More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3903 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02891  magnesium transporter  77.43 
 
 
455 aa  685    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3903  magnesium transporter  100 
 
 
456 aa  910    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508399  normal  0.721995 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3303  magnesium transporter  65.26 
 
 
461 aa  607  9.999999999999999e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0876  magnesium transporter  64.81 
 
 
465 aa  603  1.0000000000000001e-171  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0822  magnesium transporter  64.81 
 
 
465 aa  603  1.0000000000000001e-171  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1095  magnesium transporter  65.2 
 
 
457 aa  564  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.20606  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4147  magnesium transporter  62.02 
 
 
454 aa  562  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.235845 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0946  magnesium transporter  65.43 
 
 
457 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3524  magnesium transporter  62.47 
 
 
454 aa  555  1e-157  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2728  divalent cation transporter  61.57 
 
 
456 aa  547  1e-154  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4800  magnesium transporter  61.11 
 
 
456 aa  547  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.832783  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5457  magnesium transporter  59.43 
 
 
456 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.169675 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4616  magnesium transporter  59.33 
 
 
456 aa  535  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  decreased coverage  0.00267397 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0331  magnesium transporter  56.92 
 
 
458 aa  526  1e-148  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1398  magnesium transport protein  60.93 
 
 
458 aa  504  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1318  magnesium transporter  45.39 
 
 
458 aa  382  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3944  magnesium transporter  51.81 
 
 
441 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4087  magnesium transporter  51.57 
 
 
441 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4054  magnesium transporter  51.57 
 
 
441 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2786  magnesium transporter  48.43 
 
 
463 aa  366  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2089  magnesium transporter  43.9 
 
 
460 aa  358  9.999999999999999e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1801  divalent cation transporter  43.02 
 
 
460 aa  354  2e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0080  magnesium transporter  50.94 
 
 
438 aa  354  2e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.136894 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2099  magnesium transporter  44.88 
 
 
460 aa  352  8.999999999999999e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.168721  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2002  magnesium transporter  46.47 
 
 
458 aa  348  1e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.493999  normal  0.0929187 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0914  magnesium transporter  46.79 
 
 
460 aa  346  5e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0320  divalent cation transporter  44.55 
 
 
460 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0139413 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2441  magnesium transporter  45.63 
 
 
460 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1890  magnesium transporter  42.93 
 
 
460 aa  338  9.999999999999999e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2058  magnesium transporter  42.43 
 
 
460 aa  325  1e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6729  magnesium transporter  40.47 
 
 
463 aa  323  5e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143213  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2718  magnesium transporter  32.95 
 
 
452 aa  268  1e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2352  magnesium transporter  39.46 
 
 
468 aa  263  3e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.814401  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2600  magnesium transporter  38.94 
 
 
463 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2430  divalent cation transporter  36.06 
 
 
466 aa  258  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2496  magnesium transporter  32.89 
 
 
442 aa  247  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  34.92 
 
 
450 aa  247  4e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2000  magnesium transporter  37.79 
 
 
454 aa  246  6e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1642  magnesium transporter  37.05 
 
 
462 aa  246  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0714  magnesium transporter  36.14 
 
 
449 aa  245  9.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1669  magnesium transporter  37.05 
 
 
462 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1939  magnesium transporter  33.58 
 
 
444 aa  243  6e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0382273  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2879  magnesium transporter  35.17 
 
 
451 aa  242  1e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30070  Mg2+ transporter MgtE  34.29 
 
 
461 aa  242  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0824  magnesium transporter  33.79 
 
 
454 aa  241  2.9999999999999997e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2282  magnesium transporter  34.04 
 
 
453 aa  240  2.9999999999999997e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0198685  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1269  magnesium transporter  35.59 
 
 
465 aa  239  9e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0779643  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1703  magnesium transporter  35.48 
 
 
445 aa  238  1e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3016  magnesium transporter  31.18 
 
 
443 aa  238  1e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000242012  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2520  magnesium transporter  34.85 
 
 
454 aa  238  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.624288 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2001  magnesium transporter  36.3 
 
 
447 aa  237  3e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0891  magnesium transporter  36.17 
 
 
449 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182098 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0589  magnesium transporter  33.85 
 
 
461 aa  235  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.124828  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1454  magnesium transporter  33 
 
 
447 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192338  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0267  magnesium transporter  29.48 
 
 
456 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000106938  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1588  response regulator receiver protein  30.16 
 
 
446 aa  234  3e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1342  divalent cation transporter  34.93 
 
 
447 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.09733  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  32.38 
 
 
445 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1159  magnesium transporter  35.89 
 
 
450 aa  233  5e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1785  divalent cation transporter  34.27 
 
 
447 aa  231  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6844  magnesium transporter  38.8 
 
 
454 aa  231  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.724655 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1654  response regulator receiver protein  31.42 
 
 
446 aa  228  1e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.399924  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2291  magnesium transporter  32.53 
 
 
449 aa  228  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1461  magnesium transporter  32.24 
 
 
463 aa  228  2e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00122115  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1082  divalent cation transporter  33.71 
 
 
447 aa  227  3e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1255  magnesium transporter  32.44 
 
 
445 aa  225  1e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.029906  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01460  Mg2+ transporter MgtE  35.28 
 
 
452 aa  225  1e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  32.63 
 
 
442 aa  224  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20831  Mg2+ transporter  34.34 
 
 
469 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1145  magnesium transporter  33.77 
 
 
457 aa  224  3e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1208  Mg2+ transporter  34.34 
 
 
469 aa  224  3e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0337  MgtE integral membrane region  36.96 
 
 
351 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1691  magnesium transporter  32.63 
 
 
452 aa  223  4e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0276763 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1125  magnesium transporter  32.31 
 
 
444 aa  223  6e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1007  magnesium transporter  33.77 
 
 
461 aa  223  7e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00155557  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1026  magnesium transporter  33.77 
 
 
461 aa  223  7e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000394015  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18191  Mg2+ transporter  34.4 
 
 
469 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0382  magnesium transporter  29.17 
 
 
454 aa  221  1.9999999999999999e-56  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0971  magnesium transporter  31.28 
 
 
457 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2831  magnesium transporter  30.8 
 
 
458 aa  218  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1723  Mg2+ transporter  34.13 
 
 
468 aa  216  5e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20289  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0507  hypothetical protein  32.63 
 
 
463 aa  216  5.9999999999999996e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.593937 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2935  magnesium transporter  32.64 
 
 
457 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1689  magnesium transporter  31.44 
 
 
449 aa  216  5.9999999999999996e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18401  Mg2+ transporter  33.6 
 
 
468 aa  215  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.297681  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10367  Mg2+ transport transmembrane protein mgtE  35.04 
 
 
460 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.54721 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1690  magnesium transporter  32.8 
 
 
452 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0394876 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18221  Mg2+ transporter  33.42 
 
 
468 aa  215  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0138  divalent cation transporter  34.77 
 
 
486 aa  213  3.9999999999999995e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0419  magnesium transporter  31.63 
 
 
455 aa  213  4.9999999999999996e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0051  magnesium transporter  35.51 
 
 
458 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.242688 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2363  magnesium transporter  29.36 
 
 
454 aa  211  2e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1056  magnesium transporter  33.42 
 
 
457 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0801577  hitchhiker  0.0000813528 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3521  magnesium transporter  33.42 
 
 
457 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3300  magnesium transporter  33.42 
 
 
457 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3396  magnesium transporter  33.16 
 
 
457 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  32.79 
 
 
451 aa  209  6e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0412  magnesium transporter  32.74 
 
 
461 aa  208  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2168  magnesium transporter  33.01 
 
 
453 aa  207  5e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.571792  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04510  Mg2+ transporter MgtE  34.44 
 
 
450 aa  206  6e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>