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207769  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2887  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.05 
 
 
392 aa  124  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00225508  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3736  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.77 
 
 
392 aa  124  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550553  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.85 
 
 
393 aa  124  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0685  hypothetical protein  25.95 
 
 
387 aa  123  5e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000893693  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.41 
 
 
392 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.23 
 
 
385 aa  123  5e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.07 
 
 
392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2888  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.07 
 
 
392 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.07 
 
 
392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.07 
 
 
392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1171  Pyrrolo-quinoline quinone  26.7 
 
 
399 aa  122  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0406546  normal  0.22444 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2374  Pyrrolo-quinoline quinone  27.1 
 
 
450 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.145531  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.26 
 
 
393 aa  119  7e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3387  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  30 
 
 
380 aa  119  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1288  Pyrrolo-quinoline quinone  27.14 
 
 
388 aa  119  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.38604  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0291  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.92 
 
 
386 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3123  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.36 
 
 
415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126817  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0655  Pyrrolo-quinoline quinone  25 
 
 
402 aa  117  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.808652  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4249  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.16 
 
 
414 aa  117  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.548158  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2197  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  29.64 
 
 
385 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.763782  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06109  serine/threonine protein kinase  27.98 
 
 
400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144457  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2982  Pyrrolo-quinoline quinone  30.6 
 
 
386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1437  PQQ repeat-containing protein  27.07 
 
 
384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.234341  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2103  Pyrrolo-quinoline quinone  27.56 
 
 
383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0841326  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01057  serine/threonine protein kinase  27.98 
 
 
400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.553657  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0944  Pyrrolo-quinoline quinone  26.32 
 
 
448 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1466  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25.15 
 
 
381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2046  hypothetical protein  31.23 
 
 
400 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500116  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1747  Pyrrolo-quinoline quinone  24.27 
 
 
381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1712  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.26 
 
 
411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.368  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1720  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  24.27 
 
 
350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.363455 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1776  serine/threonine protein kinase  26.26 
 
 
411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.801728  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1833  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  24.56 
 
 
381 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6270  Pyrrolo-quinoline quinone  24.56 
 
 
381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1809  Pyrrolo-quinoline quinone  24.56 
 
 
381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5110  Pyrrolo-quinoline quinone  24.56 
 
 
381 aa  109  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.205621  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2204  Pyrrolo-quinoline quinone  24.38 
 
 
444 aa  109  8.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  28.49 
 
 
365 aa  109  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0597  pyrrolo-quinoline quinone  26.61 
 
 
380 aa  109  9.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.601567 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2698  putative quinoprotein  29.81 
 
 
448 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.578773  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1355  Pyrrolo-quinoline quinone  29.81 
 
 
454 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  0.026391 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1254  Pyrrolo-quinoline quinone  29.74 
 
 
383 aa  107  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00763008  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0737  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  30.65 
 
 
396 aa  107  5e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.918396  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2497  Pyrrolo-quinoline quinone  26.44 
 
 
475 aa  106  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2161  Pyrrolo-quinoline quinone  25.97 
 
 
454 aa  106  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.905715  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  27.88 
 
 
383 aa  106  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2237  putative lipoprotein  31.1 
 
 
381 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1342  putative lipoprotein  25.55 
 
 
381 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2225  PQQ repeat-containing protein  25.55 
 
 
381 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0065  putative lipoprotein  25.55 
 
 
381 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0585728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>