More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2321 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0652  efflux ABC transporter ATP-binding protein  57.21 
 
 		 599 aa  721    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0177211  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2321  ABC transporter related  100 
 
 		 625 aa  1261    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100334 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0759  ABC transporter related  40.37 
 
 		 600 aa  462  1e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.165063  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0788  ABC transporter related  40.5 
 
 		 600 aa  423  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2355  ABC transporter related  41.26 
 
 		 603 aa  417  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.916251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1562  ABC transporter related  39.8 
 
 		 605 aa  412  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.36588  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0617  ABC transporter related protein  40.75 
 
 		 611 aa  414  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.10554  normal  0.226298 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2356  ABC transporter related  39.83 
 
 		 583 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2527  ABC transporter related protein  41.58 
 
 		 599 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0489223 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0122  ABC transporter related  38.77 
 
 		 628 aa  389  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2847  ABC transporter related  40.87 
 
 		 586 aa  387  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.682439 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2624  ABC transporter related  40 
 
 		 596 aa  387  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2654  ABC transporter related  39.78 
 
 		 596 aa  373  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29930  ABC transporter protein  39.21 
 
 		 613 aa  373  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0292656  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5187  ABC transporter related  38.26 
 
 		 585 aa  364  3e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1312  ATPase  36.7 
 
 		 600 aa  356  5.999999999999999e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0373  ABC transporter-related protein  34.97 
 
 		 594 aa  354  2e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.257292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4465  ABC transporter related  41.39 
 
 		 585 aa  341  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269199 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2068  ABC transporter related  38.77 
 
 		 583 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561392  normal  0.0697813 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3900  ABC transporter related  36.41 
 
 		 568 aa  339  9.999999999999999e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0523  ABC transporter related  33.87 
 
 		 571 aa  332  1e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1383  ATPase  34.49 
 
 		 614 aa  330  3e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.267423 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2172  ABC transporter related  32.25 
 
 		 610 aa  294  4e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14091  hypothetical protein  30.03 
 
 		 599 aa  280  7e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0898  phospholipid-lipopolysaccharide ABC transporter  31.05 
 
 		 601 aa  280  7e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1117  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.7 
 
 		 601 aa  275  1.0000000000000001e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3896  ABC transporter related  34.69 
 
 		 626 aa  275  2.0000000000000002e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.227189  normal  0.0393821 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0591  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.41 
 
 		 564 aa  274  3e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.234027  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1250  ABC transporter, ATP-binding protein/permease, glycan transport  26.94 
 
 		 564 aa  273  5.000000000000001e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1332  ATPase  29.45 
 
 		 576 aa  272  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00148661  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14231  hypothetical protein  27.07 
 
 		 586 aa  266  5.999999999999999e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1411  ATPase  30.82 
 
 		 611 aa  264  4e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01101  hypothetical protein  30.82 
 
 		 611 aa  263  6e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1147  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.28 
 
 		 564 aa  263  1e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1272  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.93 
 
 		 564 aa  259  9e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00581  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  29.6 
 
 		 610 aa  258  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.779768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0168  ATPase  32.46 
 
 		 612 aa  252  1e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.334889  normal  0.167658 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0198  ATPase  32.2 
 
 		 613 aa  251  2e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.312948  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01541  hypothetical protein  28.08 
 
 		 552 aa  248  3e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.29572  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08650  ABC-type bacteriocin/lantibiotic exporter with N-terminal double-glycine peptidase domain  31.02 
 
 		 606 aa  246  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25671  putative ABC transporter  32.6 
 
 		 605 aa  244  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3381  ABC transporter related  30.53 
 
 		 599 aa  244  5e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0477637  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0410  ABC transporter related  29.7 
 
 		 610 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14501  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  28.49 
 
 		 586 aa  235  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3270  ABC transporter related  30.38 
 
 		 594 aa  231  4e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.255104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3273  ABC transporter related  27.78 
 
 		 607 aa  225  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2309  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.45 
 
 		 582 aa  224  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.928794  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2208  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.45 
 
 		 582 aa  223  6e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1433  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.57 
 
 		 582 aa  222  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.855683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1769  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.65 
 
 		 597 aa  219  7.999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.631617  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00918  fused lipid transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  30.34 
 
 		 582 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.409137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2729  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.34 
 
 		 582 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1012  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.34 
 
 		 582 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00350049  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00925  hypothetical protein  30.34 
 
 		 582 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433065  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2206  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.34 
 
 		 582 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0719842  normal  0.317534 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.34 
 
 		 582 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0261521  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1075  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.34 
 
 		 582 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2410  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.34 
 
 		 582 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2682  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.34 
 
 		 582 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.316458 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2199  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  29.39 
 
 		 600 aa  217  4e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1454  ABC transporter related  29.3 
 
 		 600 aa  217  5e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3683  ATPase  30.71 
 
 		 603 aa  217  5e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1017  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.18 
 
 		 582 aa  216  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.71873 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0990  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.18 
 
 		 582 aa  216  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.796284  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1049  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.18 
 
 		 582 aa  216  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.183717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1082  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.18 
 
 		 582 aa  216  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123674  normal  0.113361 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1098  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.18 
 
 		 582 aa  216  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01535  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.23 
 
 		 583 aa  215  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  31.2 
 
 		 618 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2971  hypothetical protein  28.38 
 
 		 610 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.570189  normal  0.54511 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2041  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.62 
 
 		 582 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2388  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.1 
 
 		 600 aa  213  7e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.496768  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0900  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.86 
 
 		 583 aa  212  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0510675  normal  0.909726 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0310  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.83 
 
 		 592 aa  213  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003987  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  29.62 
 
 		 582 aa  212  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1128  ABC transporter related protein  34.84 
 
 		 613 aa  212  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2577  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.1 
 
 		 582 aa  211  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.436168  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2665  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.1 
 
 		 582 aa  211  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789085  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1959  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.1 
 
 		 582 aa  211  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278742  normal  0.389818 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1712  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.36 
 
 		 582 aa  208  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1337  ABC transporter, ATP-binding protein MsbA  29.23 
 
 		 599 aa  206  7e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.870575 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  29.23 
 
 		 636 aa  205  2e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  29.59 
 
 		 588 aa  205  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2917  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.98 
 
 		 576 aa  205  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12894 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2121  ABC transporter related  29.49 
 
 		 592 aa  205  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0469837  normal  0.034956 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1469  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.55 
 
 		 582 aa  203  6e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.09 
 
 		 600 aa  203  7e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  26.81 
 
 		 717 aa  202  1.9999999999999998e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0152  ABC transporter related protein  29.04 
 
 		 602 aa  202  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1296  ABC transporter related  28.14 
 
 		 730 aa  202  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3782  ABC transporter related  27.74 
 
 		 676 aa  201  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253912  normal  0.646389 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2584  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.15 
 
 		 600 aa  201  3e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.544743  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0387  ABC transporter-related protein  30.58 
 
 		 634 aa  199  7.999999999999999e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.112413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1963  ABC transporter related  32.78 
 
 		 616 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.220325  normal  0.545041 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2803  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.2 
 
 		 589 aa  199  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0558  ABC transporter related  30.48 
 
 		 725 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1218  ABC transporter related  33.62 
 
 		 618 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0802888  normal  0.120203 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  32.62 
 
 		 705 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.65 
 
 		 632 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  28.6 
 
 		 638 aa  197  5.000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>