More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2872 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
355 aa  735    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0680968 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1768  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.57 
 
 
352 aa  382  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.000159776  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4399  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.57 
 
 
353 aa  367  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0420  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.72 
 
 
355 aa  360  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2975  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.43 
 
 
353 aa  360  3e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.316579 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3352  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  47.89 
 
 
355 aa  333  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.401631  normal  0.133016 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3990  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.86 
 
 
355 aa  218  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.72 
 
 
367 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.94 
 
 
373 aa  145  8.000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00197458  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1270  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.7 
 
 
368 aa  144  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.329626 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.68 
 
 
680 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147717  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2646  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.23 
 
 
355 aa  137  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0196  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.18 
 
 
363 aa  135  9e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.973232  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2779  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.72 
 
 
367 aa  135  9e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0250  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.91 
 
 
363 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0777  dNTP-hexose dehydratase/epimerase  31.44 
 
 
338 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.955272  normal  0.0951081 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.66 
 
 
369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.437184  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.43 
 
 
354 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.17 
 
 
339 aa  125  8.000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3217  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.51 
 
 
354 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2762  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.4 
 
 
339 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.87 
 
 
341 aa  124  3e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.99 
 
 
354 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.61197  normal  0.556859 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.06 
 
 
669 aa  122  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0960663 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1989  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.66 
 
 
353 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00659255 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.77 
 
 
339 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.336676  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1189  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.48 
 
 
352 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
345 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1120  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.48 
 
 
352 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0108801  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6411  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.98 
 
 
357 aa  119  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1061  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.48 
 
 
352 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.808093  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.97 
 
 
360 aa  119  9e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0627905  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0519  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.55 
 
 
672 aa  119  9e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.812808  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2428  CDP-paratose 2-epimerase  28.09 
 
 
338 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  hitchhiker  0.000207654 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.49 
 
 
684 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.155843  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2537  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.78 
 
 
685 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000121125 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.26 
 
 
672 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.052836 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3530  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.97 
 
 
358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.229301 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.98 
 
 
354 aa  112  7.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.4 
 
 
357 aa  112  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.798779 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.7 
 
 
357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.154298  normal  0.138657 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.17 
 
 
358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.707519  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2871  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.97 
 
 
352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0630235 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0520  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.65 
 
 
351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.12 
 
 
342 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2077  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 
363 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.568981  hitchhiker  0.00613192 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0859  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.1 
 
 
342 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.51 
 
 
364 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0770236  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3699  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.92 
 
 
353 aa  102  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.682682  normal  0.543496 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.14 
 
 
314 aa  101  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0305  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.12 
 
 
342 aa  100  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4298  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.73 
 
 
355 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0228  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.29 
 
 
310 aa  98.6  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.194906  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0380  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.67 
 
 
312 aa  97.4  3e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.94 
 
 
306 aa  97.1  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0036  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.88 
 
 
316 aa  96.7  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0174817 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0259  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.37 
 
 
357 aa  96.3  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0046  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.07 
 
 
357 aa  96.3  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0041  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.17 
 
 
357 aa  95.5  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0865438  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1117  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.78 
 
 
322 aa  94.4  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565824  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1298  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.5 
 
 
322 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895742 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2232  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.74 
 
 
318 aa  94  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1111  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.21 
 
 
322 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3035  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.14 
 
 
362 aa  93.2  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3296  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.94 
 
 
332 aa  92.8  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0222371  normal  0.147451 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1337  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.93 
 
 
322 aa  92  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120656  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1137  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.21 
 
 
322 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1230  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.21 
 
 
322 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.41 
 
 
352 aa  92  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0512  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.8 
 
 
339 aa  91.7  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1375  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.93 
 
 
322 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.42 
 
 
354 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.261657  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1685  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.56 
 
 
342 aa  90.9  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4298  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.47 
 
 
354 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.901656 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6347  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.39 
 
 
330 aa  90.5  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8193  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.17 
 
 
338 aa  90.5  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1269  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.65 
 
 
323 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.281724  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.22 
 
 
313 aa  90.1  5e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1611  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.33 
 
 
350 aa  89.7  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1421  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.85 
 
 
345 aa  89.4  8e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.829571  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2098  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.21 
 
 
356 aa  89.4  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.21 
 
 
320 aa  89  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000773597 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  27.43 
 
 
329 aa  87.8  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1658  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.27 
 
 
359 aa  88.2  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.548961  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2401  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.44 
 
 
398 aa  87.4  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.78 
 
 
323 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.416009  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.18 
 
 
312 aa  87.4  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3391  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.66 
 
 
354 aa  87.4  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.478209  normal  0.0989265 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1222  dTDP-glucose-4,6-dehydratase  23.23 
 
 
348 aa  87.8  3e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1198  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.02 
 
 
348 aa  87  4e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.42 
 
 
333 aa  87  5e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.459619  normal  0.136094 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  29.65 
 
 
319 aa  86.3  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  28.37 
 
 
328 aa  86.3  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3100  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.81 
 
 
328 aa  85.5  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.226707  normal  0.106215 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4138  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.83 
 
 
330 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000244942 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.14 
 
 
336 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.86 
 
 
315 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4425  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.18 
 
 
336 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14390  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.73 
 
 
356 aa  84.7  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.449381  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.2 
 
 
327 aa  84.7  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>