202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0711 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0711  malate/L-lactate dehydrogenase  100 
 
 		 355 aa  717    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.707221  normal  0.854883 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1601  Malate/L-lactate dehydrogenase  45.98 
 
 		 354 aa  299  4e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1632  Malate/L-lactate dehydrogenase  46.96 
 
 		 353 aa  297  2e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000326891  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1845  Malate/L-lactate dehydrogenase  44.06 
 
 		 355 aa  281  9e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.957462  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2132  Malate/L-lactate dehydrogenase  43.48 
 
 		 355 aa  278  1e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2010  hypothetical protein  43.87 
 
 		 362 aa  268  8e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal  0.0216387 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5277  hypothetical protein  42.27 
 
 		 368 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0968359  normal  0.077183 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4341  hypothetical protein  44.8 
 
 		 369 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000479473 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3456  hypothetical protein  44.16 
 
 		 369 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0477339  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4910  hypothetical protein  44.16 
 
 		 369 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.656536 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0869  hypothetical protein  41.19 
 
 		 361 aa  255  8e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00768  predicted dehydrogenase  40.91 
 
 		 361 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2841  Malate/L-lactate dehydrogenase  40.91 
 
 		 361 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2842  hypothetical protein  40.91 
 
 		 361 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0746 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2551  hypothetical protein  40.74 
 
 		 361 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00785  hypothetical protein  40.91 
 
 		 361 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0856  hypothetical protein  40.91 
 
 		 361 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0825  hypothetical protein  41.03 
 
 		 361 aa  253  3e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5376  hypothetical protein  44.29 
 
 		 369 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0371225  normal  0.0812786 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4858  hypothetical protein  44.22 
 
 		 369 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.256767  hitchhiker  0.00905193 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0950  hypothetical protein  40.74 
 
 		 361 aa  252  6e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5456  hypothetical protein  43.64 
 
 		 367 aa  250  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3704  hypothetical protein  45.11 
 
 		 369 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.305057  normal  0.776569 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0783  hypothetical protein  43.91 
 
 		 369 aa  247  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256957  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3968  hypothetical protein  45.24 
 
 		 364 aa  246  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0782  hypothetical protein  45.27 
 
 		 353 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0559  malate/L-lactate dehydrogenase  41.97 
 
 		 350 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1400  Malate/L-lactate dehydrogenase  42.95 
 
 		 362 aa  235  7e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.468081  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1798  Malate/L-lactate dehydrogenase  42.32 
 
 		 340 aa  231  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1498  hypothetical protein  40.23 
 
 		 364 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1634  hypothetical protein  40.23 
 
 		 364 aa  230  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.849275  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6588  Malate/L-lactate dehydrogenase  42.14 
 
 		 378 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6488  malate/L-lactate dehydrogenase  41.12 
 
 		 358 aa  223  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.542487 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1300  Malate/L-lactate dehydrogenase  39.58 
 
 		 340 aa  219  7.999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3061  malate/L-lactate dehydrogenase  40.68 
 
 		 356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1530  hypothetical protein  41.55 
 
 		 352 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1356  Malate/L-lactate dehydrogenase  36.15 
 
 		 353 aa  208  1e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.989483  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4277  Malate/L-lactate dehydrogenase  38.18 
 
 		 361 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.073979  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3587  malate/L-lactate dehydrogenase  38.38 
 
 		 366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.787615  normal  0.77685 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1710  malate/L-lactate dehydrogenase  38.4 
 
 		 361 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.376273 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1699  malate/L-lactate dehydrogenase  36.41 
 
 		 361 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2943  hypothetical protein  35.11 
 
 		 361 aa  197  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.80898 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1065  malate/L-lactate dehydrogenase  34.38 
 
 		 375 aa  160  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333452  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3620  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.8 
 
 		 353 aa  158  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.988077  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3789  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.14 
 
 		 732 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1015  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  31.71 
 
 		 345 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.759663  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21420  Malate/L-lactate dehydrogenase  35.08 
 
 		 372 aa  153  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0455  malate/L-lactate dehydrogenase  30.97 
 
 		 345 aa  150  3e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5655  malate/L-lactate dehydrogenase  32.85 
 
 		 349 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.64858 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2541  malate/L-lactate dehydrogenase  34.06 
 
 		 349 aa  149  6e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3719  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  32.27 
 
 		 349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4649  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  32.27 
 
 		 349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5908  malate/L-lactate dehydrogenase  33.54 
 
 		 348 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767932  normal  0.259263 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5737  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.33 
 
 		 367 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.719553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0410  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.39 
 
 		 383 aa  146  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2563  Malate dehydrogenase  33.03 
 
 		 336 aa  145  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0709444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0385  malate/L-lactate dehydrogenase  30 
 
 		 347 aa  145  1e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.214984 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0235  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.22 
 
 		 355 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752224  normal  0.0613067 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2546  dehydrogenase  31.73 
 
 		 351 aa  143  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.637789  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1029  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.92 
 
 		 364 aa  142  8e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3527  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.69 
 
 		 361 aa  141  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1965  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.58 
 
 		 349 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4412  Malate dehydrogenase  30.09 
 
 		 351 aa  140  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0451  L-sulfolactate dehydrogenase / malate dehydrogenase (NAD)  30.21 
 
 		 347 aa  140  3e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1534  malate/L-lactate dehydrogenase  29.12 
 
 		 347 aa  139  7e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.975187  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0042  malate/L-lactate dehydrogenase  30.52 
 
 		 349 aa  139  8.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3327  ureidoglycolate dehydrogenase  33.03 
 
 		 335 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.388816 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3319  ureidoglycolate dehydrogenase  33.03 
 
 		 335 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.910608 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3243  ureidoglycolate dehydrogenase  33.03 
 
 		 335 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5261  malate/L-lactate dehydrogenase  34.69 
 
 		 334 aa  138  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.85901 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6875  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.28 
 
 		 357 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.366765 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5343  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.44 
 
 		 353 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218988 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3972  malate/L-lactate dehydrogenase  30.14 
 
 		 353 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.901224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1771  malate dehydrogenase (NADP+)  33.64 
 
 		 333 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07633  malate/L-lactate dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13810)  28.77 
 
 		 361 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.571482 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3020  malate/L-lactate dehydrogenase  31.69 
 
 		 348 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4538  malate/L-lactate dehydrogenase  30.92 
 
 		 354 aa  133  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5012  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.73 
 
 		 359 aa  133  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0320  malate dehydrogenase (NAD)  30.81 
 
 		 381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3707  Malate/L-lactate dehydrogenase  36.13 
 
 		 329 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717788  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3548  malate/L-lactate dehydrogenase  31.48 
 
 		 358 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.0039901  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2393  malate/L-lactate dehydrogenase  30.31 
 
 		 354 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0600  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.25 
 
 		 364 aa  130  3e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0715  malate/L-lactate dehydrogenase  28.85 
 
 		 358 aa  130  4.0000000000000003e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0248674  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3531  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  30.64 
 
 		 338 aa  129  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3965  malate/L-lactate dehydrogenase  30.85 
 
 		 354 aa  129  8.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6157  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.62 
 
 		 355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.260295  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4997  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  33.23 
 
 		 344 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2567  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  30.88 
 
 		 343 aa  126  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0241  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  32.74 
 
 		 345 aa  126  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16820  malate dehydrogenase (NAD)  27.86 
 
 		 376 aa  125  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0558  L-sulfolactate dehydrogenase  29.83 
 
 		 365 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.899943  normal  0.297521 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2181  malate/L-lactate dehydrogenase  33.57 
 
 		 341 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2039  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  35.53 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308465  normal  0.10893 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5412  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.8 
 
 		 351 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.584123  hitchhiker  0.00277603 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2143  malate/L-lactate dehydrogenase  29.48 
 
 		 343 aa  123  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1995  Malate/L-lactate dehydrogenase  35.35 
 
 		 356 aa  123  6e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1791  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.56 
 
 		 334 aa  123  6e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4123  malate dehydrogenase (NAD)  30.14 
 
 		 362 aa  122  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3591  malate/L-lactate dehydrogenase  33.21 
 
 		 332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.127948  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>