More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1056 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1145  magnesium transporter  82.68 
 
 
457 aa  753    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3521  magnesium transporter  99.78 
 
 
457 aa  920    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3396  magnesium transporter  99.56 
 
 
457 aa  921    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3300  magnesium transporter  99.34 
 
 
457 aa  918    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2935  magnesium transporter  95.4 
 
 
457 aa  845    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1056  magnesium transporter  100 
 
 
457 aa  922    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0801577  hitchhiker  0.0000813528 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0971  magnesium transporter  83.96 
 
 
457 aa  780    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1785  divalent cation transporter  52.62 
 
 
447 aa  419  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1703  magnesium transporter  50.79 
 
 
445 aa  394  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0337  MgtE integral membrane region  55.69 
 
 
351 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0824  magnesium transporter  41.4 
 
 
454 aa  335  1e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1342  divalent cation transporter  42.2 
 
 
447 aa  325  1e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.09733  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0714  magnesium transporter  39.59 
 
 
449 aa  322  9.999999999999999e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2001  magnesium transporter  40 
 
 
447 aa  311  2e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0891  magnesium transporter  43.53 
 
 
449 aa  310  4e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182098 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1691  magnesium transporter  36.73 
 
 
452 aa  301  2e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0276763 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2363  magnesium transporter  40.05 
 
 
454 aa  301  2e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2000  magnesium transporter  39.5 
 
 
454 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0419  magnesium transporter  37.44 
 
 
455 aa  296  4e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2187  magnesium transporter  39.02 
 
 
461 aa  295  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.183067  normal  0.0149882 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1690  magnesium transporter  40.04 
 
 
452 aa  290  4e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0394876 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1082  divalent cation transporter  38.15 
 
 
447 aa  283  4.0000000000000003e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1461  magnesium transporter  39.91 
 
 
463 aa  278  1e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00122115  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2786  magnesium transporter  34.07 
 
 
463 aa  264  3e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2089  magnesium transporter  32.38 
 
 
460 aa  263  4e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  34.27 
 
 
442 aa  259  9e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2879  magnesium transporter  36.34 
 
 
451 aa  257  3e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1801  divalent cation transporter  33.7 
 
 
460 aa  256  8e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2058  magnesium transporter  32.44 
 
 
460 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0412  magnesium transporter  35.96 
 
 
461 aa  252  8.000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1890  magnesium transporter  32.67 
 
 
460 aa  252  1e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0914  magnesium transporter  35.53 
 
 
460 aa  250  4e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2099  magnesium transporter  31.5 
 
 
460 aa  248  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.168721  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0320  divalent cation transporter  31.49 
 
 
460 aa  248  2e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0139413 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  31.71 
 
 
450 aa  246  4.9999999999999997e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2282  magnesium transporter  33.97 
 
 
453 aa  241  2e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0198685  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2441  magnesium transporter  33.26 
 
 
460 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2430  divalent cation transporter  32.38 
 
 
466 aa  239  8e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2352  magnesium transporter  31.98 
 
 
468 aa  236  8e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.814401  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1939  magnesium transporter  30.7 
 
 
444 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0382273  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1269  magnesium transporter  31.69 
 
 
465 aa  232  1e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0779643  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0471  magnesium transporter  32.97 
 
 
482 aa  232  1e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.963916 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6729  magnesium transporter  33.11 
 
 
463 aa  231  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143213  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18221  Mg2+ transporter  33.65 
 
 
468 aa  229  6e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2600  magnesium transporter  32.81 
 
 
463 aa  229  7e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3016  magnesium transporter  31.88 
 
 
443 aa  229  7e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000242012  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2718  magnesium transporter  31.33 
 
 
452 aa  229  1e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  30.18 
 
 
451 aa  228  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1723  Mg2+ transporter  33.41 
 
 
468 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20289  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0876  magnesium transporter  33.33 
 
 
465 aa  226  9e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0822  magnesium transporter  33.33 
 
 
465 aa  226  9e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3944  magnesium transporter  35.06 
 
 
441 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18401  Mg2+ transporter  33.02 
 
 
468 aa  226  1e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.297681  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18191  Mg2+ transporter  33.18 
 
 
469 aa  225  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2291  magnesium transporter  31.87 
 
 
449 aa  224  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1669  magnesium transporter  31.81 
 
 
462 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1642  magnesium transporter  31.81 
 
 
462 aa  223  7e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1588  response regulator receiver protein  28.83 
 
 
446 aa  222  8e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0267  magnesium transporter  28.38 
 
 
456 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000106938  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10367  Mg2+ transport transmembrane protein mgtE  34.27 
 
 
460 aa  221  3e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.54721 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2831  magnesium transporter  28.6 
 
 
458 aa  220  3e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6844  magnesium transporter  35.81 
 
 
454 aa  220  5e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.724655 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4054  magnesium transporter  34.61 
 
 
441 aa  219  6e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4087  magnesium transporter  34.61 
 
 
441 aa  219  6e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1208  Mg2+ transporter  31.74 
 
 
469 aa  219  1e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3303  magnesium transporter  33.33 
 
 
461 aa  219  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1654  response regulator receiver protein  29.75 
 
 
446 aa  218  2e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.399924  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20831  Mg2+ transporter  31.74 
 
 
469 aa  217  4e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3903  magnesium transporter  33.33 
 
 
456 aa  216  5e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508399  normal  0.721995 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2496  magnesium transporter  31.22 
 
 
442 aa  216  8e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0507  hypothetical protein  34 
 
 
463 aa  216  8e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.593937 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3524  magnesium transporter  30.5 
 
 
454 aa  215  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2728  divalent cation transporter  30.96 
 
 
456 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1026  magnesium transporter  30.64 
 
 
461 aa  214  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000394015  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1007  magnesium transporter  30.64 
 
 
461 aa  214  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00155557  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2002  magnesium transporter  32.7 
 
 
458 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.493999  normal  0.0929187 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02891  magnesium transporter  32.04 
 
 
455 aa  214  2.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0092  magnesium transporter  31.59 
 
 
486 aa  213  3.9999999999999995e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0331  magnesium transporter  29.25 
 
 
458 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1689  magnesium transporter  29 
 
 
449 aa  213  7e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1318  magnesium transporter  28.7 
 
 
458 aa  212  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1172  divalent cation transporter  31.21 
 
 
450 aa  211  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000987618  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2269  magnesium transporter  33.88 
 
 
454 aa  211  3e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0532952  hitchhiker  0.0000374811 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1722  magnesium transporter  32.29 
 
 
462 aa  210  4e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0134  magnesium transporter  30.2 
 
 
450 aa  207  2e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.149732 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2520  magnesium transporter  31.35 
 
 
454 aa  206  7e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.624288 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01631  Mg2+ transporter  31.73 
 
 
473 aa  206  7e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1095  magnesium transporter  32.19 
 
 
457 aa  206  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.20606  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0946  magnesium transporter  32.43 
 
 
457 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  27.99 
 
 
445 aa  205  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0138  divalent cation transporter  31.28 
 
 
486 aa  204  2e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0589  magnesium transporter  28.79 
 
 
461 aa  204  3e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.124828  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5457  magnesium transporter  30.28 
 
 
456 aa  204  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.169675 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1159  magnesium transporter  28.44 
 
 
450 aa  202  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4800  magnesium transporter  31.52 
 
 
456 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.832783  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1832  magnesium transporter  33.33 
 
 
460 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0187947  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0809  magnesium transporter  30.73 
 
 
542 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4217  magnesium transporter  31.41 
 
 
452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0080  magnesium transporter  35.15 
 
 
438 aa  201  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.136894 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0051  magnesium transporter  32.24 
 
 
458 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.242688 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>