More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0255 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  96.73 
 
 
397 aa  739    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  91.44 
 
 
397 aa  708    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  100 
 
 
397 aa  785    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  76.83 
 
 
397 aa  616  1e-175  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  69.02 
 
 
397 aa  568  1e-161  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  71.79 
 
 
397 aa  565  1e-160  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  71.79 
 
 
397 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  71.03 
 
 
397 aa  560  1e-158  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  69.77 
 
 
397 aa  531  1e-149  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  68.01 
 
 
397 aa  525  1e-148  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  68.77 
 
 
397 aa  521  1e-146  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.395515 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1336  hypothetical protein  55.92 
 
 
395 aa  434  1e-120  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  29.88 
 
 
400 aa  187  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  30.99 
 
 
399 aa  186  7e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  29.66 
 
 
401 aa  181  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  29.98 
 
 
402 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  29.98 
 
 
402 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  32.76 
 
 
414 aa  179  7e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  30.07 
 
 
400 aa  176  7e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  29.7 
 
 
409 aa  173  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  30.9 
 
 
414 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  28.68 
 
 
402 aa  171  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  30.02 
 
 
400 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  30.67 
 
 
400 aa  171  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  29.63 
 
 
408 aa  170  4e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  29.47 
 
 
403 aa  169  8e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  27.64 
 
 
402 aa  168  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  31.37 
 
 
443 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  29.54 
 
 
400 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  28.4 
 
 
401 aa  166  9e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0953  hypothetical protein  29.06 
 
 
402 aa  164  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3708  ABC transporter permease protein  26.63 
 
 
399 aa  163  4.0000000000000004e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  30.02 
 
 
414 aa  160  3e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  31.29 
 
 
415 aa  160  4e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  28.5 
 
 
401 aa  160  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  30.37 
 
 
414 aa  159  6e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  28.26 
 
 
409 aa  159  9e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  28.71 
 
 
403 aa  159  9e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  27.46 
 
 
387 aa  158  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0635  ABC transporter, inner membrane subunit  30 
 
 
435 aa  157  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000706682  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  29.56 
 
 
394 aa  158  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  27.21 
 
 
406 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3479  protein of unknown function DUF214  28.67 
 
 
399 aa  157  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  28.75 
 
 
401 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  28.75 
 
 
401 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  29.57 
 
 
409 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  28.21 
 
 
405 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  29.57 
 
 
409 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  28.21 
 
 
405 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0759  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  30.23 
 
 
641 aa  155  2e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.043367  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3709  ABC transporter permease protein  26.15 
 
 
404 aa  155  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  28.08 
 
 
644 aa  154  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  28.14 
 
 
643 aa  153  4e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  30.09 
 
 
404 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  26.62 
 
 
658 aa  152  7e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  28.81 
 
 
407 aa  152  7e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0954  hypothetical protein  26.83 
 
 
399 aa  152  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  29.17 
 
 
398 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  27.12 
 
 
411 aa  151  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  28.77 
 
 
405 aa  150  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  28.4 
 
 
405 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0585  hypothetical protein  28.78 
 
 
402 aa  149  7e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000219996  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0699  hypothetical protein  30.73 
 
 
404 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0151116  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  27.79 
 
 
410 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0109  protein of unknown function DUF214  27.92 
 
 
419 aa  147  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  29.01 
 
 
398 aa  147  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  27.5 
 
 
402 aa  147  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1676  hypothetical protein  29.37 
 
 
412 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.503245  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  28.2 
 
 
410 aa  147  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  28.68 
 
 
404 aa  146  5e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  27.38 
 
 
406 aa  146  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  28.15 
 
 
397 aa  146  6e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3463  hypothetical protein  25.55 
 
 
402 aa  146  6e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  28.95 
 
 
391 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  25.18 
 
 
406 aa  145  1e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  28.32 
 
 
392 aa  145  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  28.33 
 
 
405 aa  145  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2149  hypothetical protein  29.3 
 
 
402 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0531927  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3335  ABC transporter, permease protein  35.09 
 
 
463 aa  144  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.887003  normal  0.0261397 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3478  protein of unknown function DUF214  27.8 
 
 
402 aa  145  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1082  hypothetical protein  25.06 
 
 
456 aa  144  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  28.43 
 
 
404 aa  145  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0636  macrolide-specific efflux protein macB  28.82 
 
 
641 aa  144  3e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00901082  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1063  macrolide-specific efflux protein macB  28.89 
 
 
641 aa  144  3e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00606621  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0710  macrolide-specific efflux protein macB  28.82 
 
 
641 aa  144  3e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  27.29 
 
 
404 aa  144  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  28.9 
 
 
696 aa  144  3e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  25.89 
 
 
647 aa  144  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  26.33 
 
 
405 aa  144  4e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1552  protein of unknown function DUF214  29.43 
 
 
397 aa  143  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00448084  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  26.02 
 
 
371 aa  143  5e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  26.93 
 
 
414 aa  143  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3757  hypothetical protein  27.4 
 
 
414 aa  143  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  27.42 
 
 
415 aa  142  7e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  26.45 
 
 
649 aa  142  8e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  27.85 
 
 
402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  25.55 
 
 
403 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  27.72 
 
 
663 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  28.43 
 
 
413 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  29.44 
 
 
642 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>