More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0971 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1145  magnesium transporter  91.87 
 
 
457 aa  828    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1056  magnesium transporter  84.27 
 
 
457 aa  736    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0801577  hitchhiker  0.0000813528 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3300  magnesium transporter  83.82 
 
 
457 aa  750    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3521  magnesium transporter  84.27 
 
 
457 aa  736    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0971  magnesium transporter  100 
 
 
457 aa  914    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3396  magnesium transporter  84.27 
 
 
457 aa  736    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2935  magnesium transporter  82.86 
 
 
457 aa  739    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1785  divalent cation transporter  55.5 
 
 
447 aa  421  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1703  magnesium transporter  50 
 
 
445 aa  392  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0337  MgtE integral membrane region  56.29 
 
 
351 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0714  magnesium transporter  40.95 
 
 
449 aa  339  7e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0824  magnesium transporter  40.62 
 
 
454 aa  338  9.999999999999999e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1342  divalent cation transporter  42.53 
 
 
447 aa  325  1e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.09733  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0891  magnesium transporter  43.67 
 
 
449 aa  315  9.999999999999999e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182098 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2000  magnesium transporter  39.6 
 
 
454 aa  305  8.000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2001  magnesium transporter  40.14 
 
 
447 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1690  magnesium transporter  40.8 
 
 
452 aa  301  1e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0394876 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1691  magnesium transporter  36.73 
 
 
452 aa  300  5e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0276763 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0419  magnesium transporter  36.78 
 
 
455 aa  291  2e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2363  magnesium transporter  38.9 
 
 
454 aa  290  4e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1082  divalent cation transporter  38.01 
 
 
447 aa  280  3e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2187  magnesium transporter  35.92 
 
 
461 aa  276  5e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.183067  normal  0.0149882 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2786  magnesium transporter  35.33 
 
 
463 aa  271  1e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1461  magnesium transporter  37.53 
 
 
463 aa  271  2e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00122115  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2089  magnesium transporter  33.63 
 
 
460 aa  268  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  36.13 
 
 
442 aa  266  5e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2058  magnesium transporter  32.67 
 
 
460 aa  259  8e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1890  magnesium transporter  34.31 
 
 
460 aa  256  7e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0412  magnesium transporter  36.92 
 
 
461 aa  255  9e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2879  magnesium transporter  33.94 
 
 
451 aa  254  3e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1801  divalent cation transporter  33.41 
 
 
460 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0320  divalent cation transporter  31.84 
 
 
460 aa  253  5.000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0139413 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2099  magnesium transporter  32.28 
 
 
460 aa  251  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.168721  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  31.32 
 
 
450 aa  250  3e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2441  magnesium transporter  33.56 
 
 
460 aa  242  1e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2282  magnesium transporter  31.67 
 
 
453 aa  241  2e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0198685  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0914  magnesium transporter  32.81 
 
 
460 aa  240  2.9999999999999997e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2718  magnesium transporter  32.7 
 
 
452 aa  239  1e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1939  magnesium transporter  31.32 
 
 
444 aa  237  3e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0382273  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1269  magnesium transporter  33.18 
 
 
465 aa  235  1.0000000000000001e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0779643  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3944  magnesium transporter  36.21 
 
 
441 aa  232  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2430  divalent cation transporter  31.59 
 
 
466 aa  230  4e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2496  magnesium transporter  31.35 
 
 
442 aa  229  6e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0471  magnesium transporter  32.61 
 
 
482 aa  229  1e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.963916 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2352  magnesium transporter  30.16 
 
 
468 aa  228  3e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.814401  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4087  magnesium transporter  35.51 
 
 
441 aa  226  7e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4054  magnesium transporter  35.51 
 
 
441 aa  226  7e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02891  magnesium transporter  32.09 
 
 
455 aa  226  8e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6729  magnesium transporter  32.32 
 
 
463 aa  225  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143213  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  30.71 
 
 
451 aa  224  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0876  magnesium transporter  32.82 
 
 
465 aa  223  6e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0822  magnesium transporter  32.82 
 
 
465 aa  223  6e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2291  magnesium transporter  31.94 
 
 
449 aa  222  8e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18221  Mg2+ transporter  32 
 
 
468 aa  222  9e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2600  magnesium transporter  32.37 
 
 
463 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1723  Mg2+ transporter  31.92 
 
 
468 aa  220  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20289  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18401  Mg2+ transporter  31.6 
 
 
468 aa  219  6e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.297681  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18191  Mg2+ transporter  31.76 
 
 
469 aa  219  7e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0267  magnesium transporter  29.04 
 
 
456 aa  219  7.999999999999999e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000106938  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0507  hypothetical protein  31.97 
 
 
463 aa  218  1e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.593937 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6844  magnesium transporter  34.71 
 
 
454 aa  218  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.724655 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1669  magnesium transporter  32.24 
 
 
462 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0331  magnesium transporter  30.16 
 
 
458 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1208  Mg2+ transporter  31.34 
 
 
469 aa  216  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1642  magnesium transporter  32.24 
 
 
462 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1588  response regulator receiver protein  27.23 
 
 
446 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3016  magnesium transporter  30.98 
 
 
443 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000242012  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3303  magnesium transporter  33.42 
 
 
461 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3903  magnesium transporter  32.52 
 
 
456 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508399  normal  0.721995 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20831  Mg2+ transporter  31.34 
 
 
469 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3524  magnesium transporter  31.38 
 
 
454 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1318  magnesium transporter  29.05 
 
 
458 aa  212  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2728  divalent cation transporter  31.4 
 
 
456 aa  212  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  28.79 
 
 
445 aa  212  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2002  magnesium transporter  31.28 
 
 
458 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.493999  normal  0.0929187 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10367  Mg2+ transport transmembrane protein mgtE  31.82 
 
 
460 aa  211  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.54721 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1654  response regulator receiver protein  28.15 
 
 
446 aa  211  2e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.399924  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2269  magnesium transporter  33.18 
 
 
454 aa  211  3e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0532952  hitchhiker  0.0000374811 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1689  magnesium transporter  29.19 
 
 
449 aa  211  3e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1095  magnesium transporter  33 
 
 
457 aa  210  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.20606  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0946  magnesium transporter  33.25 
 
 
457 aa  210  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2831  magnesium transporter  27.77 
 
 
458 aa  209  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1007  magnesium transporter  29.12 
 
 
461 aa  209  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00155557  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1026  magnesium transporter  29.12 
 
 
461 aa  209  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000394015  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4217  magnesium transporter  33.41 
 
 
452 aa  207  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1722  magnesium transporter  33.41 
 
 
462 aa  204  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1172  divalent cation transporter  30.26 
 
 
450 aa  204  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000987618  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1255  magnesium transporter  28.12 
 
 
445 aa  203  5e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.029906  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0809  magnesium transporter  30.48 
 
 
542 aa  203  6e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5457  magnesium transporter  30.48 
 
 
456 aa  202  9e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.169675 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0138  divalent cation transporter  30.21 
 
 
486 aa  202  9.999999999999999e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0092  magnesium transporter  31.28 
 
 
486 aa  201  1.9999999999999998e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4800  magnesium transporter  29.32 
 
 
456 aa  200  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.832783  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4147  magnesium transporter  28.41 
 
 
454 aa  200  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.235845 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2520  magnesium transporter  31.32 
 
 
454 aa  200  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.624288 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01631  Mg2+ transporter  31.25 
 
 
473 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0051  magnesium transporter  31.67 
 
 
458 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.242688 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4616  magnesium transporter  30.34 
 
 
456 aa  195  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  decreased coverage  0.00267397 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0080  magnesium transporter  33.24 
 
 
438 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.136894 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0589  magnesium transporter  28.5 
 
 
461 aa  195  2e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.124828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>