More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3524 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2728  divalent cation transporter  91.41 
 
 		 456 aa  828    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3524  magnesium transporter  100 
 
 		 454 aa  899    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5457  magnesium transporter  64.91 
 
 		 456 aa  592  1e-168  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.169675 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4616  magnesium transporter  65.48 
 
 		 456 aa  591  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  decreased coverage  0.00267397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4800  magnesium transporter  64.59 
 
 		 456 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.832783  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0876  magnesium transporter  63.53 
 
 		 465 aa  573  1.0000000000000001e-162  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0822  magnesium transporter  63.53 
 
 		 465 aa  573  1.0000000000000001e-162  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4147  magnesium transporter  62.86 
 
 		 454 aa  568  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.235845 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3303  magnesium transporter  63.17 
 
 		 461 aa  570  1e-161  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02891  magnesium transporter  63.96 
 
 		 455 aa  556  1e-157  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1095  magnesium transporter  62.27 
 
 		 457 aa  549  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.20606  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3903  magnesium transporter  62.47 
 
 		 456 aa  545  1e-154  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508399  normal  0.721995 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0946  magnesium transporter  61.81 
 
 		 457 aa  543  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0331  magnesium transporter  60.63 
 
 		 458 aa  541  9.999999999999999e-153  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1398  magnesium transport protein  61.11 
 
 		 458 aa  508  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2089  magnesium transporter  44.47 
 
 		 460 aa  369  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1318  magnesium transporter  44.55 
 
 		 458 aa  371  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2786  magnesium transporter  46.84 
 
 		 463 aa  369  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4054  magnesium transporter  50.24 
 
 		 441 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4087  magnesium transporter  50.24 
 
 		 441 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3944  magnesium transporter  50.24 
 
 		 441 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2099  magnesium transporter  42.53 
 
 		 460 aa  350  4e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.168721  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1801  divalent cation transporter  42.44 
 
 		 460 aa  348  1e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1890  magnesium transporter  43.89 
 
 		 460 aa  347  3e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0320  divalent cation transporter  43.15 
 
 		 460 aa  343  4e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0139413 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0080  magnesium transporter  49.59 
 
 		 438 aa  338  9e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.136894 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0914  magnesium transporter  44.9 
 
 		 460 aa  337  1.9999999999999998e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2058  magnesium transporter  43.79 
 
 		 460 aa  336  5e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2441  magnesium transporter  42.66 
 
 		 460 aa  332  6e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2002  magnesium transporter  42.5 
 
 		 458 aa  330  4e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.493999  normal  0.0929187 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6729  magnesium transporter  41.53 
 
 		 463 aa  326  6e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1939  magnesium transporter  31 
 
 		 444 aa  258  1e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0382273  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2520  magnesium transporter  36.26 
 
 		 454 aa  253  5.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624288 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2291  magnesium transporter  32.43 
 
 		 449 aa  248  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2879  magnesium transporter  36.24 
 
 		 451 aa  247  2e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2600  magnesium transporter  36.55 
 
 		 463 aa  247  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2718  magnesium transporter  31.18 
 
 		 452 aa  246  8e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3016  magnesium transporter  31.38 
 
 		 443 aa  244  3e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000242012  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2352  magnesium transporter  35.87 
 
 		 468 aa  244  3e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.814401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0267  magnesium transporter  31.19 
 
 		 456 aa  243  6e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000106938  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2430  divalent cation transporter  35.36 
 
 		 466 aa  240  4e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30070  Mg2+ transporter MgtE  34.04 
 
 		 461 aa  240  4e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1588  response regulator receiver protein  31.11 
 
 		 446 aa  239  8e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1642  magnesium transporter  38.54 
 
 		 462 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1703  magnesium transporter  35.66 
 
 		 445 aa  238  2e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2282  magnesium transporter  34.36 
 
 		 453 aa  238  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0198685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1669  magnesium transporter  38.54 
 
 		 462 aa  237  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01460  Mg2+ transporter MgtE  33.58 
 
 		 452 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1269  magnesium transporter  35.8 
 
 		 465 aa  233  5e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0779643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1785  divalent cation transporter  34.04 
 
 		 447 aa  231  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1461  magnesium transporter  33.87 
 
 		 463 aa  231  2e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00122115  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  30.89 
 
 		 442 aa  231  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  35.54 
 
 		 450 aa  230  5e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0891  magnesium transporter  33.78 
 
 		 449 aa  230  5e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182098 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0507  hypothetical protein  31.03 
 
 		 463 aa  229  6e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.593937 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1654  response regulator receiver protein  32.27 
 
 		 446 aa  229  7e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.399924  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1159  magnesium transporter  33.18 
 
 		 450 aa  228  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  33.33 
 
 		 473 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1082  divalent cation transporter  35.84 
 
 		 447 aa  228  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  32.19 
 
 		 451 aa  226  8e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2000  magnesium transporter  39.52 
 
 		 454 aa  226  8e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0714  magnesium transporter  35.75 
 
 		 449 aa  226  9e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0589  magnesium transporter  35.12 
 
 		 461 aa  224  2e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.124828  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1007  magnesium transporter  34.69 
 
 		 461 aa  224  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00155557  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1689  magnesium transporter  31.89 
 
 		 449 aa  224  2e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1342  divalent cation transporter  30.28 
 
 		 447 aa  225  2e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.09733  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2001  magnesium transporter  34.13 
 
 		 447 aa  225  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1026  magnesium transporter  34.69 
 
 		 461 aa  224  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000394015  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20831  Mg2+ transporter  33.76 
 
 		 469 aa  223  8e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1208  Mg2+ transporter  33.76 
 
 		 469 aa  222  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0824  magnesium transporter  32.41 
 
 		 454 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1454  magnesium transporter  31.31 
 
 		 447 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192338  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0337  MgtE integral membrane region  38.18 
 
 		 351 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18191  Mg2+ transporter  36.07 
 
 		 469 aa  219  8.999999999999998e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6844  magnesium transporter  36.81 
 
 		 454 aa  218  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.724655 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2831  magnesium transporter  30.65 
 
 		 458 aa  217  2.9999999999999998e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0382  magnesium transporter  28.89 
 
 		 454 aa  216  7e-55  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  29.7 
 
 		 445 aa  216  7e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0971  magnesium transporter  31.38 
 
 		 457 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2269  magnesium transporter  33.78 
 
 		 454 aa  214  2.9999999999999995e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0532952  hitchhiker  0.0000374811 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2935  magnesium transporter  32.47 
 
 		 457 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1691  magnesium transporter  30.56 
 
 		 452 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0276763 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18401  Mg2+ transporter  35.54 
 
 		 468 aa  213  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.297681  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04510  Mg2+ transporter MgtE  33.78 
 
 		 450 aa  212  1e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10367  Mg2+ transport transmembrane protein mgtE  35.89 
 
 		 460 aa  212  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.54721 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2496  magnesium transporter  31.18 
 
 		 442 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1145  magnesium transporter  31.38 
 
 		 457 aa  211  3e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18221  Mg2+ transporter  35.37 
 
 		 468 aa  211  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1995  divalent cation transporter  32.16 
 
 		 476 aa  210  5e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3396  magnesium transporter  32.21 
 
 		 457 aa  209  7e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3300  magnesium transporter  30.28 
 
 		 457 aa  209  7e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1056  magnesium transporter  32.47 
 
 		 457 aa  209  7e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0801577  hitchhiker  0.0000813528 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3521  magnesium transporter  32.47 
 
 		 457 aa  209  7e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0412  magnesium transporter  32.43 
 
 		 461 aa  209  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0419  magnesium transporter  30.11 
 
 		 455 aa  208  2e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  30.93 
 
 		 473 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1723  Mg2+ transporter  35.01 
 
 		 468 aa  208  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20289  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1523  magnesium transporter  32.73 
 
 		 447 aa  208  2e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0051  magnesium transporter  34.81 
 
 		 458 aa  207  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242688 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0809  magnesium transporter  31.31 
 
 		 542 aa  206  8e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>