More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2187 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2187  magnesium transporter  100 
 
 		 461 aa  918    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.183067  normal  0.0149882 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1461  magnesium transporter  40.44 
 
 		 463 aa  318  1e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00122115  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3300  magnesium transporter  39.78 
 
 		 457 aa  297  3e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0971  magnesium transporter  36.59 
 
 		 457 aa  294  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2935  magnesium transporter  38.36 
 
 		 457 aa  292  8e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1703  magnesium transporter  40.63 
 
 		 445 aa  290  3e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3521  magnesium transporter  39.2 
 
 		 457 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1056  magnesium transporter  39.42 
 
 		 457 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0801577  hitchhiker  0.0000813528 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3396  magnesium transporter  38.98 
 
 		 457 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1145  magnesium transporter  36.81 
 
 		 457 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0412  magnesium transporter  37.06 
 
 		 461 aa  283  7.000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1785  divalent cation transporter  39.07 
 
 		 447 aa  278  1e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1269  magnesium transporter  38.86 
 
 		 465 aa  271  2e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0779643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2430  divalent cation transporter  34.92 
 
 		 466 aa  262  8.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2352  magnesium transporter  35.66 
 
 		 468 aa  262  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.814401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2600  magnesium transporter  35.68 
 
 		 463 aa  259  6e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1689  magnesium transporter  30.65 
 
 		 449 aa  256  5e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2291  magnesium transporter  34.53 
 
 		 449 aa  256  6e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1588  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 446 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18221  Mg2+ transporter  37.73 
 
 		 468 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1669  magnesium transporter  35.92 
 
 		 462 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1642  magnesium transporter  36.15 
 
 		 462 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1723  Mg2+ transporter  37.27 
 
 		 468 aa  253  6e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20289  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18401  Mg2+ transporter  36.32 
 
 		 468 aa  253  7e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.297681  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1208  Mg2+ transporter  38.41 
 
 		 469 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18191  Mg2+ transporter  37.32 
 
 		 469 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20831  Mg2+ transporter  38.41 
 
 		 469 aa  250  4e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0824  magnesium transporter  37.66 
 
 		 454 aa  249  7e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1654  response regulator receiver protein  32.35 
 
 		 446 aa  248  2e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.399924  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1939  magnesium transporter  31.15 
 
 		 444 aa  247  4e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0382273  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2786  magnesium transporter  32.89 
 
 		 463 aa  242  9e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0714  magnesium transporter  33.55 
 
 		 449 aa  241  1e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0891  magnesium transporter  35.86 
 
 		 449 aa  240  4e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182098 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0507  hypothetical protein  33.02 
 
 		 463 aa  238  2e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.593937 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2879  magnesium transporter  34.4 
 
 		 451 aa  237  4e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2089  magnesium transporter  32.54 
 
 		 460 aa  236  9e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0419  magnesium transporter  31.36 
 
 		 455 aa  234  3e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2718  magnesium transporter  31.53 
 
 		 452 aa  233  6e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2831  magnesium transporter  31.83 
 
 		 458 aa  231  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0267  magnesium transporter  30.52 
 
 		 456 aa  231  2e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000106938  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0914  magnesium transporter  35.78 
 
 		 460 aa  228  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3016  magnesium transporter  30.68 
 
 		 443 aa  228  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000242012  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1342  divalent cation transporter  31.54 
 
 		 447 aa  228  2e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.09733  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0320  divalent cation transporter  31.52 
 
 		 460 aa  225  1e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0139413 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0138  divalent cation transporter  37.05 
 
 		 486 aa  225  1e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4147  magnesium transporter  32.07 
 
 		 454 aa  225  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.235845 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01460  Mg2+ transporter MgtE  33.5 
 
 		 452 aa  225  2e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1890  magnesium transporter  31.61 
 
 		 460 aa  225  2e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4800  magnesium transporter  34.34 
 
 		 456 aa  224  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.832783  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17571  Mg2+ transporter  38.89 
 
 		 471 aa  223  6e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.161452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6729  magnesium transporter  32.33 
 
 		 463 aa  223  6e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1801  divalent cation transporter  31.32 
 
 		 460 aa  222  9e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1159  magnesium transporter  33.79 
 
 		 450 aa  221  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2282  magnesium transporter  33.79 
 
 		 453 aa  219  6e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0198685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0092  magnesium transporter  38.32 
 
 		 486 aa  219  7e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1082  divalent cation transporter  33.42 
 
 		 447 aa  219  8.999999999999998e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1454  magnesium transporter  28.82 
 
 		 447 aa  219  1e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192338  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2058  magnesium transporter  31.15 
 
 		 460 aa  218  2e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01631  Mg2+ transporter  38.5 
 
 		 473 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2363  magnesium transporter  29.6 
 
 		 454 aa  217  2.9999999999999998e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2728  divalent cation transporter  34.21 
 
 		 456 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1318  magnesium transporter  31.02 
 
 		 458 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4616  magnesium transporter  32.84 
 
 		 456 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  decreased coverage  0.00267397 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2099  magnesium transporter  31.37 
 
 		 460 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.168721  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0471  magnesium transporter  33.56 
 
 		 482 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.963916 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2441  magnesium transporter  31.75 
 
 		 460 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  32.65 
 
 		 450 aa  213  4.9999999999999996e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0337  MgtE integral membrane region  39.65 
 
 		 351 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5457  magnesium transporter  33.85 
 
 		 456 aa  213  7.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.169675 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3903  magnesium transporter  32.2 
 
 		 456 aa  211  3e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508399  normal  0.721995 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3524  magnesium transporter  32.96 
 
 		 454 aa  210  3e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1523  magnesium transporter  32.81 
 
 		 447 aa  209  7e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0876  magnesium transporter  31.71 
 
 		 465 aa  208  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2002  magnesium transporter  30.45 
 
 		 458 aa  208  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.493999  normal  0.0929187 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0822  magnesium transporter  31.71 
 
 		 465 aa  208  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1691  magnesium transporter  32.94 
 
 		 452 aa  207  3e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0276763 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0589  magnesium transporter  28.98 
 
 		 461 aa  207  4e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.124828  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1007  magnesium transporter  28.54 
 
 		 461 aa  206  8e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00155557  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1026  magnesium transporter  28.54 
 
 		 461 aa  206  8e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000394015  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2269  magnesium transporter  34.07 
 
 		 454 aa  205  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0532952  hitchhiker  0.0000374811 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4176  magnesium transporter  34.91 
 
 		 452 aa  205  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.987951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3944  magnesium transporter  35.48 
 
 		 441 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3303  magnesium transporter  30.82 
 
 		 461 aa  204  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2199  divalent cation transporter  33.18 
 
 		 465 aa  202  8e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  30.07 
 
 		 442 aa  202  9e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4054  magnesium transporter  35.48 
 
 		 441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4087  magnesium transporter  35.48 
 
 		 441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1172  divalent cation transporter  30.64 
 
 		 450 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000987618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2168  magnesium transporter  32.4 
 
 		 453 aa  200  5e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.571792  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0946  magnesium transporter  34.24 
 
 		 457 aa  200  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1690  magnesium transporter  30.92 
 
 		 452 aa  199  7e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0394876 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25770  Mg2+ transporter MgtE  31.79 
 
 		 462 aa  199  9e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0080  magnesium transporter  36.12 
 
 		 438 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.136894 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  28.41 
 
 		 451 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2001  magnesium transporter  32.17 
 
 		 447 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0382  magnesium transporter  26.98 
 
 		 454 aa  197  4.0000000000000005e-49  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2520  magnesium transporter  32.96 
 
 		 454 aa  197  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624288 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2496  magnesium transporter  28.18 
 
 		 442 aa  194  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3316  magnesium transporter  32.29 
 
 		 473 aa  194  4e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.685446  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6844  magnesium transporter  35.33 
 
 		 454 aa  193  6e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.724655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>