63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0159 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0159  hypothetical protein  100 
 
 
283 aa  578  1e-164  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.233345  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1239  hypothetical protein  54.74 
 
 
285 aa  318  5e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3103  hypothetical protein  46.67 
 
 
282 aa  253  3e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.716933  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1844  hypothetical protein  43.27 
 
 
295 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2716  hypothetical protein  40.91 
 
 
298 aa  245  6e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00189563 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1529  hypothetical protein  42.91 
 
 
295 aa  241  7.999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0455905 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1356  hypothetical protein  40.28 
 
 
298 aa  241  1e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1284  hypothetical protein  40.99 
 
 
301 aa  241  1e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.218684 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0679  hypothetical protein  44.56 
 
 
287 aa  239  4e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11701  normal  0.340076 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0195  hypothetical protein  42.4 
 
 
287 aa  237  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.342058  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2085  hypothetical protein  43.21 
 
 
302 aa  236  3e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.069658 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3737  hypothetical protein  43.68 
 
 
290 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2987  hypothetical protein  45.3 
 
 
294 aa  235  6e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.387576  normal  0.124084 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2176  hypothetical protein  41.76 
 
 
289 aa  223  3e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00706566  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0282  hypothetical protein  36.73 
 
 
283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0988  hypothetical protein  36.52 
 
 
301 aa  195  9e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2604  hypothetical protein  36.24 
 
 
300 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2742  hypothetical protein  36.24 
 
 
300 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3042  hypothetical protein  35.89 
 
 
300 aa  192  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.384395 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4196  transcriptional regulator  34.93 
 
 
298 aa  183  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6538  hypothetical protein  39.51 
 
 
268 aa  182  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4605  hypothetical protein  34.16 
 
 
294 aa  178  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2091  hypothetical protein  33.58 
 
 
276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4284  hypothetical protein  33.93 
 
 
289 aa  170  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4623  transcriptional regulator-like protein  31.6 
 
 
291 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2844  decreased coverage  0.00000000441914 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2063  transcriptional regulator  31.12 
 
 
290 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.754064  normal  0.900722 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2478  hypothetical protein  31.43 
 
 
285 aa  154  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.452915  normal  0.259065 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4760  transcriptional regulator  31.25 
 
 
291 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2419  hypothetical protein  34.1 
 
 
299 aa  142  9e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.79837  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2196  hypothetical protein  30.71 
 
 
296 aa  141  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00000000497244  hitchhiker  0.00000469474 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1370  hypothetical protein  30.04 
 
 
286 aa  140  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00864  predicted transcriptional regulator i A1501  29.07 
 
 
278 aa  137  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0122  hypothetical protein  32.82 
 
 
312 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003231  hypothetical protein  30.04 
 
 
284 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2014  hypothetical protein  30.69 
 
 
302 aa  134  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01687  hypothetical protein  29.93 
 
 
284 aa  133  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2465  hypothetical protein  27.97 
 
 
298 aa  132  5e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.107107  normal  0.276307 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0660  hypothetical protein  29.14 
 
 
301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.125949  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0913  hypothetical protein  31.6 
 
 
279 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3596  hypothetical protein  30.77 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01226  hypothetical protein  31.64 
 
 
295 aa  127  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3550  hypothetical protein  28.68 
 
 
275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.103965 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0111  hypothetical protein  29.92 
 
 
326 aa  124  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0550  transcriptional regulator  30.55 
 
 
292 aa  123  3e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2094  hypothetical protein  28.16 
 
 
303 aa  122  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100358 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1442  hypothetical protein  28.52 
 
 
304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.37014  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0419  hypothetical protein  30.94 
 
 
294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1262  hypothetical protein  26.74 
 
 
287 aa  120  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0112  hypothetical protein  29.31 
 
 
304 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6931  hypothetical protein  30.5 
 
 
313 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4208  hypothetical protein  31.85 
 
 
302 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0455716 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2674  hypothetical protein  29.55 
 
 
290 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00152058  normal  0.0371695 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1781  hypothetical protein  27.92 
 
 
293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.294731 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2028  hypothetical protein  28.79 
 
 
290 aa  112  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000322678  normal  0.839611 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0289  hypothetical protein  30.59 
 
 
295 aa  112  8.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3177  hypothetical protein  30.4 
 
 
305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2140  hypothetical protein  27.65 
 
 
290 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000023466  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4812  hypothetical protein  31.02 
 
 
297 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3185  transcriptional regulator-like  28.5 
 
 
254 aa  86.3  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6051  hypothetical protein  29.75 
 
 
280 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2190  hypothetical protein  23.67 
 
 
297 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.315226  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04050  hypothetical protein  28.21 
 
 
122 aa  57  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.280957  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  35.29 
 
 
339 aa  42.4  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>