More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1342 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1342  divalent cation transporter  100 
 
 
447 aa  898    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.09733  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0891  magnesium transporter  49.89 
 
 
449 aa  423  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182098 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2786  magnesium transporter  47.54 
 
 
463 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0824  magnesium transporter  47.14 
 
 
454 aa  415  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0714  magnesium transporter  46.71 
 
 
449 aa  410  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2363  magnesium transporter  49.66 
 
 
454 aa  393  1e-108  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1082  divalent cation transporter  42.41 
 
 
447 aa  360  4e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2000  magnesium transporter  43.79 
 
 
454 aa  356  5.999999999999999e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6729  magnesium transporter  40.67 
 
 
463 aa  354  1e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143213  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2089  magnesium transporter  40.8 
 
 
460 aa  350  4e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1318  magnesium transporter  43.5 
 
 
458 aa  344  2e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0419  magnesium transporter  42.6 
 
 
455 aa  343  2.9999999999999997e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1801  divalent cation transporter  39.02 
 
 
460 aa  332  9e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2001  magnesium transporter  41.78 
 
 
447 aa  332  1e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2002  magnesium transporter  42.28 
 
 
458 aa  330  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.493999  normal  0.0929187 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0320  divalent cation transporter  39.6 
 
 
460 aa  329  7e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0139413 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1890  magnesium transporter  39.82 
 
 
460 aa  328  8e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1785  divalent cation transporter  43.46 
 
 
447 aa  325  1e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0971  magnesium transporter  42.53 
 
 
457 aa  325  1e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2718  magnesium transporter  39.27 
 
 
452 aa  322  9.999999999999999e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2099  magnesium transporter  39.47 
 
 
460 aa  322  9.999999999999999e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.168721  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1145  magnesium transporter  46.75 
 
 
457 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0337  MgtE integral membrane region  49.22 
 
 
351 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1690  magnesium transporter  39.82 
 
 
452 aa  320  3e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0394876 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3300  magnesium transporter  41.97 
 
 
457 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2058  magnesium transporter  39.2 
 
 
460 aa  318  1e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0914  magnesium transporter  39.37 
 
 
460 aa  316  6e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1056  magnesium transporter  45.74 
 
 
457 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0801577  hitchhiker  0.0000813528 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2441  magnesium transporter  38.24 
 
 
460 aa  311  2e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3521  magnesium transporter  45.74 
 
 
457 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2935  magnesium transporter  45.97 
 
 
457 aa  311  2e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3396  magnesium transporter  45.22 
 
 
457 aa  309  8e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1691  magnesium transporter  38.14 
 
 
452 aa  307  3e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0276763 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1939  magnesium transporter  35.87 
 
 
444 aa  301  2e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0382273  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1703  magnesium transporter  43.32 
 
 
445 aa  298  1e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2291  magnesium transporter  36.06 
 
 
449 aa  291  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3016  magnesium transporter  34.4 
 
 
443 aa  289  7e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000242012  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1588  response regulator receiver protein  32.95 
 
 
446 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1454  magnesium transporter  33.1 
 
 
447 aa  282  8.000000000000001e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192338  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0267  magnesium transporter  35.25 
 
 
456 aa  281  2e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000106938  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1654  response regulator receiver protein  33.64 
 
 
446 aa  279  9e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.399924  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2831  magnesium transporter  33.84 
 
 
458 aa  276  7e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1689  magnesium transporter  33.94 
 
 
449 aa  273  3e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2352  magnesium transporter  31.98 
 
 
468 aa  262  8e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.814401  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1269  magnesium transporter  32.59 
 
 
465 aa  261  2e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0779643  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2282  magnesium transporter  33.26 
 
 
453 aa  258  1e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0198685  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18401  Mg2+ transporter  33.03 
 
 
468 aa  256  5e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.297681  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18191  Mg2+ transporter  33.26 
 
 
469 aa  256  5e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2600  magnesium transporter  32.29 
 
 
463 aa  256  6e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1723  Mg2+ transporter  32.96 
 
 
468 aa  256  8e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20289  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18221  Mg2+ transporter  33.03 
 
 
468 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1669  magnesium transporter  32.66 
 
 
462 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1642  magnesium transporter  32.66 
 
 
462 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1208  Mg2+ transporter  32.13 
 
 
469 aa  253  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2430  divalent cation transporter  31.67 
 
 
466 aa  251  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20831  Mg2+ transporter  32.13 
 
 
469 aa  250  3e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1461  magnesium transporter  32.71 
 
 
463 aa  249  7e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00122115  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  30.54 
 
 
450 aa  246  4e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1523  magnesium transporter  34.02 
 
 
447 aa  247  4e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0382  magnesium transporter  31.61 
 
 
454 aa  245  9.999999999999999e-64  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01460  Mg2+ transporter MgtE  30.73 
 
 
452 aa  245  9.999999999999999e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2199  divalent cation transporter  31.97 
 
 
465 aa  243  5e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5582  magnesium transporter  31.82 
 
 
444 aa  242  7.999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1172  divalent cation transporter  32.41 
 
 
450 aa  241  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000987618  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0092  magnesium transporter  32.5 
 
 
486 aa  239  5.999999999999999e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  31.4 
 
 
442 aa  239  6.999999999999999e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0138  divalent cation transporter  30.52 
 
 
486 aa  238  1e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3944  magnesium transporter  35.22 
 
 
441 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4054  magnesium transporter  34.99 
 
 
441 aa  236  6e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4087  magnesium transporter  34.99 
 
 
441 aa  236  6e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3903  magnesium transporter  35.62 
 
 
456 aa  232  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508399  normal  0.721995 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2728  divalent cation transporter  31.42 
 
 
456 aa  230  3e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  29 
 
 
451 aa  230  3e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0822  magnesium transporter  32.4 
 
 
465 aa  230  4e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0876  magnesium transporter  32.4 
 
 
465 aa  230  4e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2269  magnesium transporter  34.08 
 
 
454 aa  230  4e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0532952  hitchhiker  0.0000374811 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1159  magnesium transporter  30.99 
 
 
450 aa  230  5e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0589  magnesium transporter  33.52 
 
 
461 aa  229  1e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.124828  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3303  magnesium transporter  32.17 
 
 
461 aa  228  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30070  Mg2+ transporter MgtE  31.8 
 
 
461 aa  228  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0080  magnesium transporter  35.57 
 
 
438 aa  226  7e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.136894 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02891  magnesium transporter  35.37 
 
 
455 aa  226  7e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3524  magnesium transporter  30.28 
 
 
454 aa  225  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1471  magnesium transporter  32.79 
 
 
449 aa  224  2e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1026  magnesium transporter  29.53 
 
 
461 aa  224  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000394015  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1007  magnesium transporter  29.53 
 
 
461 aa  224  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00155557  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01631  Mg2+ transporter  30.79 
 
 
473 aa  223  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2879  magnesium transporter  33 
 
 
451 aa  222  9.999999999999999e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0412  magnesium transporter  32.75 
 
 
461 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3240  magnesium transporter  32.51 
 
 
451 aa  220  3e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0666949 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3406  magnesium transporter  32.81 
 
 
447 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.200177  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4147  magnesium transporter  32.84 
 
 
454 aa  220  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.235845 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5457  magnesium transporter  31.21 
 
 
456 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.169675 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25770  Mg2+ transporter MgtE  32.41 
 
 
462 aa  219  1e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2520  magnesium transporter  30.23 
 
 
454 aa  217  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.624288 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4800  magnesium transporter  31.65 
 
 
456 aa  216  8e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.832783  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1907  magnesium transporter  30.7 
 
 
445 aa  215  9.999999999999999e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0051  magnesium transporter  33.87 
 
 
458 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.242688 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4176  magnesium transporter  31.55 
 
 
452 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.987951  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2187  magnesium transporter  32.5 
 
 
461 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.183067  normal  0.0149882 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>