More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_09740 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_09740  single stranded DNA-binding protein  100 
 
 
183 aa  358  2e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2173  single-strand binding protein  42.25 
 
 
184 aa  119  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000827333 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2420  single-strand binding protein  44.44 
 
 
192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0230059  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08890  single stranded DNA-binding protein  44.8 
 
 
178 aa  99.4  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.193976  normal  0.0417 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1368  single-strand binding protein  36.23 
 
 
185 aa  90.1  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1327  single-strand binding protein  39.5 
 
 
191 aa  89.4  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1145  single-stranded DNA-binding protein  40 
 
 
225 aa  88.6  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00600272  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7360  Single-stranded DNA-binding protein-like protein  36.67 
 
 
233 aa  87  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24720  single stranded DNA-binding protein  38.94 
 
 
211 aa  85.5  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.0081931  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4119  single-strand binding protein  37.5 
 
 
192 aa  84.7  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  37.07 
 
 
163 aa  84  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3890  single-strand binding protein  38.79 
 
 
193 aa  84  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0415536 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4663  single-strand binding protein  37.82 
 
 
188 aa  83.6  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  37.82 
 
 
168 aa  83.6  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  36.44 
 
 
167 aa  82.8  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5321  single-stranded DNA-binding protein  36.57 
 
 
305 aa  82.4  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1620  single-strand binding protein  40.5 
 
 
179 aa  82.4  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.777207  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  37.29 
 
 
165 aa  82  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4638  single-strand binding protein  38.66 
 
 
300 aa  81.6  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4555  single-strand binding protein  36.44 
 
 
169 aa  81.6  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184905  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3020  single-strand binding protein  36.07 
 
 
174 aa  81.3  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666273  normal  0.0842744 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23250  single stranded DNA-binding protein  42.15 
 
 
200 aa  80.9  0.000000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5067  single-strand binding protein  36.13 
 
 
159 aa  80.9  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385678  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4168  single-strand binding protein  39.32 
 
 
177 aa  80.9  0.000000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26580  single-strand binding protein  36.44 
 
 
189 aa  80.9  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.195402 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  38.79 
 
 
195 aa  79.7  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39400  single-strand binding protein  38.1 
 
 
156 aa  79  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37800  single-strand binding protein  39.32 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172031  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3094  single-stranded DNA-binding protein  41.88 
 
 
182 aa  79  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0250576  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0875  single-stranded DNA-binding protein  35.59 
 
 
170 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1521  single-strand binding protein  39.2 
 
 
165 aa  79  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.232258  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2524  single-strand binding protein  39.32 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4521  single-stranded DNA-binding protein  36.97 
 
 
186 aa  78.6  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229293  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4180  single-strand binding protein  40.17 
 
 
182 aa  78.2  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3354  single-strand binding protein  39.67 
 
 
189 aa  78.2  0.00000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0336  single-strand binding protein  36.97 
 
 
219 aa  78.2  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.676311 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4338  single-strand binding protein  34.45 
 
 
198 aa  77.8  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  37.41 
 
 
153 aa  77  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3699  single-strand binding protein  39.66 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1351  single-strand binding protein  38.81 
 
 
187 aa  76.6  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0852946  hitchhiker  0.0000589193 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4948  single-strand binding protein  39.32 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  36.27 
 
 
181 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  35.09 
 
 
164 aa  74.7  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4739  single-strand binding protein  37.93 
 
 
173 aa  75.1  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0304  single-stranded DNA-binding protein  36.63 
 
 
185 aa  75.1  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  0.895882 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  37.25 
 
 
181 aa  74.7  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3560  single-strand binding protein  37.82 
 
 
171 aa  74.7  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0277  single-stranded DNA-binding protein  36.63 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  37.5 
 
 
190 aa  74.7  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3556  single-strand binding protein  39.66 
 
 
230 aa  74.7  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2558  single-strand binding protein  32.26 
 
 
190 aa  74.7  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.752776 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31770  single-strand binding protein  35.34 
 
 
178 aa  74.3  0.0000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2821  single-strand binding protein  34.19 
 
 
166 aa  74.7  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000844466  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  35.04 
 
 
148 aa  74.3  0.0000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  36.28 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  36.28 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5745  single-stranded DNA-binding protein  36.28 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5049  single-strand binding protein  36.11 
 
 
171 aa  73.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  33.75 
 
 
165 aa  73.9  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5019  single-strand binding protein  35.64 
 
 
130 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0663797  normal 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5424  single-strand binding protein  35.64 
 
 
130 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5215  single-stranded DNA-binding protein  35.64 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0422  single-stranded DNA-binding protein  36.63 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1550  single-stranded DNA-binding protein  35.64 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202411  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4668  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  36.84 
 
 
118 aa  73.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0382232  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0928  single-strand binding protein  34.17 
 
 
167 aa  72.4  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1088  single-strand binding protein  37.4 
 
 
198 aa  72  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.651854  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9356  single-stranded DNA-binding protein  36.21 
 
 
191 aa  72.4  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  37.86 
 
 
151 aa  72  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  37.86 
 
 
151 aa  72  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6033  single-stranded DNA-binding protein  35.9 
 
 
170 aa  71.2  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  40.38 
 
 
171 aa  70.9  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  33.61 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1076  single-strand binding family protein  26.42 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0483  single-strand binding protein  42.86 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0341  single-stranded DNA-binding protein  35.58 
 
 
172 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0051  single-stranded DNA-binding protein  28.19 
 
 
175 aa  68.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.772758  normal  0.0108774 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1218  single-stranded DNA-binding protein  35.96 
 
 
218 aa  68.9  0.00000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7361  single-strand binding protein  31.52 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.901267  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19560  single stranded DNA-binding protein  30.63 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0239193  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0611  single-stranded DNA-binding protein  35.58 
 
 
179 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0353597 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  33.08 
 
 
172 aa  68.2  0.00000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4106  single-stranded DNA-binding protein  35.58 
 
 
177 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  30.47 
 
 
188 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 
186 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3093  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 
199 aa  67  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0781  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 
185 aa  67  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3876  single-strand binding protein  28.36 
 
 
162 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.611448  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0930  single-strand binding protein  35.4 
 
 
177 aa  67  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2643  single-strand binding protein  36.75 
 
 
173 aa  67  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.554684 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4232  single-strand binding protein  37.5 
 
 
179 aa  67.4  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000994037  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0061  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 
196 aa  67  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 
192 aa  67  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  32.35 
 
 
184 aa  67  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 
179 aa  67  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 
184 aa  67  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2957  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 
192 aa  67  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602343  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0056  single-stranded DNA-binding protein  27.38 
 
 
175 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.564154 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6107  single-stranded DNA-binding protein  32.35 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.603331 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>