93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0872 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1075  deoxyribonuclease  100 
 
 		 69 aa  133  7.000000000000001e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1601  deoxyribonuclease  100 
 
 		 69 aa  133  7.000000000000001e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.919266  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0872  deoxyribonuclease  100 
 
 		 69 aa  133  7.000000000000001e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.375829  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1089  deoxyribonuclease  85.51 
 
 		 69 aa  101  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0835  deoxyribonuclease  65.57 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00148307  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0304  hypothetical protein  62.5 
 
 		 68 aa  73.6  0.0000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1445  RNA-binding protein  55.74 
 
 		 63 aa  72  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0604  hypothetical protein  58.62 
 
 		 67 aa  71.6  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0082041  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1025  hypothetical protein  55.36 
 
 		 68 aa  68.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1026  hypothetical protein  55.17 
 
 		 68 aa  67.4  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1027  hypothetical protein  53.45 
 
 		 68 aa  67  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1028  hypothetical protein  49.18 
 
 		 68 aa  63.9  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1431  deoxyribonuclease  40.3 
 
 		 74 aa  63.5  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0581  deoxyribonuclease  43.28 
 
 		 74 aa  62.8  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0144298  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1423  translation initiation factor IF-2 subunit beta  52.63 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0165  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  53.57 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1372  translation initiation factor IF-2 subunit beta  49.12 
 
 		 202 aa  61.2  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0180  translation initiation factor IF-2 subunit beta  47.27 
 
 		 208 aa  60.8  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2048  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  48.33 
 
 		 273 aa  60.5  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.875415  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1143  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  44.07 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0552  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  52.63 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0697553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1019  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  45 
 
 		 262 aa  57  0.00000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.35921 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4614  cyclic nucleotide-binding protein  50.88 
 
 		 134 aa  57  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3210  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  54.39 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217613  normal  0.112347 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1298  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  47.62 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2908  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  49.21 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2770  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  50.88 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.776355  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1438  RNA methyltransferase  44.64 
 
 		 459 aa  54.7  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1239  deoxyribonuclease  44.64 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.331462  hitchhiker  0.00677702 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1299  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  43.08 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1792  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  41.67 
 
 		 256 aa  52.4  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1249  translation initiation factor IF-2 subunit beta  35.38 
 
 		 204 aa  51.6  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00922141  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3644  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  42.11 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0455  RNA methyltransferase, TrmA family  45.61 
 
 		 451 aa  50.4  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1667  deoxyribonuclease  42.86 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  46.15 
 
 		 448 aa  48.5  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4802  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  38.89 
 
 		 485 aa  48.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.810738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0779  translation initiation factor IF-2 subunit beta  40 
 
 		 204 aa  48.1  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.157582  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0434  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  41.94 
 
 		 269 aa  47.8  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.113038  normal  0.345582 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0453  deoxyribonuclease  37.5 
 
 		 79 aa  47.4  0.00007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3102  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  44.64 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1613  deoxyribonuclease  41.51 
 
 		 79 aa  46.2  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1821  deoxyribonuclease  40.74 
 
 		 80 aa  46.2  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0818  translation initiation factor IF-2 subunit beta  39.29 
 
 		 203 aa  46.6  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.487297 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2830  Translation initiation factor IF2/IF5  40.74 
 
 		 203 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  38.18 
 
 		 471 aa  45.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0483  translation initiation factor IF-2 subunit beta  31.34 
 
 		 204 aa  45.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.677558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  38.46 
 
 		 455 aa  45.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0690  RNA methyltransferase, TrmA family  41.82 
 
 		 449 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2170  translation initiation factor IF-2 subunit beta  34.38 
 
 		 205 aa  45.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0985  Translation initiation factor IF2/IF5  38.89 
 
 		 203 aa  44.7  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.849775  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  38.89 
 
 		 458 aa  44.7  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0702  tRNA methyltransferase, TrmA family  45.65 
 
 		 453 aa  44.7  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.307327  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2249  RNA methyltransferase, TrmA family  38.98 
 
 		 458 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79134  hitchhiker  0.00749966 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2225  tRNA (uracil-5-) -methyltransferase  43.75 
 
 		 419 aa  44.7  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3306  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  36.07 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0633  RNA methyltransferase  39.58 
 
 		 451 aa  44.7  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.449857  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0850  RNA methyltransferase, TrmA family  37.93 
 
 		 407 aa  44.3  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0080  translation initiation factor IF-2 subunit beta  35.85 
 
 		 203 aa  43.9  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  36.73 
 
 		 460 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0782  RNA methyltransferase, TrmA family  40.82 
 
 		 456 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14607  normal  0.115427 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  33.33 
 
 		 436 aa  43.5  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1849  RNA methyltransferase, TrmA family  42 
 
 		 437 aa  42  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1493  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  41.67 
 
 		 450 aa  42.4  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00115343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1622  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  36.51 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.547238  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  37.04 
 
 		 454 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  37.04 
 
 		 454 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1190  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  35 
 
 		 267 aa  42  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1324  Translation initiation factor IF2/IF5  33.33 
 
 		 203 aa  41.6  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.337196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  37.04 
 
 		 458 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  37.04 
 
 		 458 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  37.04 
 
 		 458 aa  41.6  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2144  RNA methyltransferase  37.74 
 
 		 439 aa  41.6  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.090086  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0159  RNA methyltransferase  39.13 
 
 		 468 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  37.04 
 
 		 458 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  37.04 
 
 		 458 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  37.04 
 
 		 458 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  37.04 
 
 		 460 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3618  RNA methyltransferase  28 
 
 		 424 aa  41.2  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.22847  normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  37.04 
 
 		 458 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0289  RNA methyltransferase  32.81 
 
 		 488 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1577  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  35.19 
 
 		 464 aa  41.6  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  40.98 
 
 		 562 aa  41.2  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3654  TrmA family RNA methyltransferase  38.6 
 
 		 455 aa  41.2  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.412422  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  29.63 
 
 		 461 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1783  RNA methyltransferase  42.86 
 
 		 446 aa  40.4  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  36.54 
 
 		 453 aa  40.8  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1117  translation initiation factor aIF-2, beta subunit  45.95 
 
 		 205 aa  40.4  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000692895  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  29.63 
 
 		 461 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0963  RNA methyltransferase, TrmA family  35.29 
 
 		 457 aa  40.4  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.128465  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0467  RNA methyltransferase, TrmA family  30.19 
 
 		 454 aa  40.4  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3260  23S RNA methyltransferase J  46.43 
 
 		 263 aa  40.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0985526  normal  0.474251 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2060  RNA methyltransferase  32.69 
 
 		 468 aa  40  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.23059 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>