More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1082 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1082  divalent cation transporter  100 
 
 
447 aa  896    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0891  magnesium transporter  56.24 
 
 
449 aa  494  9.999999999999999e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182098 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0714  magnesium transporter  50.67 
 
 
449 aa  462  1e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0824  magnesium transporter  49.77 
 
 
454 aa  460  9.999999999999999e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2786  magnesium transporter  43.61 
 
 
463 aa  385  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1342  divalent cation transporter  42.41 
 
 
447 aa  378  1e-103  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.09733  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0419  magnesium transporter  39.82 
 
 
455 aa  358  9.999999999999999e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2363  magnesium transporter  40.93 
 
 
454 aa  357  1.9999999999999998e-97  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2000  magnesium transporter  43.84 
 
 
454 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6729  magnesium transporter  40.04 
 
 
463 aa  348  1e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143213  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2089  magnesium transporter  40.18 
 
 
460 aa  345  7e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0320  divalent cation transporter  40.09 
 
 
460 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0139413 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1801  divalent cation transporter  39.73 
 
 
460 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2099  magnesium transporter  40.18 
 
 
460 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.168721  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2441  magnesium transporter  40.09 
 
 
460 aa  333  5e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1890  magnesium transporter  38.84 
 
 
460 aa  329  8e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2001  magnesium transporter  41.22 
 
 
447 aa  326  7e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2058  magnesium transporter  38.17 
 
 
460 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1318  magnesium transporter  39.29 
 
 
458 aa  311  1e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1690  magnesium transporter  41.09 
 
 
452 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0394876 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1785  divalent cation transporter  40.76 
 
 
447 aa  307  3e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0914  magnesium transporter  35.98 
 
 
460 aa  305  1.0000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1454  magnesium transporter  38.73 
 
 
447 aa  302  7.000000000000001e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192338  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1269  magnesium transporter  36.85 
 
 
465 aa  301  1e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0779643  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2718  magnesium transporter  34.83 
 
 
452 aa  298  2e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1689  magnesium transporter  34.38 
 
 
449 aa  297  3e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2002  magnesium transporter  36.42 
 
 
458 aa  297  3e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.493999  normal  0.0929187 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0267  magnesium transporter  34.92 
 
 
456 aa  296  7e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000106938  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1691  magnesium transporter  39.95 
 
 
452 aa  295  1e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0276763 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1588  response regulator receiver protein  35.9 
 
 
446 aa  295  2e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0971  magnesium transporter  38.01 
 
 
457 aa  293  3e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1703  magnesium transporter  40.81 
 
 
445 aa  293  5e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3300  magnesium transporter  37.92 
 
 
457 aa  293  6e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2352  magnesium transporter  34.67 
 
 
468 aa  291  1e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.814401  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1669  magnesium transporter  36.26 
 
 
462 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1939  magnesium transporter  33.93 
 
 
444 aa  291  2e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0382273  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01460  Mg2+ transporter MgtE  36.26 
 
 
452 aa  290  3e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2831  magnesium transporter  34.57 
 
 
458 aa  290  4e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1654  response regulator receiver protein  36.63 
 
 
446 aa  290  4e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.399924  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1642  magnesium transporter  36.14 
 
 
462 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1145  magnesium transporter  37.3 
 
 
457 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1056  magnesium transporter  38.15 
 
 
457 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0801577  hitchhiker  0.0000813528 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3521  magnesium transporter  38.15 
 
 
457 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3396  magnesium transporter  38.15 
 
 
457 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3016  magnesium transporter  32.13 
 
 
443 aa  283  5.000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000242012  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0337  MgtE integral membrane region  42.69 
 
 
351 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2935  magnesium transporter  37.47 
 
 
457 aa  280  4e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18221  Mg2+ transporter  37.31 
 
 
468 aa  279  7e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18401  Mg2+ transporter  37.06 
 
 
468 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.297681  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2291  magnesium transporter  34.66 
 
 
449 aa  275  9e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1723  Mg2+ transporter  37.06 
 
 
468 aa  275  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20289  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20831  Mg2+ transporter  37.28 
 
 
469 aa  275  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18191  Mg2+ transporter  36.32 
 
 
469 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1208  Mg2+ transporter  37.28 
 
 
469 aa  273  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2600  magnesium transporter  35.82 
 
 
463 aa  273  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1159  magnesium transporter  35.02 
 
 
450 aa  273  7e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2430  divalent cation transporter  34.22 
 
 
466 aa  271  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2282  magnesium transporter  38.48 
 
 
453 aa  271  2e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0198685  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  35.28 
 
 
450 aa  270  5e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0138  divalent cation transporter  37.59 
 
 
486 aa  269  5.9999999999999995e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0092  magnesium transporter  39.52 
 
 
486 aa  269  5.9999999999999995e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5582  magnesium transporter  36.75 
 
 
444 aa  263  4e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0382  magnesium transporter  32.86 
 
 
454 aa  255  1.0000000000000001e-66  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3944  magnesium transporter  37.35 
 
 
441 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2199  divalent cation transporter  34.78 
 
 
465 aa  253  6e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1523  magnesium transporter  35.36 
 
 
447 aa  253  6e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  34.52 
 
 
442 aa  250  3e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4087  magnesium transporter  36.94 
 
 
441 aa  249  5e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4054  magnesium transporter  36.94 
 
 
441 aa  249  5e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3303  magnesium transporter  33.26 
 
 
461 aa  246  4e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1907  magnesium transporter  35.05 
 
 
445 aa  245  9.999999999999999e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0876  magnesium transporter  35.39 
 
 
465 aa  243  5e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01631  Mg2+ transporter  36.14 
 
 
473 aa  243  5e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0822  magnesium transporter  35.39 
 
 
465 aa  243  5e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1172  divalent cation transporter  33.26 
 
 
450 aa  243  7e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000987618  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4176  magnesium transporter  35.11 
 
 
452 aa  241  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.987951  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3903  magnesium transporter  36.24 
 
 
456 aa  241  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508399  normal  0.721995 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0331  magnesium transporter  32.39 
 
 
458 aa  241  2e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1461  magnesium transporter  32.47 
 
 
463 aa  239  5e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00122115  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  29.25 
 
 
445 aa  239  5e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2728  divalent cation transporter  33.1 
 
 
456 aa  238  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  30.49 
 
 
451 aa  238  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1007  magnesium transporter  33.58 
 
 
461 aa  238  2e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00155557  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3524  magnesium transporter  31.86 
 
 
454 aa  238  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1026  magnesium transporter  33.58 
 
 
461 aa  238  2e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000394015  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02891  magnesium transporter  32.63 
 
 
455 aa  237  4e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17571  Mg2+ transporter  34.3 
 
 
471 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.161452  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2269  magnesium transporter  39.08 
 
 
454 aa  235  1.0000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0532952  hitchhiker  0.0000374811 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2496  magnesium transporter  33.1 
 
 
442 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0589  magnesium transporter  30.53 
 
 
461 aa  232  1e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.124828  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4147  magnesium transporter  30.68 
 
 
454 aa  231  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.235845 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1471  magnesium transporter  32.66 
 
 
449 aa  230  3e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1722  magnesium transporter  34.92 
 
 
462 aa  229  5e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4800  magnesium transporter  32.1 
 
 
456 aa  229  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.832783  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3316  magnesium transporter  35.01 
 
 
473 aa  229  9e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.685446  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0080  magnesium transporter  34.51 
 
 
438 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.136894 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1095  magnesium transporter  33.42 
 
 
457 aa  229  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.20606  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3406  magnesium transporter  32.28 
 
 
447 aa  228  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.200177  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4616  magnesium transporter  33.33 
 
 
456 aa  228  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  decreased coverage  0.00267397 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3240  magnesium transporter  35.11 
 
 
451 aa  228  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0666949 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>