More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0518 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0518  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 		 444 aa  889    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.604563  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1390  phosphoribosylamine--glycine ligase  95.95 
 
 		 444 aa  859    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1379  phosphoribosylamine--glycine ligase  82.58 
 
 		 443 aa  745    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1322  phosphoribosylamine--glycine ligase  75.11 
 
 		 445 aa  676    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1246  phosphoribosylamine--glycine ligase  94.14 
 
 		 444 aa  848    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1100  phosphoribosylamine/glycine ligase  53.38 
 
 		 442 aa  432  1e-120  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0363235  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3513  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.9 
 
 		 433 aa  433  1e-120  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.697778 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1056  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.09 
 
 		 432 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2359  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.29 
 
 		 430 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.110333 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0840  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.15 
 
 		 427 aa  390  1e-107  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.464676 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0316  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.45 
 
 		 430 aa  387  1e-106  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.412175  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1645  phosphoribosylamine-glycine ligase  46.74 
 
 		 439 aa  379  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1638  phosphoribosylamine-glycine ligase  46.74 
 
 		 439 aa  379  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1112  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.27 
 
 		 432 aa  378  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2980  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.62 
 
 		 430 aa  375  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1000  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.83 
 
 		 430 aa  376  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.14412  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1688  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.7 
 
 		 430 aa  373  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1295  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.92 
 
 		 427 aa  365  1e-100  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.058661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0506  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.57 
 
 		 430 aa  355  6.999999999999999e-97  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.437456  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2316  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.2 
 
 		 446 aa  343  2.9999999999999997e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.306508 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0663  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.91 
 
 		 490 aa  274  2.0000000000000002e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1983  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.2 
 
 		 477 aa  271  2e-71  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.601261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1907  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.18 
 
 		 478 aa  261  3e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.059952  normal  0.308867 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0106  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.08 
 
 		 478 aa  252  1e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0907034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.18 
 
 		 419 aa  251  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.32 
 
 		 419 aa  249  5e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1696  phosphoribosylamine/glycine ligase  37.45 
 
 		 479 aa  249  6e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0036  phosphoribosylamine/glycine ligase  36.95 
 
 		 430 aa  244  1.9999999999999999e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.05 
 
 		 425 aa  243  3.9999999999999997e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2189  phosphoribosylamine--glycine ligase  36 
 
 		 477 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2904  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.79 
 
 		 423 aa  239  8e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000288348  normal  0.785686 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.41 
 
 		 423 aa  238  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1532  phosphoribosylamine/glycine ligase  34.41 
 
 		 423 aa  235  1.0000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.612843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0431  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.64 
 
 		 433 aa  233  5e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.19 
 
 		 419 aa  232  8.000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1140  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.29 
 
 		 430 aa  232  8.000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.77 
 
 		 422 aa  232  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.29 
 
 		 428 aa  230  4e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000323466  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.11 
 
 		 423 aa  230  4e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1444  phosphoribosylamine/glycine ligase  34.87 
 
 		 420 aa  230  5e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3585  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.48 
 
 		 432 aa  229  6e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4037  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.71 
 
 		 432 aa  229  8e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0440  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.25 
 
 		 432 aa  229  8e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3914  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.71 
 
 		 432 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0419  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.48 
 
 		 432 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0441  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.02 
 
 		 432 aa  227  4e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3871  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.94 
 
 		 435 aa  227  4e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.0530756 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4180  phosphoribosylamine/glycine ligase  33.71 
 
 		 435 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.94163  normal  0.510323 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3841  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.48 
 
 		 432 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.111405 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11500  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.68 
 
 		 430 aa  226  6e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.089244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0519  phosphoribosylamine/glycine ligase  35.25 
 
 		 415 aa  225  1e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.941545  normal  0.807449 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.26 
 
 		 425 aa  225  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.71 
 
 		 430 aa  225  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1894  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.79 
 
 		 481 aa  225  1e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.79 
 
 		 423 aa  225  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  33.03 
 
 		 430 aa  225  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0127  phosphoribosylamine/glycine ligase  34.49 
 
 		 413 aa  225  1e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4327  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.49 
 
 		 431 aa  224  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.26 
 
 		 427 aa  224  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.72 
 
 		 423 aa  224  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1999  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.83 
 
 		 429 aa  224  3e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00638776  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0444  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.79 
 
 		 432 aa  224  3e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2827  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.11 
 
 		 437 aa  223  4e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000587328  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0295  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.64 
 
 		 430 aa  223  6e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.49 
 
 		 423 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.64 
 
 		 429 aa  222  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3402  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.33 
 
 		 432 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0838  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.94 
 
 		 425 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.083606  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0619  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.71 
 
 		 427 aa  221  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.374111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.28 
 
 		 433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.98 
 
 		 424 aa  219  6e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2684  phosphoribosylamine/glycine ligase  34.02 
 
 		 432 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0337126  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3379  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.87 
 
 		 414 aa  218  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0459  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.41 
 
 		 429 aa  219  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1699  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.41 
 
 		 427 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251383  normal  0.989876 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0443  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.18 
 
 		 430 aa  219  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.201644 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.25 
 
 		 423 aa  218  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1034  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.86 
 
 		 423 aa  218  1e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.9 
 
 		 429 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0756  phosphoribosylamine/glycine ligase  31.41 
 
 		 424 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.721746  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  33.48 
 
 		 704 aa  217  2.9999999999999998e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.67 
 
 		 429 aa  217  4e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2843  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.26 
 
 		 430 aa  216  5e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0492  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.02 
 
 		 433 aa  216  5e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3219  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.58 
 
 		 429 aa  216  5e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.708681 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2988  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.66 
 
 		 428 aa  216  5.9999999999999996e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.97 
 
 		 429 aa  216  5.9999999999999996e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0221  phosphoribosylamine/glycine ligase  34.33 
 
 		 427 aa  216  8e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.529077 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4544  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.25 
 
 		 428 aa  216  9e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.48 
 
 		 422 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27830  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.85 
 
 		 421 aa  215  9.999999999999999e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  34.47 
 
 		 425 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3202  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.57 
 
 		 426 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1729  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.18 
 
 		 430 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.1 
 
 		 431 aa  214  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2113  phosphoribosylamine/glycine ligase  35.39 
 
 		 416 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000276572  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2552  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.05 
 
 		 426 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0177333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1989  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.56 
 
 		 422 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1412  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.25 
 
 		 422 aa  215  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.8215  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3465  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.8 
 
 		 456 aa  214  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>