More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1629 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1629  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  100 
 
 		 219 aa  455  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3170  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  62.56 
 
 		 216 aa  269  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0176  endonuclease III  63.82 
 
 		 249 aa  267  8e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2517  endonuclease III  61.58 
 
 		 216 aa  266  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1169  endonuclease III/Nth  61.08 
 
 		 236 aa  265  2.9999999999999995e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0346  endonuclease III  63.24 
 
 		 261 aa  265  4e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0360921  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0381  endonuclease III  61.17 
 
 		 258 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0159  endonuclease III  62.81 
 
 		 260 aa  262  3e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0166  endonuclease III  62.81 
 
 		 248 aa  261  4e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2824  endonuclease III  64.14 
 
 		 250 aa  261  4.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105195 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2747  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  60.77 
 
 		 212 aa  261  6e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.81262  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3842  endonuclease III  57.97 
 
 		 254 aa  259  3e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0439  endonuclease III  61.76 
 
 		 254 aa  258  6e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.45571  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3567  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  60.58 
 
 		 268 aa  258  6e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1562  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  62 
 
 		 226 aa  258  7e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888667 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0339  endonuclease III  62.81 
 
 		 256 aa  257  7e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0153  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  62.5 
 
 		 237 aa  257  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1155  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  60.4 
 
 		 210 aa  256  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0201  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  63.32 
 
 		 274 aa  256  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2633  endonuclease III  61.5 
 
 		 225 aa  254  5e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3441  endonuclease III  57.84 
 
 		 260 aa  254  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1499  endonuclease III  59.2 
 
 		 219 aa  254  7e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3568  endonuclease III  61.69 
 
 		 214 aa  254  9e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1092  endonuclease III  62.56 
 
 		 212 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3375  endonuclease III  56.04 
 
 		 236 aa  253  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3741  endonuclease III  57.35 
 
 		 260 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2297  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  60.5 
 
 		 212 aa  251  5.000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2607  endonuclease III  60.3 
 
 		 217 aa  250  9.000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4320  endonuclease III  61.54 
 
 		 212 aa  250  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0205  endonuclease III/Nth  60.8 
 
 		 252 aa  250  1e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.911472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1314  endonuclease III  57.77 
 
 		 230 aa  249  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570319  normal  0.296572 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2793  endonuclease III  56.93 
 
 		 211 aa  249  3e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0932  endonuclease III  56.46 
 
 		 212 aa  249  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2500  endonuclease III  63.24 
 
 		 240 aa  248  3e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666144  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0463  endonuclease III  57.71 
 
 		 226 aa  248  4e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0687351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0809  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  58.91 
 
 		 211 aa  248  4e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1121  endonuclease III  60 
 
 		 212 aa  248  5e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1014  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  58.21 
 
 		 214 aa  248  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.969692 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2465  endonuclease III  60.2 
 
 		 212 aa  248  6e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1133  endonuclease III  61 
 
 		 335 aa  247  8e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.620108 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0532  endonuclease III  59.49 
 
 		 213 aa  246  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000213835  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2939  endonuclease III  55.94 
 
 		 211 aa  246  2e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0732  endonuclease III  57.92 
 
 		 211 aa  246  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1046  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  56.31 
 
 		 214 aa  246  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1634  endonuclease III  60 
 
 		 212 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0724  endonuclease III  57.49 
 
 		 213 aa  245  4e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.155914  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2079  endonuclease III  58.91 
 
 		 214 aa  245  4e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.29657 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2655  endonuclease III  60.4 
 
 		 212 aa  245  4e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0162  endonuclease III  59.3 
 
 		 262 aa  244  4.9999999999999997e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.562877  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2571  endonuclease III  58.85 
 
 		 215 aa  244  6e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1316  endonuclease III  58.29 
 
 		 252 aa  244  6.999999999999999e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2682  endonuclease III  59.09 
 
 		 220 aa  243  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2306  endonuclease III  59.09 
 
 		 220 aa  243  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3888  endonuclease III/Nth  58.08 
 
 		 212 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.324947 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1065  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  56.16 
 
 		 211 aa  243  1.9999999999999999e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0698164  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00782  endonuclease III  58.21 
 
 		 236 aa  242  3e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0572206  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4513  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  58.5 
 
 		 212 aa  241  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1665  endonuclease III  56.93 
 
 		 228 aa  241  6e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.628404  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4149  endonuclease III  57.58 
 
 		 212 aa  241  7e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1735  endonuclease III  57.58 
 
 		 215 aa  241  7.999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.61574  normal  0.277364 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0880  endonuclease III  57.14 
 
 		 231 aa  241  7.999999999999999e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000630803  hitchhiker  0.000000662064 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0970  endonuclease III  58.16 
 
 		 214 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99745  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19210  endonuclease III/Nth  58.46 
 
 		 212 aa  241  7.999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24401  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1866  endonuclease III  55.45 
 
 		 211 aa  241  9e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1610  endonuclease III  56.44 
 
 		 228 aa  240  1e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2122  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  55.4 
 
 		 212 aa  240  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.134945  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3486  endonuclease III  59.6 
 
 		 287 aa  240  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.607527  normal  0.202788 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2319  endonuclease III  56.5 
 
 		 211 aa  239  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0597  endonuclease III  61.03 
 
 		 233 aa  239  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.326491 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0006  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  57.64 
 
 		 231 aa  239  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.179819  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1815  endonuclease III  55.72 
 
 		 211 aa  239  2.9999999999999997e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000116865  decreased coverage  0.000297282 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2345  endonuclease III  55.61 
 
 		 211 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0586  endonuclease III  60.51 
 
 		 270 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.130432  normal  0.224481 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4249  endonuclease III  59.09 
 
 		 249 aa  238  4e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.884041  normal  0.624306 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002943  endonuclease III  56 
 
 		 213 aa  238  5e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00243051  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1836  endonuclease III  57.95 
 
 		 213 aa  238  5e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.194851  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  60.51 
 
 		 213 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1030  endonuclease III  57.5 
 
 		 210 aa  238  5.999999999999999e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000273588  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2019  endonuclease III  56.5 
 
 		 211 aa  238  5.999999999999999e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4758  endonuclease III  58.59 
 
 		 248 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1563  endonuclease III  55.61 
 
 		 211 aa  238  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18880  endonuclease III  56.22 
 
 		 212 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00491393  normal  0.0304533 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1922  endonuclease III  56.72 
 
 		 211 aa  238  6.999999999999999e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2246  endonuclease III  57.14 
 
 		 214 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.769441 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1889  endonuclease III  55.61 
 
 		 211 aa  237  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01603  DNA glycosylase and apyrimidinic (AP) lyase (endonuclease III)  55.12 
 
 		 211 aa  237  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00133572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2008  endonuclease III  55.12 
 
 		 211 aa  237  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00632932  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1931  endonuclease III  56.63 
 
 		 214 aa  237  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.514789  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0305  endonuclease III  56.63 
 
 		 214 aa  237  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.77155  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0843  endonuclease III  56.63 
 
 		 214 aa  237  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667209  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1822  endonuclease III  55.12 
 
 		 211 aa  237  1e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.692656  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1022  endonuclease III  56.63 
 
 		 214 aa  237  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.99743  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1398  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  58.97 
 
 		 212 aa  237  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1183  endonuclease III  56.63 
 
 		 214 aa  237  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123601  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3106  endonuclease III  54.63 
 
 		 252 aa  237  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1709  endonuclease III  55.12 
 
 		 211 aa  237  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00510464  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02970  endonuclease III  55.39 
 
 		 217 aa  237  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1566  endonuclease III  55.12 
 
 		 211 aa  237  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1175  endonuclease III  56.63 
 
 		 214 aa  237  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01593  hypothetical protein  55.12 
 
 		 211 aa  237  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>