More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0112 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0112  signal transduction protein  100 
 
 
213 aa  430  1e-120  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0311515  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0711  signal transduction protein  97.18 
 
 
213 aa  418  1e-116  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.402319  normal  0.674474 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1207  signal transduction protein  97.18 
 
 
213 aa  418  1e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.230194  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0777  signal transduction protein  70.89 
 
 
213 aa  326  1.0000000000000001e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.413451  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0375  CBS domain-containing protein  61.65 
 
 
209 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0304  signal transduction protein  28.46 
 
 
128 aa  65.5  0.0000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0400  signal transduction protein  31.4 
 
 
120 aa  63.2  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.1218  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1519  CBS domain-containing protein  30.58 
 
 
120 aa  63.2  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.356805  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0435  signal transduction protein  31.4 
 
 
120 aa  62  0.000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.78008  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0170  CBS domain-containing protein  33.61 
 
 
343 aa  62  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.356486  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  36.89 
 
 
142 aa  60.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  35.65 
 
 
262 aa  60.1  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0098  CBS domain-containing protein  27.59 
 
 
150 aa  56.6  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  24.29 
 
 
229 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1085  putative signal transduction protein with CBS domains  30.65 
 
 
300 aa  56.6  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.971141  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0098  CBS domain-containing protein  26.9 
 
 
150 aa  56.2  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0472  signal transduction protein  29.17 
 
 
120 aa  56.2  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.269562  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  33.09 
 
 
215 aa  56.2  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2061  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.31 
 
 
489 aa  55.8  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144949 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2596  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  27.78 
 
 
500 aa  56.2  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6852  putative signal transduction protein with CBS domains  27.07 
 
 
141 aa  56.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  30.43 
 
 
688 aa  56.2  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  26.22 
 
 
313 aa  55.8  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1987  CBS domain-containing protein  27.48 
 
 
262 aa  55.8  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4227  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.43 
 
 
520 aa  55.8  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.147199 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  27.22 
 
 
309 aa  55.5  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3837  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.43 
 
 
520 aa  55.5  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  22.47 
 
 
230 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1578  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  26.92 
 
 
483 aa  55.1  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0722651  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0207  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.66 
 
 
507 aa  55.5  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.81 
 
 
482 aa  55.1  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.81 
 
 
482 aa  55.1  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.91 
 
 
486 aa  54.7  0.0000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.608786  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1203  signal transduction protein  31.03 
 
 
315 aa  54.7  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.803351  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1618  CBS domain-containing protein  25.6 
 
 
138 aa  54.3  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  32.37 
 
 
215 aa  54.3  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  27.61 
 
 
256 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3243  CBS domain containing protein  27.97 
 
 
268 aa  53.9  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100628  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3391  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  27.97 
 
 
493 aa  53.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207114  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1899  putative signal transduction protein with CBS domains  26.36 
 
 
149 aa  53.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1320  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.19 
 
 
504 aa  52.8  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0931634  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07600  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.28 
 
 
498 aa  53.5  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.194742 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0178  CBS domain-containing protein  26.81 
 
 
145 aa  53.1  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  24.29 
 
 
229 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1620  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.17 
 
 
489 aa  52.8  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.690045 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1517  hypothetical protein  27.73 
 
 
502 aa  52.8  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.743674  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0697  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.03 
 
 
490 aa  52.4  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0725248  normal  0.819187 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1056  magnesium transporter  27.13 
 
 
457 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0801577  hitchhiker  0.0000813528 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3521  magnesium transporter  27.13 
 
 
457 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3396  magnesium transporter  27.13 
 
 
457 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3300  magnesium transporter  27.13 
 
 
457 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0898  CBS domain-containing protein  29.66 
 
 
266 aa  52  0.000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  25 
 
 
217 aa  52  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  26.61 
 
 
300 aa  52  0.000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.548765 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  23.66 
 
 
214 aa  52  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  30.65 
 
 
269 aa  51.6  0.000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0749  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  27.59 
 
 
493 aa  51.6  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  20.75 
 
 
428 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0737  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  26.47 
 
 
483 aa  51.2  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  26.25 
 
 
161 aa  51.2  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  24.82 
 
 
232 aa  51.6  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  25.49 
 
 
508 aa  51.2  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0971  magnesium transporter  25.58 
 
 
457 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  28.68 
 
 
139 aa  50.8  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1728  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  27.35 
 
 
494 aa  50.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.716764  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  29.41 
 
 
338 aa  51.2  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0737a  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  28.18 
 
 
487 aa  50.4  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  23.88 
 
 
223 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  29.85 
 
 
219 aa  50.4  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1545  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  27.83 
 
 
496 aa  50.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.308364  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2338  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.18 
 
 
487 aa  50.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.879992  normal  0.100057 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2288  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.78 
 
 
489 aa  50.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.453935  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3370  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.71 
 
 
489 aa  50.8  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  26.09 
 
 
201 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1752  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.18 
 
 
486 aa  49.7  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.853386 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2169  putative signal transduction protein with CBS domains  24.28 
 
 
261 aa  50.1  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2164  CBS domain containing protein  26.06 
 
 
288 aa  50.1  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.866866 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  23.12 
 
 
231 aa  49.7  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4253  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  26.35 
 
 
500 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  27.94 
 
 
216 aa  50.1  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1014  putative signal transduction protein with CBS domains  40.58 
 
 
162 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.673137  normal  0.137576 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  22.3 
 
 
230 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  25.52 
 
 
223 aa  49.7  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2085  hypothetical protein  27.64 
 
 
500 aa  49.3  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41176  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  29.91 
 
 
873 aa  49.3  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  27.27 
 
 
216 aa  49.3  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  24.05 
 
 
196 aa  49.3  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1688  hypothetical protein  24.59 
 
 
490 aa  48.9  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004341  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  25.83 
 
 
488 aa  49.3  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  25 
 
 
339 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2355  peptidase M50  26.43 
 
 
396 aa  48.9  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0704943  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0829  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  24.53 
 
 
504 aa  49.3  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.363415  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3596  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  29.36 
 
 
487 aa  49.3  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000202307  normal  0.660698 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1687  hypothetical protein  24.59 
 
 
490 aa  48.9  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2935  magnesium transporter  27.84 
 
 
457 aa  48.9  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1132  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  26.96 
 
 
500 aa  48.9  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.41509  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  27.97 
 
 
488 aa  48.9  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1105  putative signal transduction protein with CBS domains  27.35 
 
 
268 aa  48.5  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0172  homoserine O-acetyltransferase  26.83 
 
 
492 aa  48.9  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  26.03 
 
 
152 aa  48.9  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>